RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419504.5

TNS1-205, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS1, Length 5,921 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-205ENST00000419504 COL12A1Q99715 3063 aa6.99□□□□□ -1.29
TNS1-205ENST00000419504 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa6.99□□□□□ -1.29
TNS1-205ENST00000419504 NDUFAF8A1L188 74 aa6.99□□□□□ -1.29
TNS1-205ENST00000419504 APCP25054 2843 aa6.97□□□□□ -1.29
TNS1-205ENST00000419504 C10orf95Q9H7T3 257 aa6.96□□□□□ -1.3
TNS1-205ENST00000419504 TPRXLQ17RH7 258 aa6.95□□□□□ -1.3
TNS1-205ENST00000419504 COL6A3P12111 3177 aa6.93□□□□□ -1.3
TNS1-205ENST00000419504 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
TNS1-205ENST00000419504 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa6.91□□□□□ -1.3
TNS1-205ENST00000419504 EYSQ5T1H1 3165 aa6.89□□□□□ -1.31
TNS1-205ENST00000419504 TACC2O95359 2948 aa6.89□□□□□ -1.31
TNS1-205ENST00000419504 VCANP13611 3396 aa6.89□□□□□ -1.31
TNS1-205ENST00000419504 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa6.88□□□□□ -1.31
TNS1-205ENST00000419504 KRTAP10-8P60410 259 aa6.86□□□□□ -1.31
TNS1-205ENST00000419504 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP6.86□□□□□ -1.31
TNS1-205ENST00000419504 LRBAP50851 2863 aa6.84□□□□□ -1.31
TNS1-205ENST00000419504 H0YAA0 97 aa6.84□□□□□ -1.31
TNS1-205ENST00000419504 NBEAQ8NFP9 2946 aa6.84□□□□□ -1.31
TNS1-205ENST00000419504 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa6.84□□□□□ -1.31
TNS1-205ENST00000419504 ZZEF1O43149 2961 aa6.83□□□□□ -1.32
TNS1-205ENST00000419504 STAB2Q8WWQ8 2551 aa6.83□□□□□ -1.32
TNS1-205ENST00000419504 KALRNO60229 2985 aa6.83□□□□□ -1.32
TNS1-205ENST00000419504 DMXL1Q9Y485 3027 aa6.81□□□□□ -1.32
TNS1-205ENST00000419504 A0A1B0GVY2 172 aa6.78□□□□□ -1.32
TNS1-205ENST00000419504 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.78□□□□□ -1.32
TNS1-205ENST00000419504 PRO2289Q9P1D8 64 aa6.77□□□□□ -1.33
TNS1-205ENST00000419504 P0C880 135 aa6.76□□□□□ -1.33
TNS1-205ENST00000419504 TENM4Q6N022 2769 aa6.75□□□□□ -1.33
TNS1-205ENST00000419504 ZANQ9Y493 2812 aa6.75□□□□□ -1.33
TNS1-205ENST00000419504 REV3LO60673 3130 aa6.75□□□□□ -1.33
TNS1-205ENST00000419504 FREM2Q5SZK8 3169 aa6.74□□□□□ -1.33
TNS1-205ENST00000419504 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
TNS1-205ENST00000419504 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
TNS1-205ENST00000419504 DNAH14Q0VDD8 3507 aa6.73□□□□□ -1.33
TNS1-205ENST00000419504 KRTAP10-10P60014 251 aa6.71□□□□□ -1.33
TNS1-205ENST00000419504 USP34Q70CQ2 3546 aa6.65□□□□□ -1.34
TNS1-205ENST00000419504 CELSR2Q9HCU4 2923 aa6.63□□□□□ -1.35
TNS1-205ENST00000419504 DCHS2Q6V1P9 2916 aa6.59□□□□□ -1.35
TNS1-205ENST00000419504 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa6.53□□□□□ -1.36
TNS1-205ENST00000419504 LOC400499M0QZD8 3231 aa6.53□□□□□ -1.36
TNS1-205ENST00000419504 NF1P21359 2839 aa6.53□□□□□ -1.36
TNS1-205ENST00000419504 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
TNS1-205ENST00000419504 MXRA5Q9NR99 2828 aa6.48□□□□□ -1.37
TNS1-205ENST00000419504 FBN2P35556 2912 aa6.48□□□□□ -1.37
TNS1-205ENST00000419504 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa6.47□□□□□ -1.37
TNS1-205ENST00000419504 KRTAP12-2P59991 146 aa6.44□□□□□ -1.38
TNS1-205ENST00000419504 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa6.43□□□□□ -1.38
TNS1-205ENST00000419504 SPEGQ15772 3267 aa6.43□□□□□ -1.38
TNS1-205ENST00000419504 PDZD2O15018 2839 aa6.42□□□□□ -1.38
TNS1-205ENST00000419504 KRTAP12-1P59990 96 aa6.34□□□□□ -1.4
TNS1-205ENST00000419504 TENM3Q9P273 2699 aa6.3□□□□□ -1.4
TNS1-205ENST00000419504 TENM1Q9UKZ4 2725 aa6.28□□□□□ -1.4
TNS1-205ENST00000419504 MYO15AQ9UKN7 3530 aa6.27□□□□□ -1.41
TNS1-205ENST00000419504 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa6.27□□□□□ -1.41
TNS1-205ENST00000419504 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.26□□□□□ -1.41
TNS1-205ENST00000419504 TENM2Q9NT68 2774 aa6.25□□□□□ -1.41
TNS1-205ENST00000419504 OTOGQ6ZRI0 2925 aa6.25□□□□□ -1.41
TNS1-205ENST00000419504 RELNP78509 3460 aa6.21□□□□□ -1.42
TNS1-205ENST00000419504 DCHS1Q96JQ0 3298 aa6.19□□□□□ -1.42
TNS1-205ENST00000419504 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.13□□□□□ -1.43
TNS1-205ENST00000419504 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
TNS1-205ENST00000419504 TGP01266 2768 aa6.1□□□□□ -1.43
TNS1-205ENST00000419504 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa6.06□□□□□ -1.44
TNS1-205ENST00000419504 VWFP04275 2813 aa6.06□□□□□ -1.44
TNS1-205ENST00000419504 LAMA5O15230 3695 aa6.05□□□□□ -1.44
TNS1-205ENST00000419504 MUC3AQ02505 3323 aa6.04□□□□□ -1.44
TNS1-205ENST00000419504 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa6.04□□□□□ -1.44
TNS1-205ENST00000419504 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
TNS1-205ENST00000419504 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
TNS1-205ENST00000419504 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa5.98□□□□□ -1.45
TNS1-205ENST00000419504 MT1HL1P0DM35 61 aa5.96□□□□□ -1.45
TNS1-205ENST00000419504 DMDP11532 3685 aa5.95□□□□□ -1.46
TNS1-205ENST00000419504 ASPMQ8IZT6 3477 aa5.94□□□□□ -1.46
TNS1-205ENST00000419504 INE1O15225 51 aa5.9□□□□□ -1.46
TNS1-205ENST00000419504 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa5.88□□□□□ -1.47
TNS1-205ENST00000419504 KRTAP10-12P60413 245 aa5.87□□□□□ -1.47
TNS1-205ENST00000419504 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa5.87□□□□□ -1.47
TNS1-205ENST00000419504 ZFHX4Q86UP3 3567 aa5.86□□□□□ -1.47
TNS1-205ENST00000419504 ZFHX3Q15911 3703 aa5.85□□□□□ -1.47
TNS1-205ENST00000419504 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.82□□□□□ -1.48
TNS1-205ENST00000419504 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
TNS1-205ENST00000419504 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
TNS1-205ENST00000419504 FBN3Q75N90 2809 aa5.75□□□□□ -1.49
TNS1-205ENST00000419504 ALMS1Q8TCU4 4167 aa5.74□□□□□ -1.49
TNS1-205ENST00000419504 BSNQ9UPA5 3926 aa5.7□□□□□ -1.5
TNS1-205ENST00000419504 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa5.7□□□□□ -1.5
TNS1-205ENST00000419504 KRTAP12-3P60328 96 aa5.69□□□□□ -1.5
TNS1-205ENST00000419504 CSMD1Q96PZ7 3565 aa5.68□□□□□ -1.5
TNS1-205ENST00000419504 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
TNS1-205ENST00000419504 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa5.67□□□□□ -1.5
TNS1-205ENST00000419504 CSMD2Q7Z408 3487 aa5.66□□□□□ -1.5
TNS1-205ENST00000419504 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa5.62□□□□□ -1.51
TNS1-205ENST00000419504 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
TNS1-205ENST00000419504 CRCT1Q9UGL9 99 aa5.62□□□□□ -1.51
TNS1-205ENST00000419504 LCE3AQ5TA76 89 aa5.6□□□□□ -1.51
TNS1-205ENST00000419504 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.52
TNS1-205ENST00000419504 SVEP1Q4LDE5 3571 aa5.53□□□□□ -1.52
TNS1-205ENST00000419504 COL7A1Q02388 2944 aa5.5□□□□□ -1.53
TNS1-205ENST00000419504 LORP23490 312 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
TNS1-205ENST00000419504 CUBNO60494 3623 aa5.42□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 686.6 ms