RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423048.5

ALMS1-201, Transcript of ALMS1, centrosome and basal body associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ALMS1, Length 5,194 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALMS1-201ENST00000423048 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
ALMS1-201ENST00000423048 INE1O15225 51 aa3.47□□□□□ -1.85
ALMS1-201ENST00000423048 KRTAP12-1P59990 96 aa3.47□□□□□ -1.85
ALMS1-201ENST00000423048 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa3.46□□□□□ -1.86
ALMS1-201ENST00000423048 HTTP42858 3142 aa3.46□□□□□ -1.86
ALMS1-201ENST00000423048 APCP25054 2843 aa3.46□□□□□ -1.86
ALMS1-201ENST00000423048 CHD7Q9P2D1 2997 aa3.45□□□□□ -1.86
ALMS1-201ENST00000423048 SZT2Q5T011 3432 aa3.44□□□□□ -1.86
ALMS1-201ENST00000423048 LAMA3Q16787 3333 aa3.43□□□□□ -1.86
ALMS1-201ENST00000423048 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa3.42□□□□□ -1.86
ALMS1-201ENST00000423048 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
ALMS1-201ENST00000423048 TENM2Q9NT68 2774 aa3.42□□□□□ -1.86
ALMS1-201ENST00000423048 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa3.41□□□□□ -1.86
ALMS1-201ENST00000423048 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
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ALMS1-201ENST00000423048 MUC3AQ02505 3323 aa3.39□□□□□ -1.87
ALMS1-201ENST00000423048 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa3.38□□□□□ -1.87
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ALMS1-201ENST00000423048 EYSQ5T1H1 3165 aa3.38□□□□□ -1.87
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ALMS1-201ENST00000423048 KRTAP12-2P59991 146 aa3.37□□□□□ -1.87
ALMS1-201ENST00000423048 MGAQ8IWI9 3026 aa3.36□□□□□ -1.87
ALMS1-201ENST00000423048 FRYLO94915 3013 aa3.36□□□□□ -1.87
ALMS1-201ENST00000423048 TENM3Q9P273 2699 aa3.36□□□□□ -1.87
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ALMS1-201ENST00000423048 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
ALMS1-201ENST00000423048 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
ALMS1-201ENST00000423048 FRYQ5TBA9 3013 aa3.32□□□□□ -1.88
ALMS1-201ENST00000423048 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa3.31□□□□□ -1.88
ALMS1-201ENST00000423048 NBEAQ8NFP9 2946 aa3.3□□□□□ -1.88
ALMS1-201ENST00000423048 TRIOO75962 3097 aa3.3□□□□□ -1.88
ALMS1-201ENST00000423048 MT1HL1P0DM35 61 aa3.3□□□□□ -1.88
ALMS1-201ENST00000423048 MXRA5Q9NR99 2828 aa3.29□□□□□ -1.88
ALMS1-201ENST00000423048 NF1P21359 2839 aa3.28□□□□□ -1.88
ALMS1-201ENST00000423048 OTOGQ6ZRI0 2925 aa3.28□□□□□ -1.88
ALMS1-201ENST00000423048 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa3.27□□□□□ -1.89
ALMS1-201ENST00000423048 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa3.27□□□□□ -1.89
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ALMS1-201ENST00000423048 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa3.27□□□□□ -1.89
ALMS1-201ENST00000423048 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
ALMS1-201ENST00000423048 COL12A1Q99715 3063 aa3.25□□□□□ -1.89
ALMS1-201ENST00000423048 CELSR2Q9HCU4 2923 aa3.24□□□□□ -1.89
ALMS1-201ENST00000423048 TGP01266 2768 aa3.24□□□□□ -1.89
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ALMS1-201ENST00000423048 DMXL1Q9Y485 3027 aa3.23□□□□□ -1.89
ALMS1-201ENST00000423048 BRCA2P51587 3418 aa3.23□□□□□ -1.89
ALMS1-201ENST00000423048 ALMS1Q8TCU4 4167 aa3.23□□□□□ -1.89
ALMS1-201ENST00000423048 VCANP13611 3396 aa3.23□□□□□ -1.89
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ALMS1-201ENST00000423048 KRTAP10-12P60413 245 aa3.13□□□□□ -1.91
ALMS1-201ENST00000423048 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
ALMS1-201ENST00000423048 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa3.12□□□□□ -1.91
ALMS1-201ENST00000423048 ATMQ13315 3056 aa3.12□□□□□ -1.91
ALMS1-201ENST00000423048 ZFHX3Q15911 3703 aa3.11□□□□□ -1.91
ALMS1-201ENST00000423048 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa3.11□□□□□ -1.91
ALMS1-201ENST00000423048 ZZEF1O43149 2961 aa3.09□□□□□ -1.91
ALMS1-201ENST00000423048 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa3.09□□□□□ -1.91
ALMS1-201ENST00000423048 DCHS1Q96JQ0 3298 aa3.09□□□□□ -1.91
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ALMS1-201ENST00000423048 USP34Q70CQ2 3546 aa3.06□□□□□ -1.92
ALMS1-201ENST00000423048 KRTAP12-3P60328 96 aa3.05□□□□□ -1.92
ALMS1-201ENST00000423048 SPRR2GQ9BYE4 73 aa3.05□□□□□ -1.92
ALMS1-201ENST00000423048 DNAH10Q8IVF4 4471 aa3.05□□□□□ -1.92
ALMS1-201ENST00000423048 CRCT1Q9UGL9 99 aa3.04□□□□□ -1.92
ALMS1-201ENST00000423048 DCHS2Q6V1P9 2916 aa3.03□□□□□ -1.92
ALMS1-201ENST00000423048 CDH23Q9H251 3354 aa3.03□□□□□ -1.92
ALMS1-201ENST00000423048 DMDP11532 3685 aa3□□□□□ -1.93
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ALMS1-201ENST00000423048 XIRP2A4UGR9 3374 aa2.99□□□□□ -1.93
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ALMS1-201ENST00000423048 DNAH1Q9P2D7 4330 aa2.98□□□□□ -1.93
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ALMS1-201ENST00000423048 LOC400499M0QZD8 3231 aa2.93□□□□□ -1.94
ALMS1-201ENST00000423048 ASPMQ8IZT6 3477 aa2.93□□□□□ -1.94
ALMS1-201ENST00000423048 DNAH6Q9C0G6 4158 aa2.93□□□□□ -1.94
ALMS1-201ENST00000423048 HERC1Q15751 4861 aa2.93□□□□□ -1.94
ALMS1-201ENST00000423048 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
ALMS1-201ENST00000423048 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa2.92□□□□□ -1.94
ALMS1-201ENST00000423048 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa2.91□□□□□ -1.94
ALMS1-201ENST00000423048 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa2.91□□□□□ -1.94
ALMS1-201ENST00000423048 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa2.9□□□□□ -1.95
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