RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636337.1

SPTAN1-231, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, human

TSL 5

Gene SPTAN1, Length 100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPTAN1-231	ENST00000636337	CSAG1	Q6PB30	78 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SPTAN1-231	ENST00000636337	LCA10	Q71F78	164 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SPTAN1-231	ENST00000636337	PRR15	Q8IV56	129 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SPTAN1-231	ENST00000636337	SYS1-DBNDD2	H3BUS1	97 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SPTAN1-231	ENST00000636337	FABP2	P12104	132 aa		4	□□□□□ -1.77
SPTAN1-231	ENST00000636337	ANKRD29	Q8N6D5	301 aa		4	□□□□□ -1.77
SPTAN1-231	ENST00000636337	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SPTAN1-231	ENST00000636337		A0A1B0GV72	72 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SPTAN1-231	ENST00000636337	MT4	P47944	62 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SPTAN1-231	ENST00000636337	CLLU1	Q5K131	121 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SPTAN1-231	ENST00000636337	LINC01545	Q5VT33	79 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SPTAN1-231	ENST00000636337	CRIPT	Q9P021	101 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SPTAN1-231	ENST00000636337	IGKV2D-30	A0A075B6S6	120 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SPTAN1-231	ENST00000636337	SNCG	O76070	127 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SPTAN1-231	ENST00000636337	TRAC	P01848	142 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SPTAN1-231	ENST00000636337	IGKV2-30	P06310	120 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SPTAN1-231	ENST00000636337	C4orf26	Q17RF5	130 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SPTAN1-231	ENST00000636337		S4R3F8	94 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SPTAN1-231	ENST00000636337	CCK	P06307	115 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SPTAN1-231	ENST00000636337	YPEL4	Q96NS1	127 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SPTAN1-231	ENST00000636337	C8orf17	Q9NRJ1	99 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SPTAN1-231	ENST00000636337		J3KT08	172 aa		3.94	□□□□□ -1.78
SPTAN1-231	ENST00000636337	RBM3	P98179	157 aa	Known RBP	3.94	□□□□□ -1.78
SPTAN1-231	ENST00000636337	C2orf91	Q6ZV80	131 aa		3.94	□□□□□ -1.78
SPTAN1-231	ENST00000636337	NDUFB1	O75438	58 aa		3.93	□□□□□ -1.78
SPTAN1-231	ENST00000636337	PET117	Q6UWS5	81 aa		3.93	□□□□□ -1.78
SPTAN1-231	ENST00000636337	C7orf65	Q6ZTY9	151 aa		3.93	□□□□□ -1.78
SPTAN1-231	ENST00000636337		Q6ZVQ6	151 aa		3.93	□□□□□ -1.78
SPTAN1-231	ENST00000636337	VPS25	Q9BRG1	176 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SPTAN1-231	ENST00000636337		H0YGX0	51 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SPTAN1-231	ENST00000636337	APOC3	P02656	99 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SPTAN1-231	ENST00000636337	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	3.89	□□□□□ -1.79
SPTAN1-231	ENST00000636337	LCE4A	Q5TA78	99 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SPTAN1-231	ENST00000636337	PLAC4	Q8WY50	150 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SPTAN1-231	ENST00000636337	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SPTAN1-231	ENST00000636337	SNAPIN	O95295	136 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SPTAN1-231	ENST00000636337	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SPTAN1-231	ENST00000636337	NDUFS5	O43920	106 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SPTAN1-231	ENST00000636337	ATOH7	Q8N100	152 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SPTAN1-231	ENST00000636337	KRTAP10-12	P60413	245 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SPTAN1-231	ENST00000636337	SVBP	Q8N300	66 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SPTAN1-231	ENST00000636337	MRPL34	Q9BQ48	92 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
SPTAN1-231	ENST00000636337	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SPTAN1-231	ENST00000636337		Q5W150	140 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SPTAN1-231	ENST00000636337		A0A1B0GX51	115 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SPTAN1-231	ENST00000636337		A8MUN3	132 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SPTAN1-231	ENST00000636337	KRTDAP	P60985	99 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SPTAN1-231	ENST00000636337	TMEM254	Q8TBM7	123 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SPTAN1-231	ENST00000636337	KRTAP3-3	Q9BYR6	98 aa		3.82	□□□□□ -1.8
SPTAN1-231	ENST00000636337		K7EQZ3	153 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SPTAN1-231	ENST00000636337	PDE6G	P18545	87 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SPTAN1-231	ENST00000636337	NDUFA5	Q16718	116 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SPTAN1-231	ENST00000636337	C1orf64	Q8NEQ6	169 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SPTAN1-231	ENST00000636337	ORMDL1	Q9P0S3	153 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SPTAN1-231	ENST00000636337	MMP24-AS1	A0A0U1RRL7	71 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SPTAN1-231	ENST00000636337		Q6ZQT0	140 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SPTAN1-231	ENST00000636337	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SPTAN1-231	ENST00000636337	HIST1H4G	Q99525	98 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SPTAN1-231	ENST00000636337	hDV103S1	A0JD37	113 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SPTAN1-231	ENST00000636337	TMEM256-PLSCR3	K7ERE1	68 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SPTAN1-231	ENST00000636337	DNAL4	O96015	105 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SPTAN1-231	ENST00000636337		H3BQ85	93 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SPTAN1-231	ENST00000636337	C21orf62-AS1	Q17RA5	79 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SPTAN1-231	ENST00000636337	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SPTAN1-231	ENST00000636337	CYSTM1	Q9H1C7	97 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SPTAN1-231	ENST00000636337	SNRPE	P62304	92 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
SPTAN1-231	ENST00000636337	UBE2V1	Q13404	147 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SPTAN1-231	ENST00000636337	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.82
SPTAN1-231	ENST00000636337		A0A0B4J2C4	111 aa		3.71	□□□□□ -1.82
SPTAN1-231	ENST00000636337	TRIAP1	O43715	76 aa		3.71	□□□□□ -1.82
SPTAN1-231	ENST00000636337	HIST1H2BK	O60814	126 aa		3.71	□□□□□ -1.82
SPTAN1-231	ENST00000636337	HIST1H2BJ	P06899	126 aa		3.71	□□□□□ -1.82
SPTAN1-231	ENST00000636337	HIST1H2BO	P23527	126 aa		3.71	□□□□□ -1.82
SPTAN1-231	ENST00000636337	HIST1H2BB	P33778	126 aa		3.71	□□□□□ -1.82
SPTAN1-231	ENST00000636337	HIST1H2BD	P58876	126 aa		3.71	□□□□□ -1.82
SPTAN1-231	ENST00000636337	HIST1H2BC	P62807	126 aa		3.71	□□□□□ -1.82
SPTAN1-231	ENST00000636337	HIST2H2BE	Q16778	126 aa		3.71	□□□□□ -1.82
SPTAN1-231	ENST00000636337	HIST2H2BF	Q5QNW6	126 aa	Predicted RBP	3.71	□□□□□ -1.82
SPTAN1-231	ENST00000636337	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		3.71	□□□□□ -1.82
SPTAN1-231	ENST00000636337	HIST1H2BH	Q93079	126 aa		3.71	□□□□□ -1.82
SPTAN1-231	ENST00000636337	HIST1H2BN	Q99877	126 aa		3.71	□□□□□ -1.82
SPTAN1-231	ENST00000636337	HIST1H2BM	Q99879	126 aa		3.71	□□□□□ -1.82
SPTAN1-231	ENST00000636337		C9JAW5	83 aa		3.69	□□□□□ -1.82
SPTAN1-231	ENST00000636337		A0A087WVE0	104 aa		3.68	□□□□□ -1.82
SPTAN1-231	ENST00000636337		H0YAA0	97 aa		3.68	□□□□□ -1.82
SPTAN1-231	ENST00000636337	ADM2	Q7Z4H4	148 aa		3.68	□□□□□ -1.82
SPTAN1-231	ENST00000636337	HSBP1L1	C9JCN9	74 aa		3.65	□□□□□ -1.83
SPTAN1-231	ENST00000636337	HCG22	E2RYF7	251 aa		3.65	□□□□□ -1.83
SPTAN1-231	ENST00000636337	MT1E	P04732	61 aa		3.65	□□□□□ -1.83
SPTAN1-231	ENST00000636337	KRTAP19-7	Q3SYF9	63 aa		3.65	□□□□□ -1.83
SPTAN1-231	ENST00000636337	PRO1854	Q9UHT4	67 aa		3.65	□□□□□ -1.83
SPTAN1-231	ENST00000636337	TMEM238L	A0A1B0GVL6	79 aa		3.64	□□□□□ -1.83
SPTAN1-231	ENST00000636337		A6NJY4	79 aa		3.64	□□□□□ -1.83
SPTAN1-231	ENST00000636337	CEND1	Q8N111	149 aa		3.63	□□□□□ -1.83
SPTAN1-231	ENST00000636337	CXCL6	P80162	114 aa		3.62	□□□□□ -1.83
SPTAN1-231	ENST00000636337		R4GN34	69 aa		3.62	□□□□□ -1.83
SPTAN1-231	ENST00000636337		A0A1B0GW54	56 aa		3.6	□□□□□ -1.83
SPTAN1-231	ENST00000636337	PSMB2	P49721	201 aa		3.6	□□□□□ -1.83
SPTAN1-231	ENST00000636337	NREP	Q16612	68 aa		3.6	□□□□□ -1.83
SPTAN1-231	ENST00000636337	MUC5AC	P98088	5654 aa		3.6	□□□□□ -1.83

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