RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560207.1

RABGGTA-215, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 678 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-215ENST00000560207 Q75L30 129 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTA-215ENST00000560207 UBL5Q9BZL1 73 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTA-215ENST00000560207 A0A0U1RQV1 116 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTA-215ENST00000560207 DEFB116Q30KQ4 102 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTA-215ENST00000560207 ACYP1P07311 99 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGGTA-215ENST00000560207 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTA-215ENST00000560207 BPY2O14599 106 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTA-215ENST00000560207 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTA-215ENST00000560207 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTA-215ENST00000560207 A8MUU9 505 aa6.49□□□□□ -1.37
RABGGTA-215ENST00000560207 DSCR10P59022 87 aa6.49□□□□□ -1.37
RABGGTA-215ENST00000560207 Q6ZVQ6 151 aa6.49□□□□□ -1.37
RABGGTA-215ENST00000560207 A0A1B0GV90 55 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGGTA-215ENST00000560207 PRR15Q8IV56 129 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGGTA-215ENST00000560207 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTA-215ENST00000560207 PCOTHQ58A44 107 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTA-215ENST00000560207 LINC00846Q9NV44 126 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTA-215ENST00000560207 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGGTA-215ENST00000560207 C8orf17Q9NRJ1 99 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGGTA-215ENST00000560207 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTA-215ENST00000560207 J3QR89 54 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGGTA-215ENST00000560207 CXCL6P80162 114 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGGTA-215ENST00000560207 MUC17Q685J3 4493 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTA-215ENST00000560207 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTA-215ENST00000560207 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
RABGGTA-215ENST00000560207 TMEM254Q8TBM7 123 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTA-215ENST00000560207 K7EQZ3 153 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGGTA-215ENST00000560207 hDV103S1A0JD37 113 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGGTA-215ENST00000560207 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGGTA-215ENST00000560207 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
RABGGTA-215ENST00000560207 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTA-215ENST00000560207 RNF213Q63HN8 5207 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTA-215ENST00000560207 CASC2Q6XLA1 102 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGGTA-215ENST00000560207 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
RABGGTA-215ENST00000560207 HCG22E2RYF7 251 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTA-215ENST00000560207 LINC00643Q86TS7 51 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTA-215ENST00000560207 MUC2Q02817 5179 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTA-215ENST00000560207 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTA-215ENST00000560207 NDUFS5O43920 106 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGGTA-215ENST00000560207 Q8N9L7 120 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGGTA-215ENST00000560207 WFDC13Q8IUB5 93 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGGTA-215ENST00000560207 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGGTA-215ENST00000560207 K7ERU9 68 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTA-215ENST00000560207 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
RABGGTA-215ENST00000560207 COX6B2Q6YFQ2 88 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGGTA-215ENST00000560207 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGGTA-215ENST00000560207 SPINK7P58062 85 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGGTA-215ENST00000560207 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTA-215ENST00000560207 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTA-215ENST00000560207 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
RABGGTA-215ENST00000560207 IMUPQ9GZP8 106 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTA-215ENST00000560207 FAT4Q6V0I7 4981 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTA-215ENST00000560207 HRES1P13985 223 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTA-215ENST00000560207 LCE2CQ5TA81 110 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTA-215ENST00000560207 MPLKIPQ8TAP9 179 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTA-215ENST00000560207 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTA-215ENST00000560207 FAM236CP0DP71 79 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTA-215ENST00000560207 Q5W150 140 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTA-215ENST00000560207 UQCRQO14949 82 aa6.12□□□□□ -1.43
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RABGGTA-215ENST00000560207 IGKV2-30P06310 120 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTA-215ENST00000560207 TRAV22A0A0B4J277 110 aa6.1□□□□□ -1.43
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RABGGTA-215ENST00000560207 M0R2T5 61 aa6.06□□□□□ -1.44
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RABGGTA-215ENST00000560207 C5orf47Q569G3 176 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGGTA-215ENST00000560207 SMIM20Q8N5G0 67 aa6.04□□□□□ -1.44
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RABGGTA-215ENST00000560207 H3BPC8 53 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGGTA-215ENST00000560207 OCR1Q9BZK8 76 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGGTA-215ENST00000560207 H0Y9P7 68 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGGTA-215ENST00000560207 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGGTA-215ENST00000560207 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa6□□□□□ -1.45
RABGGTA-215ENST00000560207 MT-ATP8P03928 68 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTA-215ENST00000560207 C1orf64Q8NEQ6 169 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGGTA-215ENST00000560207 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
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RABGGTA-215ENST00000560207 LINC00208Q96KT6 92 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGGTA-215ENST00000560207 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGGTA-215ENST00000560207 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGGTA-215ENST00000560207 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
RABGGTA-215ENST00000560207 TRAV7A0A075B6U4 112 aa5.92□□□□□ -1.46
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RABGGTA-215ENST00000560207 A8MUN3 132 aa5.9□□□□□ -1.46
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RABGGTA-215ENST00000560207 S4R3F8 94 aa5.84□□□□□ -1.47
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RABGGTA-215ENST00000560207 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
RABGGTA-215ENST00000560207 CSAG1Q6PB30 78 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGGTA-215ENST00000560207 KLKP1Q107X0 134 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGGTA-215ENST00000560207 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa5.79□□□□□ -1.48
RABGGTA-215ENST00000560207 LCA10Q71F78 164 aa5.76□□□□□ -1.49
RABGGTA-215ENST00000560207 NDUFC1O43677 76 aa5.75□□□□□ -1.49
RABGGTA-215ENST00000560207 DMAC1Q96GE9 116 aa5.74□□□□□ -1.49
RABGGTA-215ENST00000560207 MT2AP02795 61 aa5.73□□□□□ -1.49
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