RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000061239.13

Sh3bp1-202, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 P01820 115 aa13.9□□□□□ -0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Adrb3P25962 400 aa13.9□□□□□ -0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Wfdc15bQ9JHY4 80 aa13.9□□□□□ -0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 P01756 117 aa13.9□□□□□ -0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 P01757 117 aa13.9□□□□□ -0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tmem52Q9D702 196 aa13.9□□□□□ -0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Vmn1r63Q9EPT1 300 aa13.9□□□□□ -0.18
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Trav19A0A0B4J1K4 119 aa13.89□□□□□ -0.19
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tcte2E9PY37 120 aa13.89□□□□□ -0.19
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cox8bP48772 70 aa13.89□□□□□ -0.19
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Q24JP4 165 aa13.89□□□□□ -0.19
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm5105Q8C6Y9 112 aa13.89□□□□□ -0.19
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rnf185Q91YT2 192 aa13.89□□□□□ -0.19
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Card19Q9D1I2 183 aa13.89□□□□□ -0.19
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tmem160Q9D938 188 aa13.89□□□□□ -0.19
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Q9DAB9 146 aa13.89□□□□□ -0.19
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Abca1P41233 2261 aa13.89□□□□□ -0.19
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Esp38A8R0X1 80 aa13.88□□□□□ -0.19
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 P01791 123 aa13.88□□□□□ -0.19
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Samd10Q7TST3 202 aa13.88□□□□□ -0.19
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr1012Q8VFJ7 311 aa13.88□□□□□ -0.19
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Arl3Q9WUL7 182 aa13.88□□□□□ -0.19
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ttc28Q80XJ3 2450 aa13.88□□□□□ -0.19
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm10036E9PYL9 178 aaKnown RBP13.88□□□□□ -0.19
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm17455G3UW87 128 aa13.88□□□□□ -0.19
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Khdc1aQ3UWR2 166 aa13.88□□□□□ -0.19
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr1437Q7TQR7 312 aa13.88□□□□□ -0.19
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 TirapQ99JY1 241 aa13.88□□□□□ -0.19
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Dpm3Q9D1Q4 92 aa13.88□□□□□ -0.19
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Trav6n-6A0A075B6B2 114 aa13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Igkv4-81A0A0G2JEY5 119 aa13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Zfp109A0A0U1RPC5 652 aa13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Omt2bD3YX29 119 aa13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cox7a2lQ61387 111 aa13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Zfp248Q640N4 576 aa13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Taf15Q8BQ46 557 aaKnown RBP13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rabac1Q9Z0S9 185 aa13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Dopey2Q3UHQ6 2295 aa13.86□□□□□ -0.19
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Fam208bQ5DTT3 2382 aa13.86□□□□□ -0.19
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ins2P01326 110 aa13.86□□□□□ -0.19
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 D630044L22RikQ8C701 164 aa13.86□□□□□ -0.19
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 PpbpQ9EQI5 113 aa13.86□□□□□ -0.19
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Lamtor2Q9JHS3 125 aa13.86□□□□□ -0.19
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ighv8-4A0A0A6YW26 117 aa13.86□□□□□ -0.19
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1520401A03RikA0A0J9YVH6 598 aa13.86□□□□□ -0.19
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm45623A0A1B0GSF6 103 aa13.86□□□□□ -0.19
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 TctaQ8VEA7 122 aa13.86□□□□□ -0.19
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Map1lc3aQ91VR7 121 aa13.86□□□□□ -0.19
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tomm6Q9CQN3 74 aa13.86□□□□□ -0.19
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tax1bp3Q9DBG9 124 aa13.86□□□□□ -0.19
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Klf13Q9JJZ6 289 aa13.86□□□□□ -0.19
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm28038F7BCN9 126 aa13.85□□□□□ -0.19
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 PdpnQ62011 172 aa13.85□□□□□ -0.19
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Nit2Q9JHW2 276 aa13.84□□□□□ -0.19
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Npc2Q9Z0J0 149 aa13.84□□□□□ -0.19
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm26938S4R185 226 aa13.84□□□□□ -0.19
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Odf1Q61999 247 aa13.84□□□□□ -0.19
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Sprr3O09116 238 aa13.83□□□□□ -0.2
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cacng7P62956 275 aa13.83□□□□□ -0.2
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 5730522E02RikQ5SP45 163 aa13.83□□□□□ -0.2
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Usmg5Q78IK2 58 aa13.83□□□□□ -0.2
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Q9DAA3 117 aa13.83□□□□□ -0.2
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Lrrk2Q5S006 2527 aa13.83□□□□□ -0.2
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Igkv4-70A0A0B4J1I5 116 aa13.82□□□□□ -0.2
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm1968Q3T9I3 115 aa13.82□□□□□ -0.2
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ighv1-80A0A075B5Y3 117 aa13.82□□□□□ -0.2
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Igkv4-71A0A0G2JEH0 117 aa13.82□□□□□ -0.2
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ighv1-82A0A0G2JEU7 117 aa13.82□□□□□ -0.2
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cmya5Q70KF4 3739 aa13.82□□□□□ -0.2
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Igkv4-57-1A0A075B5M4 119 aa13.81□□□□□ -0.2
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Trav14-2A0A075B694 121 aa13.81□□□□□ -0.2
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tnfrsf9P20334 256 aa13.81□□□□□ -0.2
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm5150Q1AN92 299 aa13.81□□□□□ -0.2
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Q9D131 166 aa13.81□□□□□ -0.2
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Bri3P28662 125 aa13.8□□□□□ -0.2
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 MycbQ6P8Z1 170 aa13.8□□□□□ -0.2
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mrpl20Q9CQL4 149 aa13.8□□□□□ -0.2
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Q9CX63 252 aa13.8□□□□□ -0.2
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 PdfS4R2K0 231 aa13.8□□□□□ -0.2
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Nav2E9Q842 2432 aa13.8□□□□□ -0.2
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Smad7O35253 426 aa13.8□□□□□ -0.2
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm10226O88253 85 aa13.8□□□□□ -0.2
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 P0C913 63 aa13.8□□□□□ -0.2
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 PlnP61014 52 aa13.8□□□□□ -0.2
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Timm8bP62077 83 aaKnown RBP13.8□□□□□ -0.2
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr311Q5NC59 308 aa13.8□□□□□ -0.2
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 NpbQ8K4P1 119 aa13.8□□□□□ -0.2
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr498Q8VEW2 330 aa13.8□□□□□ -0.2
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm5157A0A087WRH8 301 aa13.79□□□□□ -0.2
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Trdv2-1A0A0G2JGB9 116 aa13.79□□□□□ -0.2
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tmem238lA0A1B0GS74 79 aa13.79□□□□□ -0.2
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 AponG3X9D6 251 aa13.79□□□□□ -0.2
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Nat8f4G5E8L3 226 aa13.79□□□□□ -0.2
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Klk15Q8CGR4 254 aa13.79□□□□□ -0.2
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Hspb8Q9JK92 196 aa13.79□□□□□ -0.2
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 AcacbE9Q4Z2 2448 aa13.78□□□□□ -0.2
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ighv1-9A0A0A6YW37 117 aa13.78□□□□□ -0.2
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 H2al2bA9Z055 111 aa13.78□□□□□ -0.2
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm28305F6U473 122 aa13.78□□□□□ -0.2
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 P01643 108 aa13.78□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 61.6 ms