RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 RETNLBQ9BQ08 111 aa14.6□□□□□ -0.07
CAPNS1-201ENST00000246533 UQCR11O14957 56 aa14.58□□□□□ -0.08
CAPNS1-201ENST00000246533 C4orf48Q5BLP8 95 aa14.54□□□□□ -0.08
CAPNS1-201ENST00000246533 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa14.53□□□□□ -0.08
CAPNS1-201ENST00000246533 MIR22HGQ0VDD5 57 aa14.51□□□□□ -0.09
CAPNS1-201ENST00000246533 SPINK1P00995 79 aa14.48□□□□□ -0.09
CAPNS1-201ENST00000246533 RPS29P62273 56 aaKnown RBP14.38□□□□□ -0.11
CAPNS1-201ENST00000246533 RNF213Q63HN8 5207 aa14.31□□□□□ -0.12
CAPNS1-201ENST00000246533 PRAC1Q96KF2 57 aa14.2□□□□□ -0.14
CAPNS1-201ENST00000246533 TPRXLQ17RH7 258 aa14.17□□□□□ -0.14
CAPNS1-201ENST00000246533 MUC2Q02817 5179 aa14.13□□□□□ -0.15
CAPNS1-201ENST00000246533 ADM2Q7Z4H4 148 aa14.12□□□□□ -0.15
CAPNS1-201ENST00000246533 LINC01554Q52M75 96 aa14.09□□□□□ -0.15
CAPNS1-201ENST00000246533 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa14.05□□□□□ -0.16
CAPNS1-201ENST00000246533 A8MUU9 505 aa14.04□□□□□ -0.16
CAPNS1-201ENST00000246533 C9orf92A6NGG3 77 aa14□□□□□ -0.17
CAPNS1-201ENST00000246533 MUC17Q685J3 4493 aa13.99□□□□□ -0.17
CAPNS1-201ENST00000246533 XP32Q5T750 250 aa13.92□□□□□ -0.18
CAPNS1-201ENST00000246533 CSAG1Q6PB30 78 aa13.88□□□□□ -0.19
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CAPNS1-201ENST00000246533 H0YAA0 97 aa13.87□□□□□ -0.19
CAPNS1-201ENST00000246533 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa13.82□□□□□ -0.2
CAPNS1-201ENST00000246533 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa13.81□□□□□ -0.2
CAPNS1-201ENST00000246533 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa13.72□□□□□ -0.21
CAPNS1-201ENST00000246533 COX6B2Q6YFQ2 88 aa13.7□□□□□ -0.22
CAPNS1-201ENST00000246533 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
CAPNS1-201ENST00000246533 K7ERS5 55 aa13.64□□□□□ -0.23
CAPNS1-201ENST00000246533 RPL37P61927 97 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
CAPNS1-201ENST00000246533 FAT4Q6V0I7 4981 aa13.6□□□□□ -0.23
CAPNS1-201ENST00000246533 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa13.59□□□□□ -0.23
CAPNS1-201ENST00000246533 ROMO1P60602 79 aa13.28□□□□□ -0.28
CAPNS1-201ENST00000246533 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa13.27□□□□□ -0.28
CAPNS1-201ENST00000246533 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
CAPNS1-201ENST00000246533 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa13.24□□□□□ -0.29
CAPNS1-201ENST00000246533 LCE2CQ5TA81 110 aa13.21□□□□□ -0.29
CAPNS1-201ENST00000246533 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
CAPNS1-201ENST00000246533 S4R3F8 94 aa13.17□□□□□ -0.3
CAPNS1-201ENST00000246533 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa13.13□□□□□ -0.31
CAPNS1-201ENST00000246533 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa13.04□□□□□ -0.32
CAPNS1-201ENST00000246533 H3BS24 57 aa13.03□□□□□ -0.32
CAPNS1-201ENST00000246533 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.32
CAPNS1-201ENST00000246533 MT1HP80294 61 aa12.98□□□□□ -0.33
CAPNS1-201ENST00000246533 CRIPTQ9P021 101 aa12.96□□□□□ -0.33
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A0D9SG42 100 aa12.96□□□□□ -0.34
CAPNS1-201ENST00000246533 P0C880 135 aa12.86□□□□□ -0.35
CAPNS1-201ENST00000246533 M0QZ58 72 aa12.74□□□□□ -0.37
CAPNS1-201ENST00000246533 M0R2T5 61 aa12.72□□□□□ -0.37
CAPNS1-201ENST00000246533 KRTAP12-2P59991 146 aa12.7□□□□□ -0.38
CAPNS1-201ENST00000246533 KRTAP12-1P59990 96 aa12.66□□□□□ -0.38
CAPNS1-201ENST00000246533 SPINT4Q6UDR6 99 aa12.66□□□□□ -0.38
CAPNS1-201ENST00000246533 LORP23490 312 aaPredicted RBP12.62□□□□□ -0.39
CAPNS1-201ENST00000246533 C10orf95Q9H7T3 257 aa12.54□□□□□ -0.4
CAPNS1-201ENST00000246533 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa12.44□□□□□ -0.42
CAPNS1-201ENST00000246533 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa12.43□□□□□ -0.42
CAPNS1-201ENST00000246533 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa12.37□□□□□ -0.43
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CAPNS1-201ENST00000246533 R4GN34 69 aa12.22□□□□□ -0.45
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CAPNS1-201ENST00000246533 NDUFAF8A1L188 74 aa12.11□□□□□ -0.47
CAPNS1-201ENST00000246533 KRTAP10-10P60014 251 aa12.05□□□□□ -0.48
CAPNS1-201ENST00000246533 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa11.96□□□□□ -0.5
CAPNS1-201ENST00000246533 USH2AO75445 5202 aa11.95□□□□□ -0.5
CAPNS1-201ENST00000246533 LCE2BO14633 110 aa11.85□□□□□ -0.51
CAPNS1-201ENST00000246533 PP632Q6XCG6 107 aa11.84□□□□□ -0.51
CAPNS1-201ENST00000246533 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa11.81□□□□□ -0.52
CAPNS1-201ENST00000246533 CRCT1Q9UGL9 99 aa11.8□□□□□ -0.52
CAPNS1-201ENST00000246533 PLAC4Q8WY50 150 aa11.79□□□□□ -0.52
CAPNS1-201ENST00000246533 SSPOA2VEC9 5147 aa11.78□□□□□ -0.52
CAPNS1-201ENST00000246533 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa11.62□□□□□ -0.55
CAPNS1-201ENST00000246533 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa11.56□□□□□ -0.56
CAPNS1-201ENST00000246533 KRTAP23-1A1A580 65 aa11.46□□□□□ -0.58
CAPNS1-201ENST00000246533 LUZP6Q538Z0 58 aa11.4□□□□□ -0.58
CAPNS1-201ENST00000246533 SPRR2GQ9BYE4 73 aa11.4□□□□□ -0.58
CAPNS1-201ENST00000246533 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
CAPNS1-201ENST00000246533 TNP1P09430 55 aa11.31□□□□□ -0.6
CAPNS1-201ENST00000246533 MT1BP07438 61 aa11.28□□□□□ -0.6
CAPNS1-201ENST00000246533 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa11.25□□□□□ -0.61
CAPNS1-201ENST00000246533 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa11.24□□□□□ -0.61
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A0A0MQY5 61 aa11.04□□□□□ -0.64
CAPNS1-201ENST00000246533 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa11.03□□□□□ -0.64
CAPNS1-201ENST00000246533 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
CAPNS1-201ENST00000246533 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
CAPNS1-201ENST00000246533 KRTAP10-5P60370 271 aa10.86□□□□□ -0.67
CAPNS1-201ENST00000246533 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP10.81□□□□□ -0.68
CAPNS1-201ENST00000246533 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa10.7□□□□□ -0.7
CAPNS1-201ENST00000246533 MT1XP80297 61 aa10.68□□□□□ -0.7
CAPNS1-201ENST00000246533 KMT2DO14686 5537 aa10.53□□□□□ -0.72
CAPNS1-201ENST00000246533 LCE3AQ5TA76 89 aa10.51□□□□□ -0.73
CAPNS1-201ENST00000246533 PRO2289Q9P1D8 64 aa10.5□□□□□ -0.73
CAPNS1-201ENST00000246533 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa10.43□□□□□ -0.74
CAPNS1-201ENST00000246533 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa10.35□□□□□ -0.75
CAPNS1-201ENST00000246533 MUC12Q9UKN1 5478 aa10.27□□□□□ -0.76
CAPNS1-201ENST00000246533 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
CAPNS1-201ENST00000246533 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa10.17□□□□□ -0.78
CAPNS1-201ENST00000246533 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa10.17□□□□□ -0.78
CAPNS1-201ENST00000246533 KRTAP5-9P26371 169 aa10.09□□□□□ -0.79
CAPNS1-201ENST00000246533 KRTAP10-12P60413 245 aa10.09□□□□□ -0.79
CAPNS1-201ENST00000246533 KRTAP12-3P60328 96 aa10.09□□□□□ -0.79
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