RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053252.8

Ctxn1-201, Transcript of Cortexin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctxn1, Length 1,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fam173aQ501J2 229 aa15.95■□□□□ 0.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Arl11Q6P3A9 176 aa15.95■□□□□ 0.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Vmn1r230Q8R2A2 316 aa15.95■□□□□ 0.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr481Q8VGI5 312 aa15.95■□□□□ 0.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Sh3bgrl3Q91VW3 93 aa15.95■□□□□ 0.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Higd1bQ99JY6 98 aa15.95■□□□□ 0.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rsg1A2A825 258 aa15.94■□□□□ 0.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 KcnrgQ2TUM3 264 aa15.94■□□□□ 0.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm765B2RVL9 189 aa15.93■□□□□ 0.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fxyd7P59648 80 aa15.93■□□□□ 0.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cmc4Q61908 68 aa15.93■□□□□ 0.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Wfdc2Q9DAU7 174 aa15.93■□□□□ 0.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Nat6Q9R123 314 aa15.93■□□□□ 0.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm6970F7DCP6 221 aa15.92■□□□□ 0.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm7489Q3UT34 171 aa15.92■□□□□ 0.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr745Q7TRL9 328 aa15.92■□□□□ 0.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr312Q7TRZ9 308 aa15.92■□□□□ 0.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Lyzl1Q9CPX3 148 aa15.92■□□□□ 0.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm33815A0A087WNV3 176 aa15.91■□□□□ 0.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm29644A0A087WPG2 191 aa15.91■□□□□ 0.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Igkv4-62A0A0G2JDW9 117 aa15.91■□□□□ 0.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Zfp979A2A799 407 aa15.91■□□□□ 0.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 F2rl1P55086 399 aa15.91■□□□□ 0.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Crebl2Q32M00 123 aa15.91■□□□□ 0.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Btf3Q64152 204 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr365Q8VFT2 312 aa15.91■□□□□ 0.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Chchd5Q9CQP3 110 aa15.91■□□□□ 0.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 V1ra8Q9EQ48 279 aa15.91■□□□□ 0.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 TgO08710 2766 aa15.91■□□□□ 0.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm28372A0A087WNV0 220 aa15.9■□□□□ 0.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ighv9-1A0A0B4J1P3 117 aa15.9■□□□□ 0.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm45800A0A1B0GT24 152 aa15.9■□□□□ 0.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 CryzP47199 331 aa15.9■□□□□ 0.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Defa24Q5G865 93 aa15.9■□□□□ 0.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 C730034F03RikQ8BGL5 111 aa15.9■□□□□ 0.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Defb42Q8BVB5 75 aa15.9■□□□□ 0.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Mrpl35Q9CQL6 188 aa15.9■□□□□ 0.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Obox1Q9D350 204 aa15.9■□□□□ 0.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Trav6d-7A0A075B6B0 112 aa15.89■□□□□ 0.13
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1700015F17RikD3YUK8 150 aa15.89■□□□□ 0.13
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Saa3P04918 122 aa15.89■□□□□ 0.13
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 AngP21570 145 aa15.89■□□□□ 0.13
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Spink11Q09TK7 88 aa15.89■□□□□ 0.13
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Trdv2-2Q5R1A4 116 aa15.89■□□□□ 0.13
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ndufb4Q9CQC7 129 aa15.89■□□□□ 0.13
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm17509Q9CZ61 145 aa15.89■□□□□ 0.13
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Zfp825A0A1Y7VK00 292 aa15.88■□□□□ 0.13
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fa2hQ5MPP0 372 aa15.88■□□□□ 0.13
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr963Q7TRA9 311 aa15.88■□□□□ 0.13
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ifi27Q8C6G0 260 aa15.88■□□□□ 0.13
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Q9D8L0 127 aa15.88■□□□□ 0.13
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Vamp5Q9Z2P8 102 aa15.88■□□□□ 0.13
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Krtap16-1A2A5X5 502 aa15.87■□□□□ 0.13
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr779E9PUS9 130 aa15.87■□□□□ 0.13
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ccl1P10146 92 aa15.87■□□□□ 0.13
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cdx1P18111 268 aa15.87■□□□□ 0.13
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 ErasQ7TN89 227 aa15.87■□□□□ 0.13
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Vmn1r70Q8R254 298 aa15.87■□□□□ 0.13
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Derl1Q99J56 251 aa15.87■□□□□ 0.13
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fam103a1Q9CQY2 119 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Atoh7Q9Z2E5 149 aa15.87■□□□□ 0.13
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Zfp931A2AHM2 298 aa15.86■□□□□ 0.13
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ctf1Q60753 203 aa15.86■□□□□ 0.13
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Slc16a4Q8R0M8 500 aa15.86■□□□□ 0.13
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Nit2Q9JHW2 276 aa15.86■□□□□ 0.13
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rabac1Q9Z0S9 185 aa15.86■□□□□ 0.13
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ighv1-63A0A075B5X2 117 aa15.85■□□□□ 0.13
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm5741B2RVA4 72 aa15.85■□□□□ 0.13
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ppt1O88531 306 aa15.85■□□□□ 0.13
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 TymsP07607 307 aa15.85■□□□□ 0.13
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Acrv1P50289 261 aa15.85■□□□□ 0.13
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Zcwpw2Q08EN7 125 aa15.85■□□□□ 0.13
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 QrfpQ8CE23 124 aa15.85■□□□□ 0.13
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tmem128Q9CZB9 163 aa15.85■□□□□ 0.13
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Kcnip3Q9QXT8 256 aa15.85■□□□□ 0.13
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ighv1-15A0A0A6YXA5 117 aa15.84■□□□□ 0.13
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rhox7bA6PW38 321 aa15.84■□□□□ 0.13
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr311Q5NC59 308 aa15.84■□□□□ 0.13
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr1380Q7TQT5 311 aa15.84■□□□□ 0.13
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ube2tQ9CQ37 204 aa15.84■□□□□ 0.13
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Golt1bQ9CR60 138 aa15.84■□□□□ 0.13
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fxyd4Q9D2W0 88 aa15.84■□□□□ 0.13
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm9508A0A1W2P7W0 230 aa15.83■□□□□ 0.12
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Nat8f7E0CYR6 227 aa15.83■□□□□ 0.12
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 4933415F23RikQ14BX6 153 aa15.83■□□□□ 0.12
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Sslp1Q3UN54 99 aa15.83■□□□□ 0.12
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Psmb11Q8BG41 302 aa15.83■□□□□ 0.12
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm5468Q8C3D3 155 aa15.83■□□□□ 0.12
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Q8R092 253 aa15.83■□□□□ 0.12
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Shisal2bQ9D1Y9 158 aa15.83■□□□□ 0.12
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Crip2Q9DCT8 208 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ms4a4bQ9ES61 226 aa15.83■□□□□ 0.12
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ighv8-4A0A0A6YW26 117 aa15.82■□□□□ 0.12
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 EtdQ80SW5 59 aa15.82■□□□□ 0.12
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 C130073F10RikQ8C4L8 201 aa15.82■□□□□ 0.12
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rasl10aQ8K5A4 203 aa15.82■□□□□ 0.12
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fam241aQ9CZL2 131 aa15.82■□□□□ 0.12
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ighv6-4A0A0A6YX19 119 aa15.81■□□□□ 0.12
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1520401A03RikA0A0J9YVH6 598 aa15.81■□□□□ 0.12
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm10112D3YWP5 117 aa15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 103.8 ms