RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489895.5

NISCH-213, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 5,350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-213ENST00000489895 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
NISCH-213ENST00000489895 EYSQ5T1H1 3165 aa9.46□□□□□ -0.9
NISCH-213ENST00000489895 VCANP13611 3396 aa9.46□□□□□ -0.9
NISCH-213ENST00000489895 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa9.45□□□□□ -0.9
NISCH-213ENST00000489895 NBEAQ8NFP9 2946 aa9.43□□□□□ -0.9
NISCH-213ENST00000489895 ZZEF1O43149 2961 aa9.43□□□□□ -0.9
NISCH-213ENST00000489895 A8MUU9 505 aa9.43□□□□□ -0.9
NISCH-213ENST00000489895 REV3LO60673 3130 aa9.4□□□□□ -0.9
NISCH-213ENST00000489895 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa9.4□□□□□ -0.9
NISCH-213ENST00000489895 COL6A3P12111 3177 aa9.34□□□□□ -0.91
NISCH-213ENST00000489895 CELSR2Q9HCU4 2923 aa9.33□□□□□ -0.92
NISCH-213ENST00000489895 FREM2Q5SZK8 3169 aa9.33□□□□□ -0.92
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa9.32□□□□□ -0.92
NISCH-213ENST00000489895 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
NISCH-213ENST00000489895 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa9.29□□□□□ -0.92
NISCH-213ENST00000489895 ZANQ9Y493 2812 aa9.29□□□□□ -0.92
NISCH-213ENST00000489895 A0A0A0MQY5 61 aa9.27□□□□□ -0.93
NISCH-213ENST00000489895 DNAH14Q0VDD8 3507 aa9.26□□□□□ -0.93
NISCH-213ENST00000489895 DCHS2Q6V1P9 2916 aa9.26□□□□□ -0.93
NISCH-213ENST00000489895 A8MU10 97 aa9.22□□□□□ -0.93
NISCH-213ENST00000489895 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.93
NISCH-213ENST00000489895 A6NN06 94 aa9.21□□□□□ -0.93
NISCH-213ENST00000489895 DMXL1Q9Y485 3027 aa9.18□□□□□ -0.94
NISCH-213ENST00000489895 XP32Q5T750 250 aa9.18□□□□□ -0.94
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa9.14□□□□□ -0.95
NISCH-213ENST00000489895 TPRXLQ17RH7 258 aa9.13□□□□□ -0.95
NISCH-213ENST00000489895 USP34Q70CQ2 3546 aa9.12□□□□□ -0.95
NISCH-213ENST00000489895 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa9.08□□□□□ -0.96
NISCH-213ENST00000489895 NF1P21359 2839 aa9.07□□□□□ -0.96
NISCH-213ENST00000489895 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
NISCH-213ENST00000489895 TNP1P09430 55 aa9.04□□□□□ -0.96
NISCH-213ENST00000489895 H3BS24 57 aa9.02□□□□□ -0.97
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa8.99□□□□□ -0.97
NISCH-213ENST00000489895 FBN2P35556 2912 aa8.99□□□□□ -0.97
NISCH-213ENST00000489895 TENM1Q9UKZ4 2725 aa8.95□□□□□ -0.98
NISCH-213ENST00000489895 A0A1B0GVY2 172 aa8.94□□□□□ -0.98
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa8.94□□□□□ -0.98
NISCH-213ENST00000489895 TENM3Q9P273 2699 aa8.93□□□□□ -0.98
NISCH-213ENST00000489895 MXRA5Q9NR99 2828 aa8.92□□□□□ -0.98
NISCH-213ENST00000489895 TENM2Q9NT68 2774 aa8.89□□□□□ -0.99
NISCH-213ENST00000489895 SPEGQ15772 3267 aa8.88□□□□□ -0.99
NISCH-213ENST00000489895 LOC400499M0QZD8 3231 aa8.87□□□□□ -0.99
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP10-8P60410 259 aa8.87□□□□□ -0.99
NISCH-213ENST00000489895 PP632Q6XCG6 107 aa8.83□□□□□ -1
NISCH-213ENST00000489895 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa8.81□□□□□ -1
NISCH-213ENST00000489895 H0YAA0 97 aa8.74□□□□□ -1.01
NISCH-213ENST00000489895 PDZD2O15018 2839 aa8.73□□□□□ -1.01
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP10-10P60014 251 aa8.71□□□□□ -1.02
NISCH-213ENST00000489895 PRO2289Q9P1D8 64 aa8.63□□□□□ -1.03
NISCH-213ENST00000489895 NDUFAF8A1L188 74 aa8.61□□□□□ -1.03
NISCH-213ENST00000489895 C10orf95Q9H7T3 257 aa8.6□□□□□ -1.03
NISCH-213ENST00000489895 P0C880 135 aa8.59□□□□□ -1.03
NISCH-213ENST00000489895 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa8.58□□□□□ -1.04
NISCH-213ENST00000489895 TGP01266 2768 aa8.57□□□□□ -1.04
NISCH-213ENST00000489895 MYO15AQ9UKN7 3530 aa8.5□□□□□ -1.05
NISCH-213ENST00000489895 DCHS1Q96JQ0 3298 aa8.49□□□□□ -1.05
NISCH-213ENST00000489895 RELNP78509 3460 aa8.48□□□□□ -1.05
NISCH-213ENST00000489895 OTOGQ6ZRI0 2925 aa8.47□□□□□ -1.05
NISCH-213ENST00000489895 VWFP04275 2813 aa8.4□□□□□ -1.07
NISCH-213ENST00000489895 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa8.38□□□□□ -1.07
NISCH-213ENST00000489895 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
NISCH-213ENST00000489895 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa8.25□□□□□ -1.09
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa8.23□□□□□ -1.09
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP12-2P59991 146 aa8.21□□□□□ -1.09
NISCH-213ENST00000489895 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa8.16□□□□□ -1.1
NISCH-213ENST00000489895 LAMA5O15230 3695 aa8.15□□□□□ -1.1
NISCH-213ENST00000489895 ASPMQ8IZT6 3477 aa8.15□□□□□ -1.11
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP12-1P59990 96 aa8.15□□□□□ -1.11
NISCH-213ENST00000489895 MT1HL1P0DM35 61 aa8.11□□□□□ -1.11
NISCH-213ENST00000489895 ZFHX3Q15911 3703 aa8.06□□□□□ -1.12
NISCH-213ENST00000489895 ZFHX4Q86UP3 3567 aa8.05□□□□□ -1.12
NISCH-213ENST00000489895 FBN3Q75N90 2809 aa8.04□□□□□ -1.12
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
NISCH-213ENST00000489895 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
NISCH-213ENST00000489895 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa7.94□□□□□ -1.14
NISCH-213ENST00000489895 MUC3AQ02505 3323 aa7.93□□□□□ -1.14
NISCH-213ENST00000489895 DMDP11532 3685 aa7.89□□□□□ -1.15
NISCH-213ENST00000489895 CSMD1Q96PZ7 3565 aa7.86□□□□□ -1.15
NISCH-213ENST00000489895 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
NISCH-213ENST00000489895 COL7A1Q02388 2944 aa7.79□□□□□ -1.16
NISCH-213ENST00000489895 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa7.79□□□□□ -1.16
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa7.77□□□□□ -1.17
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa7.74□□□□□ -1.17
NISCH-213ENST00000489895 CSMD2Q7Z408 3487 aa7.74□□□□□ -1.17
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa7.73□□□□□ -1.17
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa7.72□□□□□ -1.17
NISCH-213ENST00000489895 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
NISCH-213ENST00000489895 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
NISCH-213ENST00000489895 ALMS1Q8TCU4 4167 aa7.62□□□□□ -1.19
NISCH-213ENST00000489895 SVEP1Q4LDE5 3571 aa7.61□□□□□ -1.19
NISCH-213ENST00000489895 BSNQ9UPA5 3926 aa7.57□□□□□ -1.2
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP10-12P60413 245 aa7.53□□□□□ -1.2
NISCH-213ENST00000489895 CUBNO60494 3623 aa7.49□□□□□ -1.21
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP23-1A1A580 65 aa7.42□□□□□ -1.22
NISCH-213ENST00000489895 DNAH9Q9NYC9 4486 aa7.37□□□□□ -1.23
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP12-3P60328 96 aa7.3□□□□□ -1.24
NISCH-213ENST00000489895 DNAH5Q8TE73 4624 aa7.28□□□□□ -1.24
NISCH-213ENST00000489895 LORP23490 312 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71 ms