RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000039744.12

Lnx1-201, Transcript of E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Lnx1, Length 2,727 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1-201ENSMUST00000039744 PgpQ8CHP8 321 aa9.55□□□□□ -0.88
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Immp1lQ9CQU8 166 aa9.55□□□□□ -0.88
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Pradc1Q9D9N8 188 aa9.55□□□□□ -0.88
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Gng12Q9DAS9 72 aa9.55□□□□□ -0.88
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Ighv1-36A0A0A6YXT2 117 aa9.54□□□□□ -0.88
Lnx1-201ENSMUST00000039744 DspE9Q557 2883 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Gm10251J3QPM5 127 aa9.54□□□□□ -0.88
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Ebi3O35228 228 aa9.54□□□□□ -0.88
Lnx1-201ENSMUST00000039744 ApohQ01339 345 aa9.54□□□□□ -0.88
Lnx1-201ENSMUST00000039744 GlmpQ9JHJ3 404 aa9.54□□□□□ -0.88
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Cacna1iE9Q7P2 2199 aa9.54□□□□□ -0.88
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Dscaml1Q4VA61 2053 aa9.54□□□□□ -0.88
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Gm5426J3QNM7 103 aa9.54□□□□□ -0.88
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Cd200r3Q5UKY4 296 aa9.54□□□□□ -0.88
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Fhl4Q8CDC8 279 aa9.54□□□□□ -0.88
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Olfr877Q8VF62 311 aa9.54□□□□□ -0.88
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Gatad1Q920S3 266 aa9.54□□□□□ -0.88
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Tcrg-C2A0A075B5Z2 167 aa9.54□□□□□ -0.88
Lnx1-201ENSMUST00000039744 P01630 113 aa9.54□□□□□ -0.88
Lnx1-201ENSMUST00000039744 P01853 167 aa9.54□□□□□ -0.88
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Olfr365Q8VFT2 312 aa9.54□□□□□ -0.88
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Sptbn2Q68FG2 2388 aa9.53□□□□□ -0.88
Lnx1-201ENSMUST00000039744 ClcP97400 68 aa9.53□□□□□ -0.88
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Cldn34c2J3QNM1 233 aa9.53□□□□□ -0.88
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Psmg4P0C7N9 123 aa9.53□□□□□ -0.88
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Gpx1P11352 201 aa9.53□□□□□ -0.88
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Ccl11P48298 97 aa9.53□□□□□ -0.88
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Tmem52bQ0VBF2 186 aa9.53□□□□□ -0.88
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Q0VG49 157 aa9.53□□□□□ -0.88
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Vkorc1l1Q6TEK5 176 aa9.53□□□□□ -0.88
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Cldn34c1Q8K193 234 aa9.53□□□□□ -0.88
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Wipf1Q8K1I7 493 aa9.53□□□□□ -0.88
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Olfr736Q8VFT6 312 aa9.53□□□□□ -0.88
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Ighv1-22A0A075B5U7 117 aa9.52□□□□□ -0.89
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Umad1E0CX23 159 aa9.52□□□□□ -0.89
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Rps28P62858 69 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Prr30Q9D9B7 401 aa9.52□□□□□ -0.89
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Ammecr1Q9JHT5 344 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Ighv8-5A0A0A6YY60 119 aa9.52□□□□□ -0.89
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Igkv1-132A0A0B4J1H9 120 aa9.52□□□□□ -0.89
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Igkv1-131A0A140T8M8 120 aa9.52□□□□□ -0.89
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Lgals6O54891 301 aa9.52□□□□□ -0.89
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Ormdl3Q9CPZ6 153 aa9.52□□□□□ -0.89
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Ly96Q9JHF9 160 aa9.52□□□□□ -0.89
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Zfp950A0A0U1RQ46 609 aa9.51□□□□□ -0.89
Lnx1-201ENSMUST00000039744 P01787 123 aa9.51□□□□□ -0.89
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Ube2l3P68037 154 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
Lnx1-201ENSMUST00000039744 MiaQ61865 130 aa9.51□□□□□ -0.89
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Cldn34c3J3QJW5 233 aa9.51□□□□□ -0.89
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Tmem86bQ497J1 226 aa9.51□□□□□ -0.89
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Fbxl15Q91W61 300 aa9.51□□□□□ -0.89
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Samd13D3YUG0 102 aa9.5□□□□□ -0.89
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Ube2d3P61079 147 aa9.5□□□□□ -0.89
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Ube2d2P62838 147 aa9.5□□□□□ -0.89
Lnx1-201ENSMUST00000039744 4930544G11RikQ9CR99 193 aa9.5□□□□□ -0.89
Lnx1-201ENSMUST00000039744 CklfQ9DAS1 152 aa9.5□□□□□ -0.89
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Ncor2Q9WU42 2472 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Ptprz1B9EKR1 2312 aa9.5□□□□□ -0.89
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Ighv14-1A0A075B5R4 117 aa9.5□□□□□ -0.89
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Trav21-dv12A0A075B6C4 109 aa9.5□□□□□ -0.89
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Gm12845A0A0N4SUM5 588 aa9.5□□□□□ -0.89
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Gm45623A0A1B0GSF6 103 aa9.5□□□□□ -0.89
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Tnfsf12O54907 249 aa9.5□□□□□ -0.89
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Smim1P0C8K7 78 aa9.5□□□□□ -0.89
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Stpg1Q9D2F5 341 aa9.5□□□□□ -0.89
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Q9DAQ5 155 aa9.5□□□□□ -0.89
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Trav14n-2A0A0G2JDF5 121 aa9.49□□□□□ -0.89
Lnx1-201ENSMUST00000039744 P01788 123 aa9.49□□□□□ -0.89
Lnx1-201ENSMUST00000039744 P18525 117 aa9.49□□□□□ -0.89
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Cxcl14Q9WUQ5 99 aa9.49□□□□□ -0.89
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Q8VC23 124 aa9.49□□□□□ -0.89
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Mrpl3Q99N95 348 aa9.49□□□□□ -0.89
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Sh2d6Q9D413 297 aa9.49□□□□□ -0.89
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Kmt2bO08550 2713 aa9.49□□□□□ -0.89
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Tln2Q71LX4 2375 aa9.48□□□□□ -0.89
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Abca7Q91V24 2159 aa9.48□□□□□ -0.89
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Gm28044L7N1X0 119 aa9.48□□□□□ -0.89
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Cst7O89098 144 aa9.48□□□□□ -0.89
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Vmn1r63Q9EPT1 300 aa9.48□□□□□ -0.89
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Cmya5Q70KF4 3739 aa9.48□□□□□ -0.89
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Ash1lQ99MY8 2958 aa9.48□□□□□ -0.89
Lnx1-201ENSMUST00000039744 P04940 107 aa9.48□□□□□ -0.89
Lnx1-201ENSMUST00000039744 P04941 107 aa9.48□□□□□ -0.89
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Fxyd3Q61835 88 aa9.48□□□□□ -0.89
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Znf22Q9ERU3 237 aa9.48□□□□□ -0.89
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Lrrk2Q5S006 2527 aa9.48□□□□□ -0.89
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Trav14d-1A0A075B6B1 121 aa9.47□□□□□ -0.89
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Ighv1-19A0A0A6YWX0 117 aa9.47□□□□□ -0.89
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Gm17359A0A0G2JEB7 487 aa9.47□□□□□ -0.89
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Nsun4C4P6S0 806 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Lgals9O08573 353 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
Lnx1-201ENSMUST00000039744 P01783 136 aa9.47□□□□□ -0.89
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Gm10192Q3V0S1 108 aa9.47□□□□□ -0.89
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Zfp874aQ8BX23 447 aa9.47□□□□□ -0.89
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Lgals4Q8K419 326 aa9.47□□□□□ -0.89
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Ubr5Q80TP3 2792 aa9.47□□□□□ -0.89
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Gm5157A0A087WRH8 301 aa9.47□□□□□ -0.89
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Lyz1P17897 148 aa9.47□□□□□ -0.89
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Trav7-2Q5R1I3 112 aa9.47□□□□□ -0.89
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Prss58Q8BW11 241 aa9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 105.6 ms