Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B657

Trdv1, T cell receptor delta variable 1 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv1A0A075B657 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
Trdv1A0A075B657 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC26,1■■□□□ 1,77
Trdv1A0A075B657 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,45■■□□□ 1,67
Trdv1A0A075B657 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Trdv1A0A075B657 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24,65■■□□□ 1,54
Trdv1A0A075B657 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,22■■□□□ 1,47
Trdv1A0A075B657 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
Trdv1A0A075B657 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,97■■□□□ 1,43
Trdv1A0A075B657 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,8■■□□□ 1,4
Trdv1A0A075B657 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC23,77■■□□□ 1,4
Trdv1A0A075B657 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,74■■□□□ 1,39
Trdv1A0A075B657 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,68■■□□□ 1,38
Trdv1A0A075B657 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
Trdv1A0A075B657 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC23,58■■□□□ 1,37
Trdv1A0A075B657 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,57■■□□□ 1,36
Trdv1A0A075B657 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,54■■□□□ 1,36
Trdv1A0A075B657 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23,45■■□□□ 1,34
Trdv1A0A075B657 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
Trdv1A0A075B657 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
Trdv1A0A075B657 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23,15■■□□□ 1,3
Trdv1A0A075B657 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,29
Trdv1A0A075B657 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,99■■□□□ 1,27
Trdv1A0A075B657 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
Trdv1A0A075B657 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,79■■□□□ 1,24
Trdv1A0A075B657 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22,78■■□□□ 1,24
Trdv1A0A075B657 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,77■■□□□ 1,24
Trdv1A0A075B657 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22,74■■□□□ 1,23
Trdv1A0A075B657 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,71■■□□□ 1,23
Trdv1A0A075B657 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22,69■■□□□ 1,22
Trdv1A0A075B657 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,68■■□□□ 1,22
Trdv1A0A075B657 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,68■■□□□ 1,22
Trdv1A0A075B657 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,66■■□□□ 1,22
Trdv1A0A075B657 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22,66■■□□□ 1,22
Trdv1A0A075B657 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,6■■□□□ 1,21
Trdv1A0A075B657 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22,54■■□□□ 1,2
Trdv1A0A075B657 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,47■■□□□ 1,19
Trdv1A0A075B657 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,43■■□□□ 1,18
Trdv1A0A075B657 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22,4■■□□□ 1,18
Trdv1A0A075B657 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,34■■□□□ 1,17
Trdv1A0A075B657 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,31■■□□□ 1,16
Trdv1A0A075B657 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22,3■■□□□ 1,16
Trdv1A0A075B657 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC22,27■■□□□ 1,16
Trdv1A0A075B657 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22,12■■□□□ 1,13
Trdv1A0A075B657 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22,06■■□□□ 1,12
Trdv1A0A075B657 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,99■■□□□ 1,11
Trdv1A0A075B657 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,98■■□□□ 1,11
Trdv1A0A075B657 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21,98■■□□□ 1,11
Trdv1A0A075B657 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,98■■□□□ 1,11
Trdv1A0A075B657 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC21,95■■□□□ 1,1
Trdv1A0A075B657 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,92■■□□□ 1,1
Trdv1A0A075B657 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,91■■□□□ 1,1
Trdv1A0A075B657 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,85■■□□□ 1,09
Trdv1A0A075B657 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,84■■□□□ 1,09
Trdv1A0A075B657 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,83■■□□□ 1,08
Trdv1A0A075B657 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,79■■□□□ 1,08
Trdv1A0A075B657 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
Trdv1A0A075B657 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,77■■□□□ 1,08
Trdv1A0A075B657 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,77■■□□□ 1,08
Trdv1A0A075B657 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21,72■■□□□ 1,07
Trdv1A0A075B657 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
Trdv1A0A075B657 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21,71■■□□□ 1,07
Trdv1A0A075B657 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21,68■■□□□ 1,06
Trdv1A0A075B657 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
Trdv1A0A075B657 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
Trdv1A0A075B657 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC21,65■■□□□ 1,06
Trdv1A0A075B657 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21,62■■□□□ 1,05
Trdv1A0A075B657 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
Trdv1A0A075B657 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
Trdv1A0A075B657 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,54■■□□□ 1,04
Trdv1A0A075B657 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,54■■□□□ 1,04
Trdv1A0A075B657 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,48■■□□□ 1,03
Trdv1A0A075B657 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,46■■□□□ 1,03
Trdv1A0A075B657 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,4■■□□□ 1,02
Trdv1A0A075B657 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21,4■■□□□ 1,02
Trdv1A0A075B657 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,4■■□□□ 1,02
Trdv1A0A075B657 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
Trdv1A0A075B657 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,29■■□□□ 1
Trdv1A0A075B657 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,29■■□□□ 1
Trdv1A0A075B657 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,25■□□□□ 0,99
Trdv1A0A075B657 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,25■□□□□ 0,99
Trdv1A0A075B657 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,24■□□□□ 0,99
Trdv1A0A075B657 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21,21■□□□□ 0,99
Trdv1A0A075B657 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,2■□□□□ 0,98
Trdv1A0A075B657 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21,1■□□□□ 0,97
Trdv1A0A075B657 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,08■□□□□ 0,97
Trdv1A0A075B657 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
Trdv1A0A075B657 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
Trdv1A0A075B657 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
Trdv1A0A075B657 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Trdv1A0A075B657 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,03■□□□□ 0,96
Trdv1A0A075B657 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21,02■□□□□ 0,96
Trdv1A0A075B657 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21,01■□□□□ 0,95
Trdv1A0A075B657 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
Trdv1A0A075B657 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20,98■□□□□ 0,95
Trdv1A0A075B657 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
Trdv1A0A075B657 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC20,91■□□□□ 0,94
Trdv1A0A075B657 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
Trdv1A0A075B657 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,94
Trdv1A0A075B657 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,88■□□□□ 0,93
Trdv1A0A075B657 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
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