RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa10.23□□□□□ -0.77
SYF2-201ENST00000236273 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa10.23□□□□□ -0.77
SYF2-201ENST00000236273 A8MUN3 132 aa10.23□□□□□ -0.77
SYF2-201ENST00000236273 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa10.18□□□□□ -0.78
SYF2-201ENST00000236273 TRAV7A0A075B6U4 112 aa10.17□□□□□ -0.78
SYF2-201ENST00000236273 SMIM20Q8N5G0 67 aa10.15□□□□□ -0.78
SYF2-201ENST00000236273 NDUFC1O43677 76 aa10.11□□□□□ -0.79
SYF2-201ENST00000236273 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa10.11□□□□□ -0.79
SYF2-201ENST00000236273 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
SYF2-201ENST00000236273 DMAC1Q96GE9 116 aa10.08□□□□□ -0.8
SYF2-201ENST00000236273 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa10.05□□□□□ -0.8
SYF2-201ENST00000236273 SPRR2GQ9BYE4 73 aa10.05□□□□□ -0.8
SYF2-201ENST00000236273 H0YAA0 97 aa10.03□□□□□ -0.8
SYF2-201ENST00000236273 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa9.96□□□□□ -0.82
SYF2-201ENST00000236273 SNURFQ9Y675 71 aa9.95□□□□□ -0.82
SYF2-201ENST00000236273 MT1BP07438 61 aa9.94□□□□□ -0.82
SYF2-201ENST00000236273 SERP2Q8N6R1 65 aa9.93□□□□□ -0.82
SYF2-201ENST00000236273 CRIPTQ9P021 101 aa9.91□□□□□ -0.82
SYF2-201ENST00000236273 ADM2Q7Z4H4 148 aa9.9□□□□□ -0.82
SYF2-201ENST00000236273 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
SYF2-201ENST00000236273 C20orf197Q8N268 126 aa9.87□□□□□ -0.83
SYF2-201ENST00000236273 ACYP2P14621 99 aa9.85□□□□□ -0.83
SYF2-201ENST00000236273 Q5VV11 94 aa9.83□□□□□ -0.84
SYF2-201ENST00000236273 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa9.78□□□□□ -0.84
SYF2-201ENST00000236273 P0C880 135 aa9.77□□□□□ -0.85
SYF2-201ENST00000236273 COX7CP15954 63 aa9.71□□□□□ -0.86
SYF2-201ENST00000236273 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
SYF2-201ENST00000236273 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa9.65□□□□□ -0.86
SYF2-201ENST00000236273 A6NN06 94 aa9.61□□□□□ -0.87
SYF2-201ENST00000236273 KRTAP10-5P60370 271 aa9.61□□□□□ -0.87
SYF2-201ENST00000236273 CYSTM1Q9H1C7 97 aa9.61□□□□□ -0.87
SYF2-201ENST00000236273 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa9.6□□□□□ -0.87
SYF2-201ENST00000236273 SPTSSBQ8NFR3 76 aa9.6□□□□□ -0.87
SYF2-201ENST00000236273 R4GN34 69 aa9.58□□□□□ -0.88
SYF2-201ENST00000236273 H7BZZ5 65 aa9.54□□□□□ -0.88
SYF2-201ENST00000236273 M0QZ58 72 aa9.54□□□□□ -0.88
SYF2-201ENST00000236273 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
SYF2-201ENST00000236273 COA5Q86WW8 74 aa9.48□□□□□ -0.89
SYF2-201ENST00000236273 ANAPC13Q9BS18 74 aa9.47□□□□□ -0.89
SYF2-201ENST00000236273 PLAC4Q8WY50 150 aa9.39□□□□□ -0.91
SYF2-201ENST00000236273 MT1XP80297 61 aa9.38□□□□□ -0.91
SYF2-201ENST00000236273 LINC01554Q52M75 96 aa9.36□□□□□ -0.91
SYF2-201ENST00000236273 CCDC179H3BU77 68 aa9.35□□□□□ -0.91
SYF2-201ENST00000236273 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa9.33□□□□□ -0.92
SYF2-201ENST00000236273 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa9.28□□□□□ -0.92
SYF2-201ENST00000236273 PRO2289Q9P1D8 64 aa9.25□□□□□ -0.93
SYF2-201ENST00000236273 KMT2DO14686 5537 aa9.14□□□□□ -0.95
SYF2-201ENST00000236273 SEC61GP60059 68 aa9.1□□□□□ -0.95
SYF2-201ENST00000236273 SERP1Q9Y6X1 66 aa9.1□□□□□ -0.95
SYF2-201ENST00000236273 KRTAP12-2P59991 146 aa9.06□□□□□ -0.96
SYF2-201ENST00000236273 MUC12Q9UKN1 5478 aa9.06□□□□□ -0.96
SYF2-201ENST00000236273 KRTAP5-9P26371 169 aa9.05□□□□□ -0.96
SYF2-201ENST00000236273 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
SYF2-201ENST00000236273 A0A1B0GU33 70 aa9.02□□□□□ -0.97
SYF2-201ENST00000236273 SPATA8Q6RVD6 105 aa9.01□□□□□ -0.97
SYF2-201ENST00000236273 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
SYF2-201ENST00000236273 A0A1B0GU69 56 aa8.94□□□□□ -0.98
SYF2-201ENST00000236273 TMEM258P61165 79 aa8.94□□□□□ -0.98
SYF2-201ENST00000236273 A0A0D9SG42 100 aa8.91□□□□□ -0.98
SYF2-201ENST00000236273 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa8.91□□□□□ -0.98
SYF2-201ENST00000236273 KRTAP10-12P60413 245 aa8.91□□□□□ -0.98
SYF2-201ENST00000236273 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa8.91□□□□□ -0.98
SYF2-201ENST00000236273 NEBP20929 6669 aa8.89□□□□□ -0.99
SYF2-201ENST00000236273 MDN1Q9NU22 5596 aa8.84□□□□□ -0.99
SYF2-201ENST00000236273 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa8.84□□□□□ -0.99
SYF2-201ENST00000236273 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa8.82□□□□□ -1
SYF2-201ENST00000236273 KRTAP12-1P59990 96 aa8.81□□□□□ -1
SYF2-201ENST00000236273 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa8.81□□□□□ -1
SYF2-201ENST00000236273 SPRR2FQ96RM1 72 aa8.79□□□□□ -1
SYF2-201ENST00000236273 SPINT4Q6UDR6 99 aa8.76□□□□□ -1.01
SYF2-201ENST00000236273 A8MU10 97 aa8.74□□□□□ -1.01
SYF2-201ENST00000236273 SMIM26A0A096LP01 95 aa8.71□□□□□ -1.02
SYF2-201ENST00000236273 PRR15LQ9BU68 103 aa8.7□□□□□ -1.02
SYF2-201ENST00000236273 SPRR2EP22531 72 aa8.58□□□□□ -1.04
SYF2-201ENST00000236273 SPRR2BP35325 72 aa8.58□□□□□ -1.04
SYF2-201ENST00000236273 SPRR2AP35326 72 aa8.58□□□□□ -1.04
SYF2-201ENST00000236273 LCE1AQ5T7P2 110 aa8.58□□□□□ -1.04
SYF2-201ENST00000236273 UQCR11O14957 56 aa8.48□□□□□ -1.05
SYF2-201ENST00000236273 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa8.46□□□□□ -1.06
SYF2-201ENST00000236273 C10orf95Q9H7T3 257 aa8.43□□□□□ -1.06
SYF2-201ENST00000236273 Q1T7F1 81 aa8.41□□□□□ -1.06
SYF2-201ENST00000236273 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa8.4□□□□□ -1.06
SYF2-201ENST00000236273 PCP4P48539 62 aa8.37□□□□□ -1.07
SYF2-201ENST00000236273 V9GYY9 64 aa8.36□□□□□ -1.07
SYF2-201ENST00000236273 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa8.34□□□□□ -1.07
SYF2-201ENST00000236273 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa8.34□□□□□ -1.07
SYF2-201ENST00000236273 PSPHP1O15172 72 aa8.33□□□□□ -1.08
SYF2-201ENST00000236273 MIR22HGQ0VDD5 57 aa8.31□□□□□ -1.08
SYF2-201ENST00000236273 MT1EP04732 61 aa8.29□□□□□ -1.08
SYF2-201ENST00000236273 SPRR2DP22532 72 aa8.29□□□□□ -1.08
SYF2-201ENST00000236273 TNP1P09430 55 aa8.24□□□□□ -1.09
SYF2-201ENST00000236273 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa8.23□□□□□ -1.09
SYF2-201ENST00000236273 RPS28P62857 69 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
SYF2-201ENST00000236273 LCE3AQ5TA76 89 aa8.17□□□□□ -1.1
SYF2-201ENST00000236273 LCE5AQ5TCM9 118 aa8.15□□□□□ -1.1
SYF2-201ENST00000236273 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa8.14□□□□□ -1.11
SYF2-201ENST00000236273 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa8.1□□□□□ -1.11
SYF2-201ENST00000236273 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa8.1□□□□□ -1.11
SYF2-201ENST00000236273 LCE3BQ5TA77 95 aa8.06□□□□□ -1.12
SYF2-201ENST00000236273 A6NED7 52 aa8.02□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.1 ms