RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001226.9

Sh3bp1-201, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,510 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm5941Q497P9 117 aa13.17□□□□□ -0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Minos1Q7TNS2 76 aa13.17□□□□□ -0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr1437Q7TQR7 312 aa13.17□□□□□ -0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 D630044L22RikQ8C701 164 aa13.17□□□□□ -0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm10118Q8C8J5 116 aa13.17□□□□□ -0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Klk15Q8CGR4 254 aa13.17□□□□□ -0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Q9CX25 107 aa13.17□□□□□ -0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dkk2Q9QYZ8 259 aa13.17□□□□□ -0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dnajb12Q9QYI4 376 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Obox8V9GWY9 217 aa13.16□□□□□ -0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Smad7O35253 426 aa13.16□□□□□ -0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 7420426K07RikQ3UX66 186 aa13.16□□□□□ -0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm10604Q3V0X7 143 aa13.16□□□□□ -0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Igkv4-59A0A0B4J1I8 117 aa13.15□□□□□ -0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zfp493E9Q1L8 384 aa13.15□□□□□ -0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 P01725 110 aa13.15□□□□□ -0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Prrx2Q06348 247 aa13.15□□□□□ -0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ndufa4l2Q4FZG9 87 aa13.15□□□□□ -0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Bub3Q9WVA3 326 aa13.15□□□□□ -0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ighv3-1A0A075B5S6 116 aa13.15□□□□□ -0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tmem141A2AJB2 108 aa13.15□□□□□ -0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Defb30Q30KN4 75 aa13.15□□□□□ -0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 G0s2Q61585 103 aa13.15□□□□□ -0.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Trav14-2A0A075B694 121 aa13.14□□□□□ -0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 SstP60041 116 aa13.14□□□□□ -0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm5150Q1AN92 299 aa13.14□□□□□ -0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 AW146154Q3TPQ7 468 aa13.14□□□□□ -0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Q3UNZ8 350 aa13.14□□□□□ -0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Srsf2Q62093 221 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rbfox3Q8BIF2 374 aa13.14□□□□□ -0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 ManfQ9CXI5 179 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Josd1Q9DBJ6 202 aa13.14□□□□□ -0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Svep1A2AVA0 3567 aa13.14□□□□□ -0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm9970F6ZED4 185 aa13.14□□□□□ -0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Spint3Q3UW09 88 aa13.14□□□□□ -0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fmc1Q9CR13 113 aa13.14□□□□□ -0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sec11aQ9R0P6 179 aa13.14□□□□□ -0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ptprz1B9EKR1 2312 aa13.13□□□□□ -0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Lce6aD3YV94 81 aa13.13□□□□□ -0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ccdc71lE9Q4T4 218 aa13.13□□□□□ -0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Foxc2Q61850 494 aa13.13□□□□□ -0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Vsig8Q6P3A4 417 aa13.13□□□□□ -0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Crip3Q6Q6R3 243 aa13.13□□□□□ -0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 F930015N05RikQ8C3A3 210 aa13.13□□□□□ -0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pgpep1lQ9CWB5 130 aa13.13□□□□□ -0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gnb1lQ9EQ15 326 aa13.13□□□□□ -0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Trav21-dv12A0A075B6C4 109 aa13.13□□□□□ -0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Igkv4-81A0A0G2JEY5 119 aa13.13□□□□□ -0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tnfrsf9P20334 256 aa13.13□□□□□ -0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Vmn1r197Q8R265 298 aa13.13□□□□□ -0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Map1lc3aQ91VR7 121 aa13.13□□□□□ -0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Wfdc15bQ9JHY4 80 aa13.13□□□□□ -0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 1700056E22RikF7CNM6 234 aa13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nbl1Q61477 178 aa13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Aqp6Q8C4A0 293 aa13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Prrc2aQ7TSC1 2158 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tcrg-V6A0A075B5Y8 134 aa13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Vsig4F6TUL9 280 aa13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc35d2Q762D5 326 aa13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Prr23a3Q9CWP9 254 aa13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Wfdc2Q9DAU7 174 aa13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 MycbQ6P8Z1 170 aa13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ndufc2Q9CQ54 120 aa13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 AhspQ9CY02 102 aa13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Hspb8Q9JK92 196 aa13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm17727E9Q4V7 109 aa13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 H2-DMb1P35737 261 aa13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr1209Q3SXJ3 310 aa13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 MturnQ8CGA4 131 aa13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Defa9P50707 93 aa13.1□□□□□ -0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Odf3l1Q810P2 275 aa13.1□□□□□ -0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 A130051J06RikQ8CAU1 227 aa13.1□□□□□ -0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 ApomQ9Z1R3 190 aa13.1□□□□□ -0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc25a20Q9Z2Z6 301 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ins1P01325 108 aa13.1□□□□□ -0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 P01801 115 aa13.1□□□□□ -0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ang2Q64438 145 aa13.1□□□□□ -0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dopey2Q3UHQ6 2295 aa13.1□□□□□ -0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm28038F7BCN9 126 aa13.09□□□□□ -0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ly6lH3BJG9 140 aa13.09□□□□□ -0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Thy1P01831 162 aa13.09□□□□□ -0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tmem136Q3TYE7 245 aa13.09□□□□□ -0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ighv1-23A0A0A6YVW3 117 aa13.09□□□□□ -0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Smim13E9Q942 88 aa13.09□□□□□ -0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Khdc1aQ3UWR2 166 aa13.09□□□□□ -0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Msrb2Q78J03 175 aa13.09□□□□□ -0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ighv1-4A0A075B5T4 117 aa13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ighv1-53A0A075B5W3 117 aa13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tmem219Q9D123 240 aa13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dusp14Q9JLY7 198 aa13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm5464Q3UY29 175 aa13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Snx22Q8C084 192 aa13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Med13lQ6JPI3 2207 aa13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm10036E9PYL9 178 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 OtorQ9JIE3 128 aa13.07□□□□□ -0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 CenpeQ6RT24 2474 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Trav19A0A0B4J1K4 119 aa13.07□□□□□ -0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm5878E9PUB3 99 aa13.07□□□□□ -0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Defa26Q3L180 93 aa13.07□□□□□ -0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Hoxc12Q8K5B8 280 aa13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 83.5 ms