RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326431.3

TMIE-201, Transcript of transmembrane inner ear, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMIE, Length 1,824 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIE-201ENST00000326431 MT1HL1P0DM35 61 aa13.49□□□□□ -0.25
TMIE-201ENST00000326431 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa13.47□□□□□ -0.25
TMIE-201ENST00000326431 HCG22E2RYF7 251 aa13.47□□□□□ -0.25
TMIE-201ENST00000326431 HERC2O95714 4834 aa13.46□□□□□ -0.26
TMIE-201ENST00000326431 WFDC13Q8IUB5 93 aa13.43□□□□□ -0.26
TMIE-201ENST00000326431 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa13.43□□□□□ -0.26
TMIE-201ENST00000326431 OXTP01178 125 aa13.43□□□□□ -0.26
TMIE-201ENST00000326431 ATOX1O00244 68 aa13.42□□□□□ -0.26
TMIE-201ENST00000326431 C8orf17Q9NRJ1 99 aa13.41□□□□□ -0.26
TMIE-201ENST00000326431 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa13.41□□□□□ -0.26
TMIE-201ENST00000326431 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
TMIE-201ENST00000326431 CASC2Q6XLA1 102 aa13.39□□□□□ -0.27
TMIE-201ENST00000326431 ANAPC13Q9BS18 74 aa13.39□□□□□ -0.27
TMIE-201ENST00000326431 RETNLBQ9BQ08 111 aa13.38□□□□□ -0.27
TMIE-201ENST00000326431 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
TMIE-201ENST00000326431 ABCA13Q86UQ4 5058 aa13.36□□□□□ -0.27
TMIE-201ENST00000326431 hDV103S1A0JD37 113 aa13.34□□□□□ -0.27
TMIE-201ENST00000326431 C8orf87E5RJ46 101 aa13.31□□□□□ -0.28
TMIE-201ENST00000326431 LINC00313P59037 77 aa13.29□□□□□ -0.28
TMIE-201ENST00000326431 OCR1Q9BZK8 76 aa13.27□□□□□ -0.29
TMIE-201ENST00000326431 SERP2Q8N6R1 65 aa13.25□□□□□ -0.29
TMIE-201ENST00000326431 TMEM254Q8TBM7 123 aa13.25□□□□□ -0.29
TMIE-201ENST00000326431 SMIM20Q8N5G0 67 aa13.25□□□□□ -0.29
TMIE-201ENST00000326431 TRAV7A0A075B6U4 112 aa13.24□□□□□ -0.29
TMIE-201ENST00000326431 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
TMIE-201ENST00000326431 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa13.19□□□□□ -0.3
TMIE-201ENST00000326431 COX7CP15954 63 aa13.19□□□□□ -0.3
TMIE-201ENST00000326431 C9orf92A6NGG3 77 aa13.14□□□□□ -0.31
TMIE-201ENST00000326431 NDUFS5O43920 106 aa13.14□□□□□ -0.31
TMIE-201ENST00000326431 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
TMIE-201ENST00000326431 CCDC179H3BU77 68 aa13.13□□□□□ -0.31
TMIE-201ENST00000326431 J3QL48 77 aa13.12□□□□□ -0.31
TMIE-201ENST00000326431 UQCRQO14949 82 aa13.12□□□□□ -0.31
TMIE-201ENST00000326431 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
TMIE-201ENST00000326431 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa13.06□□□□□ -0.32
TMIE-201ENST00000326431 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa13.06□□□□□ -0.32
TMIE-201ENST00000326431 C20orf197Q8N268 126 aa13.03□□□□□ -0.32
TMIE-201ENST00000326431 PRR4Q16378 134 aa13.02□□□□□ -0.32
TMIE-201ENST00000326431 C5orf47Q569G3 176 aa13.01□□□□□ -0.33
TMIE-201ENST00000326431 TRAV22A0A0B4J277 110 aa12.98□□□□□ -0.33
TMIE-201ENST00000326431 H0Y9P7 68 aa12.97□□□□□ -0.33
TMIE-201ENST00000326431 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa12.97□□□□□ -0.33
TMIE-201ENST00000326431 Q5W150 140 aa12.96□□□□□ -0.33
TMIE-201ENST00000326431 SNURFQ9Y675 71 aa12.96□□□□□ -0.33
TMIE-201ENST00000326431 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa12.95□□□□□ -0.34
TMIE-201ENST00000326431 PCLOQ9Y6V0 5065 aa12.94□□□□□ -0.34
TMIE-201ENST00000326431 CYSTM1Q9H1C7 97 aa12.94□□□□□ -0.34
TMIE-201ENST00000326431 A0A0U1RQV1 116 aa12.93□□□□□ -0.34
TMIE-201ENST00000326431 A8MUU9 505 aa12.93□□□□□ -0.34
TMIE-201ENST00000326431 MP68P56378 58 aa12.93□□□□□ -0.34
TMIE-201ENST00000326431 KLKP1Q107X0 134 aa12.91□□□□□ -0.34
TMIE-201ENST00000326431 LINC00208Q96KT6 92 aa12.9□□□□□ -0.34
TMIE-201ENST00000326431 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
TMIE-201ENST00000326431 XP32Q5T750 250 aa12.85□□□□□ -0.35
TMIE-201ENST00000326431 Q75L30 129 aa12.85□□□□□ -0.35
TMIE-201ENST00000326431 H3BPC8 53 aa12.84□□□□□ -0.35
TMIE-201ENST00000326431 TPRXLQ17RH7 258 aa12.84□□□□□ -0.35
TMIE-201ENST00000326431 C1orf64Q8NEQ6 169 aa12.84□□□□□ -0.35
TMIE-201ENST00000326431 LPAP08519 4548 aa12.77□□□□□ -0.37
TMIE-201ENST00000326431 H7BZZ5 65 aa12.75□□□□□ -0.37
TMIE-201ENST00000326431 RPL37P61927 97 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
TMIE-201ENST00000326431 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa12.72□□□□□ -0.37
TMIE-201ENST00000326431 NDUFC1O43677 76 aa12.72□□□□□ -0.37
TMIE-201ENST00000326431 IGKV2-30P06310 120 aa12.69□□□□□ -0.38
TMIE-201ENST00000326431 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa12.67□□□□□ -0.38
TMIE-201ENST00000326431 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa12.66□□□□□ -0.38
TMIE-201ENST00000326431 PCOTHQ58A44 107 aa12.65□□□□□ -0.38
TMIE-201ENST00000326431 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa12.65□□□□□ -0.39
TMIE-201ENST00000326431 LRP2P98164 4655 aa12.64□□□□□ -0.39
TMIE-201ENST00000326431 HERC1Q15751 4861 aa12.62□□□□□ -0.39
TMIE-201ENST00000326431 TMEM258P61165 79 aa12.6□□□□□ -0.39
TMIE-201ENST00000326431 C7orf65Q6ZTY9 151 aa12.58□□□□□ -0.4
TMIE-201ENST00000326431 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa12.51□□□□□ -0.41
TMIE-201ENST00000326431 FAM236CP0DP71 79 aa12.51□□□□□ -0.41
TMIE-201ENST00000326431 SPINK7P58062 85 aa12.51□□□□□ -0.41
TMIE-201ENST00000326431 HRES1P13985 223 aa12.48□□□□□ -0.41
TMIE-201ENST00000326431 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa12.47□□□□□ -0.41
TMIE-201ENST00000326431 HMCN2Q8NDA2 5059 aa12.44□□□□□ -0.42
TMIE-201ENST00000326431 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP12.41□□□□□ -0.42
TMIE-201ENST00000326431 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP12.38□□□□□ -0.43
TMIE-201ENST00000326431 RPS28P62857 69 aaKnown RBP12.33□□□□□ -0.44
TMIE-201ENST00000326431 C4orf26Q17RF5 130 aa12.33□□□□□ -0.44
TMIE-201ENST00000326431 MUC17Q685J3 4493 aa12.31□□□□□ -0.44
TMIE-201ENST00000326431 SVIPQ8NHG7 77 aa12.25□□□□□ -0.45
TMIE-201ENST00000326431 DMAC1Q96GE9 116 aa12.25□□□□□ -0.45
TMIE-201ENST00000326431 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa12.21□□□□□ -0.46
TMIE-201ENST00000326431 SERP1Q9Y6X1 66 aa12.21□□□□□ -0.46
TMIE-201ENST00000326431 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa12.18□□□□□ -0.46
TMIE-201ENST00000326431 COX6B2Q6YFQ2 88 aa12.17□□□□□ -0.46
TMIE-201ENST00000326431 ACYP2P14621 99 aa12.16□□□□□ -0.46
TMIE-201ENST00000326431 COA5Q86WW8 74 aa12.13□□□□□ -0.47
TMIE-201ENST00000326431 A8MUN3 132 aa12.12□□□□□ -0.47
TMIE-201ENST00000326431 MPLKIPQ8TAP9 179 aa12.11□□□□□ -0.47
TMIE-201ENST00000326431 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa12.02□□□□□ -0.48
TMIE-201ENST00000326431 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa11.95□□□□□ -0.5
TMIE-201ENST00000326431 MUC2Q02817 5179 aa11.94□□□□□ -0.5
TMIE-201ENST00000326431 SMIM26A0A096LP01 95 aa11.9□□□□□ -0.5
TMIE-201ENST00000326431 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa11.89□□□□□ -0.51
TMIE-201ENST00000326431 UBR4Q5T4S7 5183 aa11.87□□□□□ -0.51
TMIE-201ENST00000326431 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.5 ms