RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617649.4

ACACA-240, Transcript of acetyl-CoA carboxylase alpha, human

TSL 5 BASIC

Gene ACACA, Length 7,912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACACA-240	ENST00000617649	COL12A1	Q99715	3063 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ACACA-240	ENST00000617649	DNAH14	Q0VDD8	3507 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ACACA-240	ENST00000617649	NOTCH2NL	Q7Z3S9	236 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ACACA-240	ENST00000617649	SPTBN5	Q9NRC6	3674 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
ACACA-240	ENST00000617649	NBEA	Q8NFP9	2946 aa		3.71	□□□□□ -1.81
ACACA-240	ENST00000617649	CYSTM1	Q9H1C7	97 aa		3.71	□□□□□ -1.82
ACACA-240	ENST00000617649	ATM	Q13315	3056 aa		3.7	□□□□□ -1.82
ACACA-240	ENST00000617649	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		3.7	□□□□□ -1.82
ACACA-240	ENST00000617649	COL6A3	P12111	3177 aa		3.7	□□□□□ -1.82
ACACA-240	ENST00000617649	BOD1L1	Q8NFC6	3051 aa		3.69	□□□□□ -1.82
ACACA-240	ENST00000617649	ZZEF1	O43149	2961 aa		3.69	□□□□□ -1.82
ACACA-240	ENST00000617649	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	3.69	□□□□□ -1.82
ACACA-240	ENST00000617649	VCAN	P13611	3396 aa		3.69	□□□□□ -1.82
ACACA-240	ENST00000617649	C10orf95	Q9H7T3	257 aa		3.68	□□□□□ -1.82
ACACA-240	ENST00000617649	TENM4	Q6N022	2769 aa		3.67	□□□□□ -1.82
ACACA-240	ENST00000617649	ADGRG4	Q8IZF6	3080 aa		3.66	□□□□□ -1.82
ACACA-240	ENST00000617649	EYS	Q5T1H1	3165 aa		3.65	□□□□□ -1.82
ACACA-240	ENST00000617649	REV3L	O60673	3130 aa		3.65	□□□□□ -1.83
ACACA-240	ENST00000617649	TPRXL	Q17RH7	258 aa		3.64	□□□□□ -1.83
ACACA-240	ENST00000617649	TACC2	O95359	2948 aa		3.64	□□□□□ -1.83
ACACA-240	ENST00000617649	DMXL1	Q9Y485	3027 aa		3.63	□□□□□ -1.83
ACACA-240	ENST00000617649	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		3.63	□□□□□ -1.83
ACACA-240	ENST00000617649		A6NN06	94 aa		3.62	□□□□□ -1.83
ACACA-240	ENST00000617649	CELSR2	Q9HCU4	2923 aa		3.61	□□□□□ -1.83
ACACA-240	ENST00000617649	HRNR	Q86YZ3	2850 aa	Predicted RBP	3.61	□□□□□ -1.83
ACACA-240	ENST00000617649	TNP1	P09430	55 aa		3.61	□□□□□ -1.83
ACACA-240	ENST00000617649	XP32	Q5T750	250 aa		3.6	□□□□□ -1.83
ACACA-240	ENST00000617649	TENM1	Q9UKZ4	2725 aa		3.59	□□□□□ -1.83
ACACA-240	ENST00000617649	KRTAP1-4	P0C5Y4	121 aa		3.59	□□□□□ -1.84
ACACA-240	ENST00000617649	NF1	P21359	2839 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ACACA-240	ENST00000617649	PRO2289	Q9P1D8	64 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ACACA-240	ENST00000617649	ZAN	Q9Y493	2812 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ACACA-240	ENST00000617649	ASH1L	Q9NR48	2969 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
ACACA-240	ENST00000617649	DCHS2	Q6V1P9	2916 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ACACA-240	ENST00000617649	KRTAP10-8	P60410	259 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ACACA-240	ENST00000617649	TENM3	Q9P273	2699 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ACACA-240	ENST00000617649	SPEG	Q15772	3267 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ACACA-240	ENST00000617649	PP632	Q6XCG6	107 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ACACA-240	ENST00000617649	CFAP47	Q6ZTR5	3102 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ACACA-240	ENST00000617649	FREM2	Q5SZK8	3169 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ACACA-240	ENST00000617649		A8MU10	97 aa		3.52	□□□□□ -1.85
ACACA-240	ENST00000617649	KRTAP10-10	P60014	251 aa		3.52	□□□□□ -1.85
ACACA-240	ENST00000617649	NBPF19	A0A087WUL8	3843 aa		3.52	□□□□□ -1.85
ACACA-240	ENST00000617649	CELSR1	Q9NYQ6	3014 aa		3.52	□□□□□ -1.85
ACACA-240	ENST00000617649	MXRA5	Q9NR99	2828 aa		3.51	□□□□□ -1.85
ACACA-240	ENST00000617649		A0A1B0GVY2	172 aa		3.5	□□□□□ -1.85
ACACA-240	ENST00000617649	KRTAP13-3	Q3SY46	172 aa		3.5	□□□□□ -1.85
ACACA-240	ENST00000617649	FBN2	P35556	2912 aa		3.49	□□□□□ -1.85
ACACA-240	ENST00000617649	LOC400499	M0QZD8	3231 aa		3.46	□□□□□ -1.86
ACACA-240	ENST00000617649	MYO15A	Q9UKN7	3530 aa		3.43	□□□□□ -1.86
ACACA-240	ENST00000617649	TENM2	Q9NT68	2774 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ACACA-240	ENST00000617649	PDZD2	O15018	2839 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ACACA-240	ENST00000617649	ASPM	Q8IZT6	3477 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ACACA-240	ENST00000617649	TG	P01266	2768 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ACACA-240	ENST00000617649	WDFY3	Q8IZQ1	3526 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ACACA-240	ENST00000617649	PKD1L1	Q8TDX9	2849 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ACACA-240	ENST00000617649		H0YAA0	97 aa		3.34	□□□□□ -1.88
ACACA-240	ENST00000617649	VWF	P04275	2813 aa		3.32	□□□□□ -1.88
ACACA-240	ENST00000617649	ZFHX3	Q15911	3703 aa		3.32	□□□□□ -1.88
ACACA-240	ENST00000617649	RELN	P78509	3460 aa		3.31	□□□□□ -1.88
ACACA-240	ENST00000617649	LAMA5	O15230	3695 aa		3.3	□□□□□ -1.88
ACACA-240	ENST00000617649	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
ACACA-240	ENST00000617649	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		3.27	□□□□□ -1.89
ACACA-240	ENST00000617649	DCHS1	Q96JQ0	3298 aa		3.26	□□□□□ -1.89
ACACA-240	ENST00000617649	DMD	P11532	3685 aa		3.24	□□□□□ -1.89
ACACA-240	ENST00000617649	SPEN	Q96T58	3664 aa	Known RBP	3.23	□□□□□ -1.89
ACACA-240	ENST00000617649	FBN3	Q75N90	2809 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ACACA-240	ENST00000617649	KRTAP13-4	Q3LI77	160 aa		3.2	□□□□□ -1.9
ACACA-240	ENST00000617649	ZFHX4	Q86UP3	3567 aa		3.19	□□□□□ -1.9
ACACA-240	ENST00000617649	ALMS1	Q8TCU4	4167 aa		3.19	□□□□□ -1.9
ACACA-240	ENST00000617649	FBN1	P35555	2871 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
ACACA-240	ENST00000617649	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
ACACA-240	ENST00000617649	BSN	Q9UPA5	3926 aa		3.19	□□□□□ -1.9
ACACA-240	ENST00000617649	TRRAP	Q9Y4A5	3859 aa		3.17	□□□□□ -1.9
ACACA-240	ENST00000617649	KRTAP12-2	P59991	146 aa		3.16	□□□□□ -1.9
ACACA-240	ENST00000617649	COL7A1	Q02388	2944 aa		3.15	□□□□□ -1.91
ACACA-240	ENST00000617649	CSMD1	Q96PZ7	3565 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ACACA-240	ENST00000617649	SMG1	Q96Q15	3661 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
ACACA-240	ENST00000617649	MT1HL1	P0DM35	61 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ACACA-240	ENST00000617649	KRTAP12-1	P59990	96 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ACACA-240	ENST00000617649	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ACACA-240	ENST00000617649	CRCT1	Q9UGL9	99 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ACACA-240	ENST00000617649	MUC3A	Q02505	3323 aa		3.09	□□□□□ -1.92
ACACA-240	ENST00000617649	AKAP9	Q99996	3911 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ACACA-240	ENST00000617649	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ACACA-240	ENST00000617649	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ACACA-240	ENST00000617649	VPS13C	Q709C8	3753 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ACACA-240	ENST00000617649	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
ACACA-240	ENST00000617649	INE1	O15225	51 aa		3.05	□□□□□ -1.92
ACACA-240	ENST00000617649	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
ACACA-240	ENST00000617649	CSMD2	Q7Z408	3487 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ACACA-240	ENST00000617649	SVEP1	Q4LDE5	3571 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ACACA-240	ENST00000617649	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
ACACA-240	ENST00000617649	KRTAP10-12	P60413	245 aa		3	□□□□□ -1.93
ACACA-240	ENST00000617649	KRTAP4-5	Q9BYR2	181 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ACACA-240	ENST00000617649	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
ACACA-240	ENST00000617649	DNAH1	Q9P2D7	4330 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ACACA-240	ENST00000617649	CUBN	O60494	3623 aa		2.94	□□□□□ -1.94
ACACA-240	ENST00000617649	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		2.93	□□□□□ -1.94
ACACA-240	ENST00000617649	ZNF469	Q96JG9	3925 aa	Predicted RBP	2.93	□□□□□ -1.94

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