RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495082.5

SLC13A3-211, Transcript of solute carrier family 13 member 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC13A3, Length 1,887 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A3-211ENST00000495082 CCDC179H3BU77 68 aa6.58□□□□□ -1.36
SLC13A3-211ENST00000495082 Q96NJ1 140 aa6.58□□□□□ -1.36
SLC13A3-211ENST00000495082 DEFB116Q30KQ4 102 aa6.57□□□□□ -1.36
SLC13A3-211ENST00000495082 K7EQZ3 153 aa6.56□□□□□ -1.36
SLC13A3-211ENST00000495082 COX7CP15954 63 aa6.56□□□□□ -1.36
SLC13A3-211ENST00000495082 SERP2Q8N6R1 65 aa6.55□□□□□ -1.36
SLC13A3-211ENST00000495082 J3KT08 172 aa6.54□□□□□ -1.36
SLC13A3-211ENST00000495082 UQCRQO14949 82 aa6.54□□□□□ -1.36
SLC13A3-211ENST00000495082 C1orf195Q5TG92 126 aa6.54□□□□□ -1.36
SLC13A3-211ENST00000495082 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
SLC13A3-211ENST00000495082 J3QL48 77 aa6.53□□□□□ -1.36
SLC13A3-211ENST00000495082 SMIM20Q8N5G0 67 aa6.51□□□□□ -1.37
SLC13A3-211ENST00000495082 TRAV7A0A075B6U4 112 aa6.49□□□□□ -1.37
SLC13A3-211ENST00000495082 A8MWP4 228 aa6.49□□□□□ -1.37
SLC13A3-211ENST00000495082 PRR15Q8IV56 129 aa6.48□□□□□ -1.37
SLC13A3-211ENST00000495082 HCG22E2RYF7 251 aa6.47□□□□□ -1.37
SLC13A3-211ENST00000495082 NDUFB1O75438 58 aa6.47□□□□□ -1.37
SLC13A3-211ENST00000495082 OCR1Q9BZK8 76 aa6.46□□□□□ -1.38
SLC13A3-211ENST00000495082 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
SLC13A3-211ENST00000495082 RETNLBQ9BQ08 111 aa6.45□□□□□ -1.38
SLC13A3-211ENST00000495082 A0A1B0GVX0 72 aa6.45□□□□□ -1.38
SLC13A3-211ENST00000495082 WFDC13Q8IUB5 93 aa6.43□□□□□ -1.38
SLC13A3-211ENST00000495082 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa6.42□□□□□ -1.38
SLC13A3-211ENST00000495082 C20orf197Q8N268 126 aa6.42□□□□□ -1.38
SLC13A3-211ENST00000495082 CASC2Q6XLA1 102 aa6.41□□□□□ -1.38
SLC13A3-211ENST00000495082 CYSTM1Q9H1C7 97 aa6.41□□□□□ -1.38
SLC13A3-211ENST00000495082 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa6.4□□□□□ -1.39
SLC13A3-211ENST00000495082 C8orf87E5RJ46 101 aa6.4□□□□□ -1.39
SLC13A3-211ENST00000495082 C8orf17Q9NRJ1 99 aa6.39□□□□□ -1.39
SLC13A3-211ENST00000495082 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6.38□□□□□ -1.39
SLC13A3-211ENST00000495082 KLKP1Q107X0 134 aa6.38□□□□□ -1.39
SLC13A3-211ENST00000495082 HERC1Q15751 4861 aa6.38□□□□□ -1.39
SLC13A3-211ENST00000495082 LINC00313P59037 77 aa6.37□□□□□ -1.39
SLC13A3-211ENST00000495082 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa6.37□□□□□ -1.39
SLC13A3-211ENST00000495082 hDV103S1A0JD37 113 aa6.36□□□□□ -1.39
SLC13A3-211ENST00000495082 SNURFQ9Y675 71 aa6.36□□□□□ -1.39
SLC13A3-211ENST00000495082 PRR4Q16378 134 aa6.36□□□□□ -1.39
SLC13A3-211ENST00000495082 TMEM254Q8TBM7 123 aa6.36□□□□□ -1.39
SLC13A3-211ENST00000495082 A0A0U1RQV1 116 aa6.33□□□□□ -1.4
SLC13A3-211ENST00000495082 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.33□□□□□ -1.4
SLC13A3-211ENST00000495082 C5orf47Q569G3 176 aa6.33□□□□□ -1.4
SLC13A3-211ENST00000495082 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa6.32□□□□□ -1.4
SLC13A3-211ENST00000495082 H7BZZ5 65 aa6.32□□□□□ -1.4
SLC13A3-211ENST00000495082 TPRXLQ17RH7 258 aa6.32□□□□□ -1.4
SLC13A3-211ENST00000495082 C9orf92A6NGG3 77 aa6.31□□□□□ -1.4
SLC13A3-211ENST00000495082 TMEM258P61165 79 aa6.31□□□□□ -1.4
SLC13A3-211ENST00000495082 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
SLC13A3-211ENST00000495082 NDUFC1O43677 76 aa6.3□□□□□ -1.4
SLC13A3-211ENST00000495082 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
SLC13A3-211ENST00000495082 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa6.28□□□□□ -1.4
SLC13A3-211ENST00000495082 MP68P56378 58 aa6.27□□□□□ -1.41
SLC13A3-211ENST00000495082 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
SLC13A3-211ENST00000495082 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa6.27□□□□□ -1.41
SLC13A3-211ENST00000495082 H0Y9P7 68 aa6.26□□□□□ -1.41
SLC13A3-211ENST00000495082 NDUFS5O43920 106 aa6.26□□□□□ -1.41
SLC13A3-211ENST00000495082 A8MUU9 505 aa6.25□□□□□ -1.41
SLC13A3-211ENST00000495082 LPAP08519 4548 aa6.25□□□□□ -1.41
SLC13A3-211ENST00000495082 TRAV22A0A0B4J277 110 aa6.24□□□□□ -1.41
SLC13A3-211ENST00000495082 XP32Q5T750 250 aa6.24□□□□□ -1.41
SLC13A3-211ENST00000495082 Q75L30 129 aa6.24□□□□□ -1.41
SLC13A3-211ENST00000495082 LINC00208Q96KT6 92 aa6.24□□□□□ -1.41
SLC13A3-211ENST00000495082 HMCN2Q8NDA2 5059 aa6.23□□□□□ -1.41
SLC13A3-211ENST00000495082 H3BPC8 53 aa6.23□□□□□ -1.41
SLC13A3-211ENST00000495082 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa6.22□□□□□ -1.41
SLC13A3-211ENST00000495082 FAM236CP0DP71 79 aa6.22□□□□□ -1.41
SLC13A3-211ENST00000495082 C1orf64Q8NEQ6 169 aa6.2□□□□□ -1.42
SLC13A3-211ENST00000495082 RPL37P61927 97 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
SLC13A3-211ENST00000495082 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
SLC13A3-211ENST00000495082 Q5W150 140 aa6.17□□□□□ -1.42
SLC13A3-211ENST00000495082 LRP2P98164 4655 aa6.16□□□□□ -1.42
SLC13A3-211ENST00000495082 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
SLC13A3-211ENST00000495082 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa6.14□□□□□ -1.43
SLC13A3-211ENST00000495082 SERP1Q9Y6X1 66 aa6.11□□□□□ -1.43
SLC13A3-211ENST00000495082 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa6.1□□□□□ -1.43
SLC13A3-211ENST00000495082 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa6.1□□□□□ -1.43
SLC13A3-211ENST00000495082 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
SLC13A3-211ENST00000495082 PCOTHQ58A44 107 aa6.09□□□□□ -1.44
SLC13A3-211ENST00000495082 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa6.08□□□□□ -1.44
SLC13A3-211ENST00000495082 IGKV2-30P06310 120 aa6.05□□□□□ -1.44
SLC13A3-211ENST00000495082 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.02□□□□□ -1.44
SLC13A3-211ENST00000495082 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa6.02□□□□□ -1.45
SLC13A3-211ENST00000495082 MUC17Q685J3 4493 aa6.01□□□□□ -1.45
SLC13A3-211ENST00000495082 SPINK7P58062 85 aa6.01□□□□□ -1.45
SLC13A3-211ENST00000495082 UBR4Q5T4S7 5183 aa5.99□□□□□ -1.45
SLC13A3-211ENST00000495082 HRES1P13985 223 aa5.98□□□□□ -1.45
SLC13A3-211ENST00000495082 SMIM26A0A096LP01 95 aa5.97□□□□□ -1.45
SLC13A3-211ENST00000495082 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa5.94□□□□□ -1.46
SLC13A3-211ENST00000495082 COA5Q86WW8 74 aa5.92□□□□□ -1.46
SLC13A3-211ENST00000495082 DMAC1Q96GE9 116 aa5.9□□□□□ -1.46
SLC13A3-211ENST00000495082 ACYP2P14621 99 aa5.89□□□□□ -1.47
SLC13A3-211ENST00000495082 MPLKIPQ8TAP9 179 aa5.89□□□□□ -1.47
SLC13A3-211ENST00000495082 MUC2Q02817 5179 aa5.89□□□□□ -1.47
SLC13A3-211ENST00000495082 RNF213Q63HN8 5207 aa5.87□□□□□ -1.47
SLC13A3-211ENST00000495082 C4orf26Q17RF5 130 aa5.87□□□□□ -1.47
SLC13A3-211ENST00000495082 COX6B2Q6YFQ2 88 aa5.84□□□□□ -1.47
SLC13A3-211ENST00000495082 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa5.84□□□□□ -1.47
SLC13A3-211ENST00000495082 Q1T7F1 81 aa5.83□□□□□ -1.48
SLC13A3-211ENST00000495082 A8MUN3 132 aa5.81□□□□□ -1.48
SLC13A3-211ENST00000495082 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa5.81□□□□□ -1.48
SLC13A3-211ENST00000495082 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa5.79□□□□□ -1.48
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