RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 KRTAP10-10P60014 251 aa2.4□□□□□ -2.02
PTPRD-201ENST00000355233 TENM4Q6N022 2769 aa2.4□□□□□ -2.02
PTPRD-201ENST00000355233 LRBAP50851 2863 aa2.38□□□□□ -2.03
PTPRD-201ENST00000355233 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP2.38□□□□□ -2.03
PTPRD-201ENST00000355233 ALMS1Q8TCU4 4167 aa2.38□□□□□ -2.03
PTPRD-201ENST00000355233 TENM3Q9P273 2699 aa2.37□□□□□ -2.03
PTPRD-201ENST00000355233 FLNCQ14315 2725 aa2.37□□□□□ -2.03
PTPRD-201ENST00000355233 DSPP15924 2871 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
PTPRD-201ENST00000355233 KRTAP12-2P59991 146 aa2.36□□□□□ -2.03
PTPRD-201ENST00000355233 LCE2BO14633 110 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRD-201ENST00000355233 MGAQ8IWI9 3026 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRD-201ENST00000355233 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
PTPRD-201ENST00000355233 FRYLO94915 3013 aa2.34□□□□□ -2.04
PTPRD-201ENST00000355233 CMYA5Q8N3K9 4069 aa2.34□□□□□ -2.04
PTPRD-201ENST00000355233 FRYQ5TBA9 3013 aa2.34□□□□□ -2.04
PTPRD-201ENST00000355233 LCE2CQ5TA81 110 aa2.34□□□□□ -2.04
PTPRD-201ENST00000355233 LAMA1P25391 3075 aa2.33□□□□□ -2.04
PTPRD-201ENST00000355233 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP2.32□□□□□ -2.04
PTPRD-201ENST00000355233 C5orf42Q9H799 3197 aa2.31□□□□□ -2.04
PTPRD-201ENST00000355233 ZZEF1O43149 2961 aa2.31□□□□□ -2.04
PTPRD-201ENST00000355233 PCNTO95613 3336 aa2.31□□□□□ -2.04
PTPRD-201ENST00000355233 TENM1Q9UKZ4 2725 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRD-201ENST00000355233 KALRNO60229 2985 aa2.29□□□□□ -2.04
PTPRD-201ENST00000355233 COL12A1Q99715 3063 aa2.29□□□□□ -2.04
PTPRD-201ENST00000355233 KIAA1109Q2LD37 5005 aa2.28□□□□□ -2.04
PTPRD-201ENST00000355233 MT1HL1P0DM35 61 aa2.28□□□□□ -2.04
PTPRD-201ENST00000355233 WDFY4Q6ZS81 3184 aa2.27□□□□□ -2.05
PTPRD-201ENST00000355233 BIRC6Q9NR09 4857 aa2.27□□□□□ -2.05
PTPRD-201ENST00000355233 HERC1Q15751 4861 aa2.27□□□□□ -2.05
PTPRD-201ENST00000355233 TENM2Q9NT68 2774 aa2.27□□□□□ -2.05
PTPRD-201ENST00000355233 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa2.27□□□□□ -2.05
PTPRD-201ENST00000355233 MXRA5Q9NR99 2828 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRD-201ENST00000355233 CFAP54Q96N23 3096 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRD-201ENST00000355233 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
PTPRD-201ENST00000355233 AKAP9Q99996 3911 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRD-201ENST00000355233 TACC2O95359 2948 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRD-201ENST00000355233 ABCA13Q86UQ4 5058 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRD-201ENST00000355233 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
PTPRD-201ENST00000355233 ZFHX3Q15911 3703 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRD-201ENST00000355233 VWFP04275 2813 aa2.23□□□□□ -2.05
PTPRD-201ENST00000355233 XIRP2A4UGR9 3374 aa2.23□□□□□ -2.05
PTPRD-201ENST00000355233 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
PTPRD-201ENST00000355233 VPS13AQ96RL7 3174 aa2.22□□□□□ -2.05
PTPRD-201ENST00000355233 DNAH6Q9C0G6 4158 aa2.22□□□□□ -2.05
PTPRD-201ENST00000355233 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa2.22□□□□□ -2.05
PTPRD-201ENST00000355233 NF1P21359 2839 aa2.22□□□□□ -2.05
PTPRD-201ENST00000355233 HTTP42858 3142 aa2.21□□□□□ -2.05
PTPRD-201ENST00000355233 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
PTPRD-201ENST00000355233 ZANQ9Y493 2812 aa2.21□□□□□ -2.06
PTPRD-201ENST00000355233 HMCN2Q8NDA2 5059 aa2.2□□□□□ -2.06
PTPRD-201ENST00000355233 UTRNP46939 3433 aa2.2□□□□□ -2.06
PTPRD-201ENST00000355233 CEP350Q5VT06 3117 aa2.2□□□□□ -2.06
PTPRD-201ENST00000355233 NBEAQ8NFP9 2946 aa2.2□□□□□ -2.06
PTPRD-201ENST00000355233 KRTAP10-12P60413 245 aa2.2□□□□□ -2.06
PTPRD-201ENST00000355233 FAT4Q6V0I7 4981 aa2.2□□□□□ -2.06
PTPRD-201ENST00000355233 CELSR2Q9HCU4 2923 aa2.19□□□□□ -2.06
PTPRD-201ENST00000355233 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
PTPRD-201ENST00000355233 DNAH3Q8TD57 4116 aa2.19□□□□□ -2.06
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PTPRD-201ENST00000355233 FBN3Q75N90 2809 aa2.17□□□□□ -2.06
PTPRD-201ENST00000355233 USP34Q70CQ2 3546 aa2.17□□□□□ -2.06
PTPRD-201ENST00000355233 DCHS2Q6V1P9 2916 aa2.17□□□□□ -2.06
PTPRD-201ENST00000355233 RYR3Q15413 4870 aa2.17□□□□□ -2.06
PTPRD-201ENST00000355233 TRIOO75962 3097 aa2.16□□□□□ -2.06
PTPRD-201ENST00000355233 HERC2O95714 4834 aa2.16□□□□□ -2.06
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PTPRD-201ENST00000355233 FBN2P35556 2912 aa2.14□□□□□ -2.07
PTPRD-201ENST00000355233 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa2.14□□□□□ -2.07
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PTPRD-201ENST00000355233 KRTAP12-3P60328 96 aa2.14□□□□□ -2.07
PTPRD-201ENST00000355233 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa2.13□□□□□ -2.07
PTPRD-201ENST00000355233 EYSQ5T1H1 3165 aa2.13□□□□□ -2.07
PTPRD-201ENST00000355233 COL6A3P12111 3177 aa2.13□□□□□ -2.07
PTPRD-201ENST00000355233 DNAH1Q9P2D7 4330 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRD-201ENST00000355233 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa2.12□□□□□ -2.07
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PTPRD-201ENST00000355233 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
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PTPRD-201ENST00000355233 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP2.08□□□□□ -2.08
PTPRD-201ENST00000355233 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa2.08□□□□□ -2.08
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PTPRD-201ENST00000355233 UNC80Q8N2C7 3258 aa2.08□□□□□ -2.08
PTPRD-201ENST00000355233 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP2.08□□□□□ -2.08
PTPRD-201ENST00000355233 OTOGQ6ZRI0 2925 aa2.08□□□□□ -2.08
PTPRD-201ENST00000355233 DNAH10Q8IVF4 4471 aa2.07□□□□□ -2.08
PTPRD-201ENST00000355233 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa2.07□□□□□ -2.08
PTPRD-201ENST00000355233 LRP1BQ9NZR2 4599 aa2.06□□□□□ -2.08
PTPRD-201ENST00000355233 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
PTPRD-201ENST00000355233 ATMQ13315 3056 aa2.06□□□□□ -2.08
PTPRD-201ENST00000355233 SPRR2GQ9BYE4 73 aa2.06□□□□□ -2.08
PTPRD-201ENST00000355233 BRCA2P51587 3418 aa2.04□□□□□ -2.08
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