RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615025.4

TNS1-221, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TNS1, Length 6,488 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-221ENST00000615025 FREM2Q5SZK8 3169 aa6.02□□□□□ -1.44
TNS1-221ENST00000615025 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
TNS1-221ENST00000615025 STAB2Q8WWQ8 2551 aa6.02□□□□□ -1.45
TNS1-221ENST00000615025 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa6.01□□□□□ -1.45
TNS1-221ENST00000615025 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
TNS1-221ENST00000615025 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
TNS1-221ENST00000615025 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa5.96□□□□□ -1.45
TNS1-221ENST00000615025 FRYLO94915 3013 aa5.95□□□□□ -1.46
TNS1-221ENST00000615025 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
TNS1-221ENST00000615025 ITPR1Q14643 2758 aa5.94□□□□□ -1.46
TNS1-221ENST00000615025 DMXL1Q9Y485 3027 aa5.94□□□□□ -1.46
TNS1-221ENST00000615025 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa5.91□□□□□ -1.46
TNS1-221ENST00000615025 ATMQ13315 3056 aa5.9□□□□□ -1.46
TNS1-221ENST00000615025 XP32Q5T750 250 aa5.9□□□□□ -1.47
TNS1-221ENST00000615025 KRTAP10-8P60410 259 aa5.89□□□□□ -1.47
TNS1-221ENST00000615025 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa5.89□□□□□ -1.47
TNS1-221ENST00000615025 LRBAP50851 2863 aa5.86□□□□□ -1.47
TNS1-221ENST00000615025 PP632Q6XCG6 107 aa5.86□□□□□ -1.47
TNS1-221ENST00000615025 A0A1B0GVY2 172 aa5.86□□□□□ -1.47
TNS1-221ENST00000615025 COL12A1Q99715 3063 aa5.86□□□□□ -1.47
TNS1-221ENST00000615025 HIVEP1P15822 2718 aa5.85□□□□□ -1.47
TNS1-221ENST00000615025 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
TNS1-221ENST00000615025 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa5.84□□□□□ -1.47
TNS1-221ENST00000615025 KALRNO60229 2985 aa5.83□□□□□ -1.48
TNS1-221ENST00000615025 TACC2O95359 2948 aa5.82□□□□□ -1.48
TNS1-221ENST00000615025 ASPMQ8IZT6 3477 aa5.82□□□□□ -1.48
TNS1-221ENST00000615025 TPRXLQ17RH7 258 aa5.82□□□□□ -1.48
TNS1-221ENST00000615025 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa5.81□□□□□ -1.48
TNS1-221ENST00000615025 LOC400499M0QZD8 3231 aa5.81□□□□□ -1.48
TNS1-221ENST00000615025 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa5.8□□□□□ -1.48
TNS1-221ENST00000615025 DMDP11532 3685 aa5.8□□□□□ -1.48
TNS1-221ENST00000615025 PRO2289Q9P1D8 64 aa5.8□□□□□ -1.48
TNS1-221ENST00000615025 FLNCQ14315 2725 aa5.79□□□□□ -1.48
TNS1-221ENST00000615025 APCP25054 2843 aa5.78□□□□□ -1.48
TNS1-221ENST00000615025 KRTAP10-10P60014 251 aa5.78□□□□□ -1.48
TNS1-221ENST00000615025 P0C880 135 aa5.77□□□□□ -1.49
TNS1-221ENST00000615025 TENM4Q6N022 2769 aa5.76□□□□□ -1.49
TNS1-221ENST00000615025 LAMA5O15230 3695 aa5.73□□□□□ -1.49
TNS1-221ENST00000615025 NBEAQ8NFP9 2946 aa5.72□□□□□ -1.49
TNS1-221ENST00000615025 RELNP78509 3460 aa5.7□□□□□ -1.5
TNS1-221ENST00000615025 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa5.69□□□□□ -1.5
TNS1-221ENST00000615025 ZZEF1O43149 2961 aa5.68□□□□□ -1.5
TNS1-221ENST00000615025 ZFHX4Q86UP3 3567 aa5.66□□□□□ -1.5
TNS1-221ENST00000615025 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
TNS1-221ENST00000615025 MUC3AQ02505 3323 aa5.65□□□□□ -1.5
TNS1-221ENST00000615025 H0YAA0 97 aa5.65□□□□□ -1.51
TNS1-221ENST00000615025 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP5.62□□□□□ -1.51
TNS1-221ENST00000615025 DCHS1Q96JQ0 3298 aa5.61□□□□□ -1.51
TNS1-221ENST00000615025 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa5.6□□□□□ -1.51
TNS1-221ENST00000615025 CELSR2Q9HCU4 2923 aa5.59□□□□□ -1.51
TNS1-221ENST00000615025 DCHS2Q6V1P9 2916 aa5.56□□□□□ -1.52
TNS1-221ENST00000615025 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
TNS1-221ENST00000615025 TENM2Q9NT68 2774 aa5.48□□□□□ -1.53
TNS1-221ENST00000615025 ZANQ9Y493 2812 aa5.47□□□□□ -1.53
TNS1-221ENST00000615025 TENM1Q9UKZ4 2725 aa5.44□□□□□ -1.54
TNS1-221ENST00000615025 NF1P21359 2839 aa5.44□□□□□ -1.54
TNS1-221ENST00000615025 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
TNS1-221ENST00000615025 CSMD1Q96PZ7 3565 aa5.41□□□□□ -1.54
TNS1-221ENST00000615025 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa5.36□□□□□ -1.55
TNS1-221ENST00000615025 FBN2P35556 2912 aa5.36□□□□□ -1.55
TNS1-221ENST00000615025 KRTAP12-2P59991 146 aa5.36□□□□□ -1.55
TNS1-221ENST00000615025 TENM3Q9P273 2699 aa5.35□□□□□ -1.55
TNS1-221ENST00000615025 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
TNS1-221ENST00000615025 SVEP1Q4LDE5 3571 aa5.31□□□□□ -1.56
TNS1-221ENST00000615025 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa5.31□□□□□ -1.56
TNS1-221ENST00000615025 ZFHX3Q15911 3703 aa5.3□□□□□ -1.56
TNS1-221ENST00000615025 BSNQ9UPA5 3926 aa5.3□□□□□ -1.56
TNS1-221ENST00000615025 CSMD2Q7Z408 3487 aa5.28□□□□□ -1.56
TNS1-221ENST00000615025 MXRA5Q9NR99 2828 aa5.27□□□□□ -1.57
TNS1-221ENST00000615025 TGP01266 2768 aa5.26□□□□□ -1.57
TNS1-221ENST00000615025 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
TNS1-221ENST00000615025 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa5.21□□□□□ -1.57
TNS1-221ENST00000615025 PDZD2O15018 2839 aa5.21□□□□□ -1.58
TNS1-221ENST00000615025 KRTAP12-1P59990 96 aa5.2□□□□□ -1.58
TNS1-221ENST00000615025 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa5.2□□□□□ -1.58
TNS1-221ENST00000615025 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa5.18□□□□□ -1.58
TNS1-221ENST00000615025 INE1O15225 51 aa5.15□□□□□ -1.59
TNS1-221ENST00000615025 VWFP04275 2813 aa5.13□□□□□ -1.59
TNS1-221ENST00000615025 CUBNO60494 3623 aa5.11□□□□□ -1.59
TNS1-221ENST00000615025 OTOGQ6ZRI0 2925 aa5.11□□□□□ -1.59
TNS1-221ENST00000615025 MT1HL1P0DM35 61 aa5.09□□□□□ -1.6
TNS1-221ENST00000615025 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
TNS1-221ENST00000615025 VPS13CQ709C8 3753 aa5.04□□□□□ -1.6
TNS1-221ENST00000615025 CRCT1Q9UGL9 99 aa5.04□□□□□ -1.6
TNS1-221ENST00000615025 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa5.03□□□□□ -1.6
TNS1-221ENST00000615025 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
TNS1-221ENST00000615025 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa4.98□□□□□ -1.61
TNS1-221ENST00000615025 FBN3Q75N90 2809 aa4.95□□□□□ -1.62
TNS1-221ENST00000615025 KRTAP10-12P60413 245 aa4.94□□□□□ -1.62
TNS1-221ENST00000615025 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
TNS1-221ENST00000615025 AKAP9Q99996 3911 aa4.91□□□□□ -1.62
TNS1-221ENST00000615025 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.62
TNS1-221ENST00000615025 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
TNS1-221ENST00000615025 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
TNS1-221ENST00000615025 ALMS1Q8TCU4 4167 aa4.87□□□□□ -1.63
TNS1-221ENST00000615025 LORP23490 312 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
TNS1-221ENST00000615025 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa4.85□□□□□ -1.63
TNS1-221ENST00000615025 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa4.82□□□□□ -1.64
TNS1-221ENST00000615025 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa4.8□□□□□ -1.64
TNS1-221ENST00000615025 KRTAP12-3P60328 96 aa4.76□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 1014.2 ms