RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000047904.3

Hoxd4-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Hoxd4, Length 2,560 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Klhdc1Q80YG3 406 aa13.56□□□□□ -0.24
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 8030423J24RikQ9CX45 142 aa13.56□□□□□ -0.24
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Sec16aA2AIX1 2377 aa13.55□□□□□ -0.24
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 1700003H04RikE9PXM2 192 aa13.55□□□□□ -0.24
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Cd59aO55186 123 aa13.55□□□□□ -0.24
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 P04943 107 aa13.55□□□□□ -0.24
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 C330021F23RikQ8C7T0 141 aa13.55□□□□□ -0.24
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gpx7Q99LJ6 186 aa13.55□□□□□ -0.24
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 GlmpQ9JHJ3 404 aa13.55□□□□□ -0.24
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gm15128A2ADW8 449 aa13.55□□□□□ -0.24
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Luzp4B1AV09 449 aa13.55□□□□□ -0.24
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gm15127B1AVZ5 449 aa13.55□□□□□ -0.24
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gm15091B1AZM2 449 aa13.55□□□□□ -0.24
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gm15107B1B0X0 449 aa13.55□□□□□ -0.24
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gm15097E9QA14 449 aa13.55□□□□□ -0.24
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Tcrg-C3L7N479 172 aa13.55□□□□□ -0.24
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gm26965M0QWH4 86 aa13.55□□□□□ -0.24
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 P03985 172 aa13.55□□□□□ -0.24
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 IappP12968 93 aa13.55□□□□□ -0.24
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Olfr1454Q8VFW2 307 aa13.55□□□□□ -0.24
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 3100002H09RikQ9CXW6 140 aa13.55□□□□□ -0.24
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Map1aQ9QYR6 2776 aa13.55□□□□□ -0.24
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Esp24A8R0V6 68 aa13.54□□□□□ -0.24
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ebi3O35228 228 aa13.54□□□□□ -0.24
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Sub1P11031 127 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Fxyd7P59648 80 aa13.54□□□□□ -0.24
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Q08AU9 97 aa13.54□□□□□ -0.24
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 ElaneQ3UP87 265 aa13.54□□□□□ -0.24
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Esp38A8R0X1 80 aa13.54□□□□□ -0.24
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Trav7-2Q5R1I3 112 aa13.54□□□□□ -0.24
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Slc25a39Q9D8K8 359 aa13.54□□□□□ -0.24
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Trav9-1A0A075B601 112 aa13.53□□□□□ -0.24
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Trav14-2A0A075B694 121 aa13.53□□□□□ -0.24
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gm5157A0A087WRH8 301 aa13.53□□□□□ -0.24
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 SmcpP15265 143 aa13.53□□□□□ -0.24
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Samd5Q3V1H9 173 aa13.53□□□□□ -0.24
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Klk7Q91VE3 249 aa13.53□□□□□ -0.24
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Rs1Q9Z1L4 224 aa13.53□□□□□ -0.24
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gm5093E9PZB3 174 aa13.53□□□□□ -0.24
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 PolP10400 120 aa13.53□□□□□ -0.24
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ighv3-6P18531 116 aa13.53□□□□□ -0.24
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Vsig8Q6P3A4 417 aa13.53□□□□□ -0.24
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Snrnp40Q6PE01 358 aa13.53□□□□□ -0.24
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Rnase2aQ8K196 155 aa13.53□□□□□ -0.24
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Rnase4Q9JJH1 148 aa13.53□□□□□ -0.24
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ly6c1P0CW02 131 aa13.52□□□□□ -0.24
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Trav6-2Q5R1I4 113 aa13.52□□□□□ -0.24
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Dlx1Q64317 255 aa13.52□□□□□ -0.24
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Olfr877Q8VF62 311 aa13.52□□□□□ -0.24
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Vma21-psA0A140T8R2 101 aa13.52□□□□□ -0.25
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gm45717A0A1B0GT68 152 aa13.52□□□□□ -0.25
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gm21983D6RFS9 131 aa13.52□□□□□ -0.25
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gm20481G3UXK4 153 aa13.52□□□□□ -0.25
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Cd5P13379 494 aa13.52□□□□□ -0.25
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Hif1anQ8BLR9 349 aa13.52□□□□□ -0.25
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 RpeQ8VEE0 228 aa13.52□□□□□ -0.25
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Q9D131 166 aa13.52□□□□□ -0.25
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Zfp119aQ9JIC0 545 aa13.52□□□□□ -0.25
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 P01794 123 aa13.51□□□□□ -0.25
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 P18532 116 aa13.51□□□□□ -0.25
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Zg16Q8K0C5 167 aa13.51□□□□□ -0.25
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Map1lc3aQ91VR7 121 aa13.51□□□□□ -0.25
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 OtorQ9JIE3 128 aa13.51□□□□□ -0.25
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Zcchc24B2RVL6 241 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Tmem213Q08EA8 116 aa13.51□□□□□ -0.25
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gm6812B1AXU1 112 aa13.5□□□□□ -0.25
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 1700020N15RikL7MTX3 112 aa13.5□□□□□ -0.25
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Olfr898L7N1Z5 316 aa13.5□□□□□ -0.25
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 P0C1Z5 52 aa13.5□□□□□ -0.25
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 CenpmQ9CQA0 180 aa13.5□□□□□ -0.25
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 ManfQ9CXI5 179 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ly96Q9JHF9 160 aa13.5□□□□□ -0.25
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Zzef1Q5SSH7 2924 aa13.5□□□□□ -0.25
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Tnfaip6O08859 275 aa13.5□□□□□ -0.25
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Rpl27aP14115 148 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Folr2Q05685 251 aa13.5□□□□□ -0.25
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Lyg1Q9D7Q0 197 aa13.5□□□□□ -0.25
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Tmem262D3Z338 116 aa13.49□□□□□ -0.25
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Tcl1b4P56844 120 aa13.49□□□□□ -0.25
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 MdfiP70331 251 aa13.49□□□□□ -0.25
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 D630044L22RikQ8C701 164 aa13.49□□□□□ -0.25
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ifi27l2aQ8R412 90 aa13.49□□□□□ -0.25
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ss18l2Q9D174 77 aa13.49□□□□□ -0.25
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Adgrg4B7ZCC9 3073 aa13.49□□□□□ -0.25
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Khdc1aQ3UWR2 166 aa13.49□□□□□ -0.25
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Abca7Q91V24 2159 aa13.49□□□□□ -0.25
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 NbeaQ9EPN1 2936 aa13.48□□□□□ -0.25
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ighv1-20A0A0A6YX66 117 aa13.48□□□□□ -0.25
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Sertad4A7DTG3 377 aa13.48□□□□□ -0.25
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Prop1P97458 223 aa13.48□□□□□ -0.25
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Cox7a2P48771 83 aa13.48□□□□□ -0.25
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Lgals6O54891 301 aa13.47□□□□□ -0.25
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 PkigO70139 76 aa13.47□□□□□ -0.25
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Q9CX63 252 aa13.47□□□□□ -0.25
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Cmya5Q70KF4 3739 aa13.47□□□□□ -0.25
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ighv5-9A0A075B5Q2 117 aa13.47□□□□□ -0.25
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ighv14-1A0A075B5R4 117 aa13.47□□□□□ -0.25
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 March3Q8BRX9 218 aa13.47□□□□□ -0.25
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Trdv1A0A075B657 112 aa13.46□□□□□ -0.25
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ighv1-37A0A0A6YW32 117 aa13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 85.9 ms