RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282074.6

SPC25-201, Transcript of SPC25, NDC80 kinetochore complex component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPC25, Length 1,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC25-201ENST00000282074 CASC2Q6XLA1 102 aa6.31□□□□□ -1.4
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SPC25-201ENST00000282074 C4orf26Q17RF5 130 aa6.28□□□□□ -1.4
SPC25-201ENST00000282074 V9GYY9 64 aa6.28□□□□□ -1.4
SPC25-201ENST00000282074 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
SPC25-201ENST00000282074 Q1T7F1 81 aa6.26□□□□□ -1.41
SPC25-201ENST00000282074 C1orf195Q5TG92 126 aa6.26□□□□□ -1.41
SPC25-201ENST00000282074 PRO0628Q9UI54 55 aa6.25□□□□□ -1.41
SPC25-201ENST00000282074 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa6.24□□□□□ -1.41
SPC25-201ENST00000282074 H0Y9P7 68 aa6.23□□□□□ -1.41
SPC25-201ENST00000282074 WFDC13Q8IUB5 93 aa6.23□□□□□ -1.41
SPC25-201ENST00000282074 Q96NJ1 140 aa6.22□□□□□ -1.41
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SPC25-201ENST00000282074 C1orf64Q8NEQ6 169 aa6.21□□□□□ -1.41
SPC25-201ENST00000282074 LINC00208Q96KT6 92 aa6.2□□□□□ -1.42
SPC25-201ENST00000282074 A0A1B0GVX0 72 aa6.19□□□□□ -1.42
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SPC25-201ENST00000282074 C8orf17Q9NRJ1 99 aa6.18□□□□□ -1.42
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SPC25-201ENST00000282074 COA5Q86WW8 74 aa6.03□□□□□ -1.44
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SPC25-201ENST00000282074 Q5VV11 94 aa5.97□□□□□ -1.45
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SPC25-201ENST00000282074 A8MUN3 132 aa5.94□□□□□ -1.46
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SPC25-201ENST00000282074 PSPHP1O15172 72 aa5.93□□□□□ -1.46
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SPC25-201ENST00000282074 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa5.93□□□□□ -1.46
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SPC25-201ENST00000282074 PRR15LQ9BU68 103 aa5.91□□□□□ -1.46
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SPC25-201ENST00000282074 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa5.89□□□□□ -1.47
SPC25-201ENST00000282074 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa5.89□□□□□ -1.47
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SPC25-201ENST00000282074 MUC12Q9UKN1 5478 aa5.83□□□□□ -1.48
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SPC25-201ENST00000282074 SPTSSBQ8NFR3 76 aa5.74□□□□□ -1.49
SPC25-201ENST00000282074 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa5.74□□□□□ -1.49
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SPC25-201ENST00000282074 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa5.71□□□□□ -1.5
SPC25-201ENST00000282074 A6NN06 94 aa5.7□□□□□ -1.5
SPC25-201ENST00000282074 SPATA8Q6RVD6 105 aa5.68□□□□□ -1.5
SPC25-201ENST00000282074 SPINK7P58062 85 aa5.67□□□□□ -1.5
SPC25-201ENST00000282074 UQCR11O14957 56 aa5.67□□□□□ -1.5
SPC25-201ENST00000282074 MDN1Q9NU22 5596 aa5.62□□□□□ -1.51
SPC25-201ENST00000282074 SEC61GP60059 68 aa5.62□□□□□ -1.51
SPC25-201ENST00000282074 A8MU10 97 aa5.61□□□□□ -1.51
SPC25-201ENST00000282074 MIR22HGQ0VDD5 57 aa5.59□□□□□ -1.51
SPC25-201ENST00000282074 KMT2DO14686 5537 aa5.59□□□□□ -1.52
SPC25-201ENST00000282074 KRTAP5-9P26371 169 aa5.55□□□□□ -1.52
SPC25-201ENST00000282074 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa5.54□□□□□ -1.52
SPC25-201ENST00000282074 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa5.54□□□□□ -1.52
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SPC25-201ENST00000282074 KRTAP10-5P60370 271 aa5.43□□□□□ -1.54
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SPC25-201ENST00000282074 A0A1B0GU33 70 aa5.42□□□□□ -1.54
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SPC25-201ENST00000282074 K7ERS5 55 aa5.35□□□□□ -1.55
SPC25-201ENST00000282074 SPRR2GQ9BYE4 73 aa5.35□□□□□ -1.55
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SPC25-201ENST00000282074 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.34□□□□□ -1.55
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SPC25-201ENST00000282074 LINC01554Q52M75 96 aa5.26□□□□□ -1.57
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SPC25-201ENST00000282074 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa5.23□□□□□ -1.57
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SPC25-201ENST00000282074 PRAC1Q96KF2 57 aa5.21□□□□□ -1.58
SPC25-201ENST00000282074 ADM2Q7Z4H4 148 aa5.18□□□□□ -1.58
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