RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637570.1

DCX-211, Transcript of doublecortin, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene DCX, Length 6,162 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCX-211ENST00000637570 VCANP13611 3396 aa3.12□□□□□ -1.91
DCX-211ENST00000637570 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa3.12□□□□□ -1.91
DCX-211ENST00000637570 MGAQ8IWI9 3026 aa3.12□□□□□ -1.91
DCX-211ENST00000637570 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
DCX-211ENST00000637570 STAB1Q9NY15 2570 aa3.11□□□□□ -1.91
DCX-211ENST00000637570 PRO2289Q9P1D8 64 aa3.11□□□□□ -1.91
DCX-211ENST00000637570 COL6A5A8TX70 2615 aa3.1□□□□□ -1.91
DCX-211ENST00000637570 COL6A3P12111 3177 aa3.1□□□□□ -1.91
DCX-211ENST00000637570 RELNP78509 3460 aa3.09□□□□□ -1.91
DCX-211ENST00000637570 CENPEQ02224 2701 aa3.09□□□□□ -1.92
DCX-211ENST00000637570 CFAP54Q96N23 3096 aa3.09□□□□□ -1.92
DCX-211ENST00000637570 SPEGQ15772 3267 aa3.08□□□□□ -1.92
DCX-211ENST00000637570 TRIOO75962 3097 aa3.07□□□□□ -1.92
DCX-211ENST00000637570 CSMD1Q96PZ7 3565 aa3.07□□□□□ -1.92
DCX-211ENST00000637570 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa3.05□□□□□ -1.92
DCX-211ENST00000637570 LAMA5O15230 3695 aa3.05□□□□□ -1.92
DCX-211ENST00000637570 VPS13AQ96RL7 3174 aa3.04□□□□□ -1.92
DCX-211ENST00000637570 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
DCX-211ENST00000637570 NOTCH1P46531 2555 aa3.01□□□□□ -1.93
DCX-211ENST00000637570 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
DCX-211ENST00000637570 FLNCQ14315 2725 aa3□□□□□ -1.93
DCX-211ENST00000637570 HIVEP1P15822 2718 aa3□□□□□ -1.93
DCX-211ENST00000637570 LORP23490 312 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
DCX-211ENST00000637570 TENM4Q6N022 2769 aa3□□□□□ -1.93
DCX-211ENST00000637570 RPS29P62273 56 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
DCX-211ENST00000637570 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
DCX-211ENST00000637570 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
DCX-211ENST00000637570 DMDP11532 3685 aa2.98□□□□□ -1.93
DCX-211ENST00000637570 KRTAP12-1P59990 96 aa2.98□□□□□ -1.93
DCX-211ENST00000637570 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa2.97□□□□□ -1.93
DCX-211ENST00000637570 TEX15Q9BXT5 2789 aa2.97□□□□□ -1.93
DCX-211ENST00000637570 EYSQ5T1H1 3165 aa2.97□□□□□ -1.93
DCX-211ENST00000637570 ITPR2Q14571 2701 aa2.97□□□□□ -1.93
DCX-211ENST00000637570 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa2.97□□□□□ -1.93
DCX-211ENST00000637570 FRYQ5TBA9 3013 aa2.97□□□□□ -1.93
DCX-211ENST00000637570 FRYLO94915 3013 aa2.97□□□□□ -1.93
DCX-211ENST00000637570 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa2.97□□□□□ -1.93
DCX-211ENST00000637570 DMXL1Q9Y485 3027 aa2.96□□□□□ -1.94
DCX-211ENST00000637570 MUC3AQ02505 3323 aa2.96□□□□□ -1.94
DCX-211ENST00000637570 APCP25054 2843 aa2.94□□□□□ -1.94
DCX-211ENST00000637570 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa2.93□□□□□ -1.94
DCX-211ENST00000637570 LAMA1P25391 3075 aa2.93□□□□□ -1.94
DCX-211ENST00000637570 ITPR1Q14643 2758 aa2.93□□□□□ -1.94
DCX-211ENST00000637570 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
DCX-211ENST00000637570 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
DCX-211ENST00000637570 ATMQ13315 3056 aa2.91□□□□□ -1.94
DCX-211ENST00000637570 COL12A1Q99715 3063 aa2.9□□□□□ -1.94
DCX-211ENST00000637570 KALRNO60229 2985 aa2.9□□□□□ -1.95
DCX-211ENST00000637570 NBEAQ8NFP9 2946 aa2.89□□□□□ -1.95
DCX-211ENST00000637570 STAB2Q8WWQ8 2551 aa2.88□□□□□ -1.95
DCX-211ENST00000637570 CUBNO60494 3623 aa2.88□□□□□ -1.95
DCX-211ENST00000637570 FBN3Q75N90 2809 aa2.86□□□□□ -1.95
DCX-211ENST00000637570 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa2.86□□□□□ -1.95
DCX-211ENST00000637570 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
DCX-211ENST00000637570 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
DCX-211ENST00000637570 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa2.84□□□□□ -1.95
DCX-211ENST00000637570 LCE3AQ5TA76 89 aa2.83□□□□□ -1.96
DCX-211ENST00000637570 ZFHX3Q15911 3703 aa2.82□□□□□ -1.96
DCX-211ENST00000637570 CSMD2Q7Z408 3487 aa2.81□□□□□ -1.96
DCX-211ENST00000637570 SVEP1Q4LDE5 3571 aa2.81□□□□□ -1.96
DCX-211ENST00000637570 CSMD3Q7Z407 3707 aa2.81□□□□□ -1.96
DCX-211ENST00000637570 INE1O15225 51 aa2.8□□□□□ -1.96
DCX-211ENST00000637570 ZZEF1O43149 2961 aa2.8□□□□□ -1.96
DCX-211ENST00000637570 TACC2O95359 2948 aa2.8□□□□□ -1.96
DCX-211ENST00000637570 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa2.8□□□□□ -1.96
DCX-211ENST00000637570 PDZD2O15018 2839 aa2.8□□□□□ -1.96
DCX-211ENST00000637570 LRBAP50851 2863 aa2.79□□□□□ -1.96
DCX-211ENST00000637570 KRTAP10-12P60413 245 aa2.79□□□□□ -1.96
DCX-211ENST00000637570 CELSR2Q9HCU4 2923 aa2.79□□□□□ -1.96
DCX-211ENST00000637570 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
DCX-211ENST00000637570 FBN2P35556 2912 aa2.76□□□□□ -1.97
DCX-211ENST00000637570 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP2.75□□□□□ -1.97
DCX-211ENST00000637570 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa2.74□□□□□ -1.97
DCX-211ENST00000637570 ZANQ9Y493 2812 aa2.74□□□□□ -1.97
DCX-211ENST00000637570 OTOGQ6ZRI0 2925 aa2.73□□□□□ -1.97
DCX-211ENST00000637570 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa2.73□□□□□ -1.97
DCX-211ENST00000637570 MXRA5Q9NR99 2828 aa2.73□□□□□ -1.97
DCX-211ENST00000637570 VPS13CQ709C8 3753 aa2.72□□□□□ -1.97
DCX-211ENST00000637570 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa2.71□□□□□ -1.98
DCX-211ENST00000637570 KRTAP12-3P60328 96 aa2.68□□□□□ -1.98
DCX-211ENST00000637570 NF1P21359 2839 aa2.67□□□□□ -1.98
DCX-211ENST00000637570 LCE3BQ5TA77 95 aa2.67□□□□□ -1.98
DCX-211ENST00000637570 DCHS2Q6V1P9 2916 aa2.67□□□□□ -1.98
DCX-211ENST00000637570 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa2.65□□□□□ -1.98
DCX-211ENST00000637570 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa2.64□□□□□ -1.99
DCX-211ENST00000637570 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
DCX-211ENST00000637570 TENM2Q9NT68 2774 aa2.62□□□□□ -1.99
DCX-211ENST00000637570 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
DCX-211ENST00000637570 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa2.58□□□□□ -2
DCX-211ENST00000637570 TENM1Q9UKZ4 2725 aa2.57□□□□□ -2
DCX-211ENST00000637570 ALMS1Q8TCU4 4167 aa2.57□□□□□ -2
DCX-211ENST00000637570 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa2.57□□□□□ -2
DCX-211ENST00000637570 TENM3Q9P273 2699 aa2.56□□□□□ -2
DCX-211ENST00000637570 KRTAP23-1A1A580 65 aa2.54□□□□□ -2
DCX-211ENST00000637570 BSNQ9UPA5 3926 aa2.54□□□□□ -2
DCX-211ENST00000637570 VWFP04275 2813 aa2.54□□□□□ -2
DCX-211ENST00000637570 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa2.54□□□□□ -2
DCX-211ENST00000637570 SPRR2FQ96RM1 72 aa2.53□□□□□ -2
DCX-211ENST00000637570 LCE4AQ5TA78 99 aa2.52□□□□□ -2.01
DCX-211ENST00000637570 MT1HL1P0DM35 61 aa2.52□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.6 ms