RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588707.5

GTF3C2-AS1-205, GTF3C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene GTF3C2-AS1, Length 607 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 LRP2P98164 4655 aa4.22□□□□□ -1.73
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa4.22□□□□□ -1.73
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa4.22□□□□□ -1.73
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 DSCR10P59022 87 aa4.22□□□□□ -1.73
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 DEFB116Q30KQ4 102 aa4.21□□□□□ -1.74
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 A0A087WVE0 104 aa4.2□□□□□ -1.74
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 K7EQZ3 153 aa4.2□□□□□ -1.74
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ATOX1O00244 68 aa4.2□□□□□ -1.74
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PRR15Q8IV56 129 aa4.2□□□□□ -1.74
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SMIM20Q8N5G0 67 aa4.2□□□□□ -1.74
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 Q96NJ1 140 aa4.2□□□□□ -1.74
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 Q8N9L7 120 aa4.19□□□□□ -1.74
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 HCG22E2RYF7 251 aa4.18□□□□□ -1.74
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ANAPC13Q9BS18 74 aa4.18□□□□□ -1.74
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 LPAP08519 4548 aa4.17□□□□□ -1.74
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 A0A1B0GVX0 72 aa4.17□□□□□ -1.74
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 C8orf87E5RJ46 101 aa4.17□□□□□ -1.74
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 C1orf195Q5TG92 126 aa4.17□□□□□ -1.74
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 RNF213Q63HN8 5207 aa4.16□□□□□ -1.74
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa4.15□□□□□ -1.75
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PCP4P48539 62 aa4.15□□□□□ -1.75
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CASC2Q6XLA1 102 aa4.15□□□□□ -1.75
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 hDV103S1A0JD37 113 aa4.14□□□□□ -1.75
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PRR4Q16378 134 aa4.14□□□□□ -1.75
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 C8orf17Q9NRJ1 99 aa4.14□□□□□ -1.75
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TRAV7A0A075B6U4 112 aa4.13□□□□□ -1.75
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa4.13□□□□□ -1.75
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 LINC00313P59037 77 aa4.13□□□□□ -1.75
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 WFDC13Q8IUB5 93 aa4.13□□□□□ -1.75
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SERP2Q8N6R1 65 aa4.13□□□□□ -1.75
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TMEM254Q8TBM7 123 aa4.12□□□□□ -1.75
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa4.12□□□□□ -1.75
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 UQCRQO14949 82 aa4.11□□□□□ -1.75
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 COX7CP15954 63 aa4.11□□□□□ -1.75
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 OCR1Q9BZK8 76 aa4.1□□□□□ -1.75
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 C5orf47Q569G3 176 aa4.09□□□□□ -1.75
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 RETNLBQ9BQ08 111 aa4.09□□□□□ -1.75
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 NDUFS5O43920 106 aa4.08□□□□□ -1.76
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 H3BPC8 53 aa4.06□□□□□ -1.76
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 MP68P56378 58 aa4.06□□□□□ -1.76
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa4.06□□□□□ -1.76
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa4.04□□□□□ -1.76
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TRAV22A0A0B4J277 110 aa4.04□□□□□ -1.76
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 MUC2Q02817 5179 aa4.03□□□□□ -1.76
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa4.03□□□□□ -1.76
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CCDC179H3BU77 68 aa4.03□□□□□ -1.76
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 NDUFC1O43677 76 aa4.03□□□□□ -1.76
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 KLKP1Q107X0 134 aa4.03□□□□□ -1.76
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 C20orf197Q8N268 126 aa4.03□□□□□ -1.76
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 H0Y9P7 68 aa4.02□□□□□ -1.77
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TPRXLQ17RH7 258 aa4.02□□□□□ -1.77
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 C9orf92A6NGG3 77 aa4.01□□□□□ -1.77
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 A0A0U1RQV1 116 aa4□□□□□ -1.77
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa4□□□□□ -1.77
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 A8MUU9 505 aa3.99□□□□□ -1.77
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 C1orf64Q8NEQ6 169 aa3.99□□□□□ -1.77
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 LINC00208Q96KT6 92 aa3.99□□□□□ -1.77
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa3.98□□□□□ -1.77
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 Q75L30 129 aa3.98□□□□□ -1.77
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SNURFQ9Y675 71 aa3.98□□□□□ -1.77
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa3.97□□□□□ -1.77
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TMEM258P61165 79 aa3.96□□□□□ -1.78
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 Q5W150 140 aa3.95□□□□□ -1.78
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa3.95□□□□□ -1.78
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 MUC17Q685J3 4493 aa3.95□□□□□ -1.78
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 H7BZZ5 65 aa3.94□□□□□ -1.78
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 RPL37P61927 97 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 IGKV2-30P06310 120 aa3.93□□□□□ -1.78
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 XP32Q5T750 250 aa3.93□□□□□ -1.78
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 C7orf65Q6ZTY9 151 aa3.92□□□□□ -1.78
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa3.92□□□□□ -1.78
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa3.92□□□□□ -1.78
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CYSTM1Q9H1C7 97 aa3.91□□□□□ -1.78
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 FAT4Q6V0I7 4981 aa3.9□□□□□ -1.79
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa3.9□□□□□ -1.79
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa3.9□□□□□ -1.79
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 FAM236CP0DP71 79 aa3.9□□□□□ -1.79
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PCOTHQ58A44 107 aa3.89□□□□□ -1.79
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa3.88□□□□□ -1.79
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SPINK7P58062 85 aa3.87□□□□□ -1.79
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 HRES1P13985 223 aa3.85□□□□□ -1.79
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa3.85□□□□□ -1.79
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 RPS28P62857 69 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 A8MUN3 132 aa3.82□□□□□ -1.8
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ACYP2P14621 99 aa3.82□□□□□ -1.8
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SERP1Q9Y6X1 66 aa3.82□□□□□ -1.8
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 DMAC1Q96GE9 116 aa3.8□□□□□ -1.8
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 C4orf26Q17RF5 130 aa3.79□□□□□ -1.8
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 LCE2CQ5TA81 110 aa3.78□□□□□ -1.8
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa3.77□□□□□ -1.81
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 COX6B2Q6YFQ2 88 aa3.77□□□□□ -1.81
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa3.77□□□□□ -1.81
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa3.76□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms