RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-209ENST00000442510 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-209ENST00000442510 CHD9Q3L8U1 2897 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-209ENST00000442510 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
PTPRC-209ENST00000442510 XP32Q5T750 250 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRC-209ENST00000442510 FRYLO94915 3013 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRC-209ENST00000442510 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
PTPRC-209ENST00000442510 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRC-209ENST00000442510 KRTAP10-3P60369 221 aa2.84□□□□□ -1.96
PTPRC-209ENST00000442510 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
PTPRC-209ENST00000442510 STAB1Q9NY15 2570 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRC-209ENST00000442510 COL6A5A8TX70 2615 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRC-209ENST00000442510 KRTAP12-1P59990 96 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRC-209ENST00000442510 LAMA1P25391 3075 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRC-209ENST00000442510 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
PTPRC-209ENST00000442510 ASPMQ8IZT6 3477 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRC-209ENST00000442510 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRC-209ENST00000442510 ZFHX4Q86UP3 3567 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRC-209ENST00000442510 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRC-209ENST00000442510 LOC400499M0QZD8 3231 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRC-209ENST00000442510 KALRNO60229 2985 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRC-209ENST00000442510 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
PTPRC-209ENST00000442510 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa2.77□□□□□ -1.97
PTPRC-209ENST00000442510 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa2.77□□□□□ -1.97
PTPRC-209ENST00000442510 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
PTPRC-209ENST00000442510 RPS29P62273 56 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
PTPRC-209ENST00000442510 DMXL1Q9Y485 3027 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRC-209ENST00000442510 APCP25054 2843 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRC-209ENST00000442510 Q5VSD8 79 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRC-209ENST00000442510 FRYQ5TBA9 3013 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRC-209ENST00000442510 DCHS1Q96JQ0 3298 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRC-209ENST00000442510 TGP01266 2768 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRC-209ENST00000442510 TEX15Q9BXT5 2789 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRC-209ENST00000442510 IGSF10Q6WRI0 2623 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRC-209ENST00000442510 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRC-209ENST00000442510 FLNCQ14315 2725 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRC-209ENST00000442510 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRC-209ENST00000442510 HIVEP1P15822 2718 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRC-209ENST00000442510 KRTAP1-1Q07627 177 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-209ENST00000442510 LAMA5O15230 3695 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF292O60281 2723 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-209ENST00000442510 COL12A1Q99715 3063 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRC-209ENST00000442510 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP2.7□□□□□ -1.98
PTPRC-209ENST00000442510 M0R2T5 61 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRC-209ENST00000442510 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
PTPRC-209ENST00000442510 BSNQ9UPA5 3926 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRC-209ENST00000442510 ZZEF1O43149 2961 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRC-209ENST00000442510 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRC-209ENST00000442510 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRC-209ENST00000442510 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.98
PTPRC-209ENST00000442510 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRC-209ENST00000442510 TACC2O95359 2948 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRC-209ENST00000442510 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-209ENST00000442510 KRTAP10-1P60331 282 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-209ENST00000442510 KRTAP10-2P60368 255 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-209ENST00000442510 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-209ENST00000442510 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-209ENST00000442510 NF1P21359 2839 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-209ENST00000442510 ATMQ13315 3056 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-209ENST00000442510 ITPR2Q14571 2701 aa2.58□□□□□ -2
PTPRC-209ENST00000442510 RELNP78509 3460 aa2.57□□□□□ -2
PTPRC-209ENST00000442510 PDZD2O15018 2839 aa2.56□□□□□ -2
PTPRC-209ENST00000442510 TENM4Q6N022 2769 aa2.56□□□□□ -2
PTPRC-209ENST00000442510 LOC100996750A0A140TA64 210 aa2.54□□□□□ -2
PTPRC-209ENST00000442510 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa2.54□□□□□ -2
PTPRC-209ENST00000442510 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP2.53□□□□□ -2
PTPRC-209ENST00000442510 DCHS2Q6V1P9 2916 aa2.53□□□□□ -2
PTPRC-209ENST00000442510 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa2.52□□□□□ -2.01
PTPRC-209ENST00000442510 TENM2Q9NT68 2774 aa2.52□□□□□ -2.01
PTPRC-209ENST00000442510 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa2.52□□□□□ -2.01
PTPRC-209ENST00000442510 CSMD2Q7Z408 3487 aa2.51□□□□□ -2.01
PTPRC-209ENST00000442510 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRC-209ENST00000442510 SVEP1Q4LDE5 3571 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRC-209ENST00000442510 CSMD1Q96PZ7 3565 aa2.47□□□□□ -2.01
PTPRC-209ENST00000442510 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa2.47□□□□□ -2.01
PTPRC-209ENST00000442510 OTOGQ6ZRI0 2925 aa2.46□□□□□ -2.02
PTPRC-209ENST00000442510 TENM3Q9P273 2699 aa2.46□□□□□ -2.02
PTPRC-209ENST00000442510 TENM1Q9UKZ4 2725 aa2.45□□□□□ -2.02
PTPRC-209ENST00000442510 VPS13CQ709C8 3753 aa2.45□□□□□ -2.02
PTPRC-209ENST00000442510 ZANQ9Y493 2812 aa2.43□□□□□ -2.02
PTPRC-209ENST00000442510 COL7A1Q02388 2944 aa2.43□□□□□ -2.02
PTPRC-209ENST00000442510 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa2.42□□□□□ -2.02
PTPRC-209ENST00000442510 MXRA5Q9NR99 2828 aa2.4□□□□□ -2.03
PTPRC-209ENST00000442510 ALMS1Q8TCU4 4167 aa2.4□□□□□ -2.03
PTPRC-209ENST00000442510 CUBNO60494 3623 aa2.39□□□□□ -2.03
PTPRC-209ENST00000442510 LCE2BO14633 110 aa2.37□□□□□ -2.03
PTPRC-209ENST00000442510 A0A1B0GVY2 172 aa2.37□□□□□ -2.03
PTPRC-209ENST00000442510 FBN2P35556 2912 aa2.34□□□□□ -2.03
PTPRC-209ENST00000442510 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa2.34□□□□□ -2.03
PTPRC-209ENST00000442510 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa2.34□□□□□ -2.04
PTPRC-209ENST00000442510 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP2.31□□□□□ -2.04
PTPRC-209ENST00000442510 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
PTPRC-209ENST00000442510 VWFP04275 2813 aa2.31□□□□□ -2.04
PTPRC-209ENST00000442510 KRTAP12-3P60328 96 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
PTPRC-209ENST00000442510 LCE3AQ5TA76 89 aa2.28□□□□□ -2.04
PTPRC-209ENST00000442510 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
PTPRC-209ENST00000442510 FBN3Q75N90 2809 aa2.27□□□□□ -2.05
PTPRC-209ENST00000442510 KRTAP10-10P60014 251 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-209ENST00000442510 AKAP9Q99996 3911 aa2.26□□□□□ -2.05
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