RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423048.5

ALMS1-201, Transcript of ALMS1, centrosome and basal body associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ALMS1, Length 5,194 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALMS1-201ENST00000423048 NISCHQ9Y2I1 1504 aa12.8□□□□□ -0.36
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ALMS1-201ENST00000423048 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
ALMS1-201ENST00000423048 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
ALMS1-201ENST00000423048 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa11.1□□□□□ -0.63
ALMS1-201ENST00000423048 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
ALMS1-201ENST00000423048 MYT1Q01538 1121 aa11.04□□□□□ -0.64
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ALMS1-201ENST00000423048 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
ALMS1-201ENST00000423048 MYO15BQ96JP2 1530 aa10.59□□□□□ -0.71
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ALMS1-201ENST00000423048 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
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ALMS1-201ENST00000423048 CEP164Q9UPV0 1460 aa10.02□□□□□ -0.8
ALMS1-201ENST00000423048 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
ALMS1-201ENST00000423048 SMARCA2P51531 1590 aa10.01□□□□□ -0.81
ALMS1-201ENST00000423048 TNIKQ9UKE5 1360 aa10□□□□□ -0.81
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ALMS1-201ENST00000423048 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
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ALMS1-201ENST00000423048 SLC24A1O60721 1099 aa9.93□□□□□ -0.82
ALMS1-201ENST00000423048 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
ALMS1-201ENST00000423048 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
ALMS1-201ENST00000423048 KIF27Q86VH2 1401 aa9.92□□□□□ -0.82
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ALMS1-201ENST00000423048 FHAD1B1AJZ9 1412 aa9.91□□□□□ -0.82
ALMS1-201ENST00000423048 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.83
ALMS1-201ENST00000423048 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP9.89□□□□□ -0.83
ALMS1-201ENST00000423048 ABCC8Q09428 1581 aa9.86□□□□□ -0.83
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ALMS1-201ENST00000423048 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa9.81□□□□□ -0.84
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ALMS1-201ENST00000423048 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
ALMS1-201ENST00000423048 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
ALMS1-201ENST00000423048 TONSLQ96HA7 1378 aa9.77□□□□□ -0.84
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ALMS1-201ENST00000423048 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
ALMS1-201ENST00000423048 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
ALMS1-201ENST00000423048 TRIM52Q96A61 297 aa9.7□□□□□ -0.86
ALMS1-201ENST00000423048 VPS8Q8N3P4 1428 aa9.7□□□□□ -0.86
ALMS1-201ENST00000423048 MTUS2Q5JR59 1369 aa9.69□□□□□ -0.86
ALMS1-201ENST00000423048 FMN1Q68DA7 1419 aa9.69□□□□□ -0.86
ALMS1-201ENST00000423048 ANP32EQ9BTT0 268 aa9.69□□□□□ -0.86
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ALMS1-201ENST00000423048 SMARCA4P51532 1647 aa9.68□□□□□ -0.86
ALMS1-201ENST00000423048 PDS5BQ9NTI5 1447 aa9.67□□□□□ -0.86
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ALMS1-201ENST00000423048 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
ALMS1-201ENST00000423048 CFAP44Q96MT7 982 aa9.62□□□□□ -0.87
ALMS1-201ENST00000423048 NEUROD1Q13562 356 aa9.61□□□□□ -0.87
ALMS1-201ENST00000423048 RSPH4AQ5TD94 716 aa9.61□□□□□ -0.87
ALMS1-201ENST00000423048 TSPY4P0CV99 314 aa9.61□□□□□ -0.87
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ALMS1-201ENST00000423048 ITGAEP38570 1179 aa9.6□□□□□ -0.87
ALMS1-201ENST00000423048 CCDC88BA6NC98 1476 aa9.6□□□□□ -0.87
ALMS1-201ENST00000423048 CCER2I3L3R5 266 aa9.6□□□□□ -0.87
ALMS1-201ENST00000423048 MROH2BQ7Z745 1585 aa9.59□□□□□ -0.87
ALMS1-201ENST00000423048 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa9.58□□□□□ -0.88
ALMS1-201ENST00000423048 CCNB3Q8WWL7 1395 aa9.57□□□□□ -0.88
ALMS1-201ENST00000423048 STAC3Q96MF2 364 aa9.57□□□□□ -0.88
ALMS1-201ENST00000423048 KIF21BO75037 1637 aa9.57□□□□□ -0.88
ALMS1-201ENST00000423048 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
ALMS1-201ENST00000423048 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa9.56□□□□□ -0.88
ALMS1-201ENST00000423048 MS4A1P11836 297 aa9.56□□□□□ -0.88
ALMS1-201ENST00000423048 HMGXB3Q12766 1538 aa9.56□□□□□ -0.88
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