RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405333.5

ODC1-202, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ODC1, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-202ENST00000405333 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa11.35□□□□□ -0.59
ODC1-202ENST00000405333 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa11.35□□□□□ -0.59
ODC1-202ENST00000405333 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa11.35□□□□□ -0.59
ODC1-202ENST00000405333 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa11.34□□□□□ -0.59
ODC1-202ENST00000405333 A0A1B0GVX0 72 aa11.33□□□□□ -0.6
ODC1-202ENST00000405333 NDUFB1O75438 58 aa11.32□□□□□ -0.6
ODC1-202ENST00000405333 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
ODC1-202ENST00000405333 WFDC13Q8IUB5 93 aa11.29□□□□□ -0.6
ODC1-202ENST00000405333 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa11.27□□□□□ -0.61
ODC1-202ENST00000405333 HCG22E2RYF7 251 aa11.27□□□□□ -0.61
ODC1-202ENST00000405333 PCLOQ9Y6V0 5065 aa11.26□□□□□ -0.61
ODC1-202ENST00000405333 C8orf17Q9NRJ1 99 aa11.25□□□□□ -0.61
ODC1-202ENST00000405333 SCGB1A1P11684 91 aa11.24□□□□□ -0.61
ODC1-202ENST00000405333 CASC2Q6XLA1 102 aa11.21□□□□□ -0.62
ODC1-202ENST00000405333 hDV103S1A0JD37 113 aa11.18□□□□□ -0.62
ODC1-202ENST00000405333 J3QL48 77 aa11.18□□□□□ -0.62
ODC1-202ENST00000405333 LINC00313P59037 77 aa11.17□□□□□ -0.62
ODC1-202ENST00000405333 C9orf92A6NGG3 77 aa11.14□□□□□ -0.63
ODC1-202ENST00000405333 C8orf87E5RJ46 101 aa11.12□□□□□ -0.63
ODC1-202ENST00000405333 ATOX1O00244 68 aa11.12□□□□□ -0.63
ODC1-202ENST00000405333 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa11.11□□□□□ -0.63
ODC1-202ENST00000405333 ANAPC13Q9BS18 74 aa11.09□□□□□ -0.63
ODC1-202ENST00000405333 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
ODC1-202ENST00000405333 TMEM254Q8TBM7 123 aa11.08□□□□□ -0.64
ODC1-202ENST00000405333 OCR1Q9BZK8 76 aa11.08□□□□□ -0.64
ODC1-202ENST00000405333 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa11.07□□□□□ -0.64
ODC1-202ENST00000405333 PRR4Q16378 134 aa11.07□□□□□ -0.64
ODC1-202ENST00000405333 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
ODC1-202ENST00000405333 NDUFS5O43920 106 aa11.04□□□□□ -0.64
ODC1-202ENST00000405333 PCP4P48539 62 aa11.03□□□□□ -0.64
ODC1-202ENST00000405333 SERP2Q8N6R1 65 aa11□□□□□ -0.65
ODC1-202ENST00000405333 TRAV7A0A075B6U4 112 aa10.99□□□□□ -0.65
ODC1-202ENST00000405333 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
ODC1-202ENST00000405333 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa10.99□□□□□ -0.65
ODC1-202ENST00000405333 LPAP08519 4548 aa10.98□□□□□ -0.65
ODC1-202ENST00000405333 HERC1Q15751 4861 aa10.98□□□□□ -0.65
ODC1-202ENST00000405333 SMIM20Q8N5G0 67 aa10.96□□□□□ -0.65
ODC1-202ENST00000405333 COX7CP15954 63 aa10.94□□□□□ -0.66
ODC1-202ENST00000405333 CCDC179H3BU77 68 aa10.92□□□□□ -0.66
ODC1-202ENST00000405333 Q5W150 140 aa10.92□□□□□ -0.66
ODC1-202ENST00000405333 UQCRQO14949 82 aa10.9□□□□□ -0.66
ODC1-202ENST00000405333 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa10.9□□□□□ -0.67
ODC1-202ENST00000405333 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa10.9□□□□□ -0.67
ODC1-202ENST00000405333 XP32Q5T750 250 aa10.88□□□□□ -0.67
ODC1-202ENST00000405333 A8MUU9 505 aa10.88□□□□□ -0.67
ODC1-202ENST00000405333 TPRXLQ17RH7 258 aa10.86□□□□□ -0.67
ODC1-202ENST00000405333 C20orf197Q8N268 126 aa10.86□□□□□ -0.67
ODC1-202ENST00000405333 LRP2P98164 4655 aa10.85□□□□□ -0.67
ODC1-202ENST00000405333 TRAV22A0A0B4J277 110 aa10.85□□□□□ -0.67
ODC1-202ENST00000405333 H0Y9P7 68 aa10.84□□□□□ -0.67
ODC1-202ENST00000405333 SNURFQ9Y675 71 aa10.84□□□□□ -0.67
ODC1-202ENST00000405333 C5orf47Q569G3 176 aa10.83□□□□□ -0.68
ODC1-202ENST00000405333 CYSTM1Q9H1C7 97 aa10.83□□□□□ -0.68
ODC1-202ENST00000405333 Q75L30 129 aa10.81□□□□□ -0.68
ODC1-202ENST00000405333 LINC00208Q96KT6 92 aa10.78□□□□□ -0.68
ODC1-202ENST00000405333 A0A0U1RQV1 116 aa10.78□□□□□ -0.68
ODC1-202ENST00000405333 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
ODC1-202ENST00000405333 MP68P56378 58 aa10.77□□□□□ -0.69
ODC1-202ENST00000405333 RPL37P61927 97 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
ODC1-202ENST00000405333 C1orf64Q8NEQ6 169 aa10.74□□□□□ -0.69
ODC1-202ENST00000405333 KLKP1Q107X0 134 aa10.72□□□□□ -0.69
ODC1-202ENST00000405333 HMCN2Q8NDA2 5059 aa10.72□□□□□ -0.69
ODC1-202ENST00000405333 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa10.67□□□□□ -0.7
ODC1-202ENST00000405333 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa10.65□□□□□ -0.7
ODC1-202ENST00000405333 H3BPC8 53 aa10.65□□□□□ -0.7
ODC1-202ENST00000405333 IGKV2-30P06310 120 aa10.65□□□□□ -0.7
ODC1-202ENST00000405333 PCOTHQ58A44 107 aa10.62□□□□□ -0.71
ODC1-202ENST00000405333 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa10.62□□□□□ -0.71
ODC1-202ENST00000405333 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa10.61□□□□□ -0.71
ODC1-202ENST00000405333 H7BZZ5 65 aa10.61□□□□□ -0.71
ODC1-202ENST00000405333 SPINK7P58062 85 aa10.54□□□□□ -0.72
ODC1-202ENST00000405333 C7orf65Q6ZTY9 151 aa10.53□□□□□ -0.72
ODC1-202ENST00000405333 NDUFC1O43677 76 aa10.5□□□□□ -0.73
ODC1-202ENST00000405333 HRES1P13985 223 aa10.46□□□□□ -0.73
ODC1-202ENST00000405333 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
ODC1-202ENST00000405333 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa10.42□□□□□ -0.74
ODC1-202ENST00000405333 TMEM258P61165 79 aa10.41□□□□□ -0.74
ODC1-202ENST00000405333 C4orf26Q17RF5 130 aa10.41□□□□□ -0.74
ODC1-202ENST00000405333 MUC17Q685J3 4493 aa10.4□□□□□ -0.74
ODC1-202ENST00000405333 MUC2Q02817 5179 aa10.39□□□□□ -0.75
ODC1-202ENST00000405333 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa10.36□□□□□ -0.75
ODC1-202ENST00000405333 FAM236CP0DP71 79 aa10.36□□□□□ -0.75
ODC1-202ENST00000405333 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa10.35□□□□□ -0.75
ODC1-202ENST00000405333 UBR4Q5T4S7 5183 aa10.34□□□□□ -0.75
ODC1-202ENST00000405333 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa10.28□□□□□ -0.76
ODC1-202ENST00000405333 DMAC1Q96GE9 116 aa10.24□□□□□ -0.77
ODC1-202ENST00000405333 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
ODC1-202ENST00000405333 MPLKIPQ8TAP9 179 aa10.22□□□□□ -0.77
ODC1-202ENST00000405333 COX6B2Q6YFQ2 88 aa10.21□□□□□ -0.77
ODC1-202ENST00000405333 RNF213Q63HN8 5207 aa10.17□□□□□ -0.78
ODC1-202ENST00000405333 ACYP2P14621 99 aa10.12□□□□□ -0.79
ODC1-202ENST00000405333 COA5Q86WW8 74 aa10.11□□□□□ -0.79
ODC1-202ENST00000405333 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa10.11□□□□□ -0.79
ODC1-202ENST00000405333 A8MUN3 132 aa10.09□□□□□ -0.79
ODC1-202ENST00000405333 SERP1Q9Y6X1 66 aa10.09□□□□□ -0.79
ODC1-202ENST00000405333 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa10.07□□□□□ -0.8
ODC1-202ENST00000405333 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa10.01□□□□□ -0.81
ODC1-202ENST00000405333 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa9.97□□□□□ -0.81
ODC1-202ENST00000405333 RPS28P62857 69 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
ODC1-202ENST00000405333 FAT4Q6V0I7 4981 aa9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.5 ms