Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1I4

Trav6-2, T cell receptor alpha variable 6-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav6-2Q5R1I4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34,45■■■■□ 3,11
Trav6-2Q5R1I4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31,89■■■□□ 2,7
Trav6-2Q5R1I4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,5■■■□□ 2,63
Trav6-2Q5R1I4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30,05■■■□□ 2,4
Trav6-2Q5R1I4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29,86■■■□□ 2,37
Trav6-2Q5R1I4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29,32■■■□□ 2,28
Trav6-2Q5R1I4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Trav6-2Q5R1I4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Trav6-2Q5R1I4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Trav6-2Q5R1I4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Trav6-2Q5R1I4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28,81■■■□□ 2,2
Trav6-2Q5R1I4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Trav6-2Q5R1I4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Trav6-2Q5R1I4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,12■■■□□ 2,09
Trav6-2Q5R1I4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Trav6-2Q5R1I4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27,9■■■□□ 2,06
Trav6-2Q5R1I4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27,8■■■□□ 2,04
Trav6-2Q5R1I4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27,66■■■□□ 2,02
Trav6-2Q5R1I4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,64■■■□□ 2,02
Trav6-2Q5R1I4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Trav6-2Q5R1I4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Trav6-2Q5R1I4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27,55■■■□□ 2
Trav6-2Q5R1I4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Trav6-2Q5R1I4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Trav6-2Q5R1I4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Trav6-2Q5R1I4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Trav6-2Q5R1I4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Trav6-2Q5R1I4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27,28■■□□□ 1,96
Trav6-2Q5R1I4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Trav6-2Q5R1I4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,94
Trav6-2Q5R1I4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27,19■■□□□ 1,94
Trav6-2Q5R1I4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,93
Trav6-2Q5R1I4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Trav6-2Q5R1I4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27■■□□□ 1,91
Trav6-2Q5R1I4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Trav6-2Q5R1I4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
Trav6-2Q5R1I4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26,72■■□□□ 1,87
Trav6-2Q5R1I4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
Trav6-2Q5R1I4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26,58■■□□□ 1,85
Trav6-2Q5R1I4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Trav6-2Q5R1I4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26,53■■□□□ 1,84
Trav6-2Q5R1I4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26,5■■□□□ 1,83
Trav6-2Q5R1I4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26,4■■□□□ 1,82
Trav6-2Q5R1I4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,39■■□□□ 1,82
Trav6-2Q5R1I4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26,31■■□□□ 1,8
Trav6-2Q5R1I4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26,26■■□□□ 1,79
Trav6-2Q5R1I4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,18■■□□□ 1,78
Trav6-2Q5R1I4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,18■■□□□ 1,78
Trav6-2Q5R1I4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26,17■■□□□ 1,78
Trav6-2Q5R1I4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Trav6-2Q5R1I4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26,04■■□□□ 1,76
Trav6-2Q5R1I4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Trav6-2Q5R1I4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,75
Trav6-2Q5R1I4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Trav6-2Q5R1I4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25,91■■□□□ 1,74
Trav6-2Q5R1I4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25,91■■□□□ 1,74
Trav6-2Q5R1I4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25,85■■□□□ 1,73
Trav6-2Q5R1I4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25,76■■□□□ 1,71
Trav6-2Q5R1I4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25,75■■□□□ 1,71
Trav6-2Q5R1I4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Trav6-2Q5R1I4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
Trav6-2Q5R1I4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25,66■■□□□ 1,7
Trav6-2Q5R1I4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Trav6-2Q5R1I4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Trav6-2Q5R1I4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Trav6-2Q5R1I4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,56■■□□□ 1,68
Trav6-2Q5R1I4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25,56■■□□□ 1,68
Trav6-2Q5R1I4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,55■■□□□ 1,68
Trav6-2Q5R1I4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Trav6-2Q5R1I4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25,54■■□□□ 1,68
Trav6-2Q5R1I4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25,52■■□□□ 1,68
Trav6-2Q5R1I4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25,46■■□□□ 1,67
Trav6-2Q5R1I4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Trav6-2Q5R1I4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,67
Trav6-2Q5R1I4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,67
Trav6-2Q5R1I4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Trav6-2Q5R1I4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25,41■■□□□ 1,66
Trav6-2Q5R1I4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Trav6-2Q5R1I4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Trav6-2Q5R1I4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25,35■■□□□ 1,65
Trav6-2Q5R1I4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Trav6-2Q5R1I4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25,3■■□□□ 1,64
Trav6-2Q5R1I4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Trav6-2Q5R1I4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25,28■■□□□ 1,64
Trav6-2Q5R1I4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Trav6-2Q5R1I4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Trav6-2Q5R1I4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Trav6-2Q5R1I4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Trav6-2Q5R1I4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Trav6-2Q5R1I4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Trav6-2Q5R1I4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25,17■■□□□ 1,62
Trav6-2Q5R1I4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25,16■■□□□ 1,62
Trav6-2Q5R1I4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25,14■■□□□ 1,62
Trav6-2Q5R1I4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,61
Trav6-2Q5R1I4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Trav6-2Q5R1I4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,02■■□□□ 1,6
Trav6-2Q5R1I4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Trav6-2Q5R1I4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25,01■■□□□ 1,59
Trav6-2Q5R1I4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25■■□□□ 1,59
Trav6-2Q5R1I4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,6 ms