RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291592.5

LRRC3-201, Transcript of leucine rich repeat containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRC3, Length 5,869 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3-201ENST00000291592 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa9.54□□□□□ -0.88
LRRC3-201ENST00000291592 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
LRRC3-201ENST00000291592 NDUFAF8A1L188 74 aa9.51□□□□□ -0.89
LRRC3-201ENST00000291592 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa9.5□□□□□ -0.89
LRRC3-201ENST00000291592 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
LRRC3-201ENST00000291592 A8MUU9 505 aa9.47□□□□□ -0.89
LRRC3-201ENST00000291592 EYSQ5T1H1 3165 aa9.47□□□□□ -0.89
LRRC3-201ENST00000291592 STAB2Q8WWQ8 2551 aa9.43□□□□□ -0.9
LRRC3-201ENST00000291592 HIVEP1P15822 2718 aa9.43□□□□□ -0.9
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LRRC3-201ENST00000291592 SPEGQ15772 3267 aa9.41□□□□□ -0.9
LRRC3-201ENST00000291592 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
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LRRC3-201ENST00000291592 RPS29P62273 56 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
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LRRC3-201ENST00000291592 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa9.33□□□□□ -0.92
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LRRC3-201ENST00000291592 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
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LRRC3-201ENST00000291592 TNP1P09430 55 aa9.27□□□□□ -0.93
LRRC3-201ENST00000291592 C10orf95Q9H7T3 257 aa9.27□□□□□ -0.93
LRRC3-201ENST00000291592 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
LRRC3-201ENST00000291592 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa9.24□□□□□ -0.93
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LRRC3-201ENST00000291592 ZANQ9Y493 2812 aa9.21□□□□□ -0.94
LRRC3-201ENST00000291592 LOC400499M0QZD8 3231 aa9.19□□□□□ -0.94
LRRC3-201ENST00000291592 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP9.18□□□□□ -0.94
LRRC3-201ENST00000291592 CELSR2Q9HCU4 2923 aa9.15□□□□□ -0.94
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LRRC3-201ENST00000291592 DCHS2Q6V1P9 2916 aa9.07□□□□□ -0.96
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LRRC3-201ENST00000291592 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa8.9□□□□□ -0.98
LRRC3-201ENST00000291592 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa8.9□□□□□ -0.99
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LRRC3-201ENST00000291592 P0C880 135 aa8.88□□□□□ -0.99
LRRC3-201ENST00000291592 H0YAA0 97 aa8.85□□□□□ -0.99
LRRC3-201ENST00000291592 RELNP78509 3460 aa8.84□□□□□ -0.99
LRRC3-201ENST00000291592 A0A1B0GVY2 172 aa8.76□□□□□ -1.01
LRRC3-201ENST00000291592 XP32Q5T750 250 aa8.75□□□□□ -1.01
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LRRC3-201ENST00000291592 ASPMQ8IZT6 3477 aa8.71□□□□□ -1.02
LRRC3-201ENST00000291592 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa8.7□□□□□ -1.02
LRRC3-201ENST00000291592 LAMA5O15230 3695 aa8.68□□□□□ -1.02
LRRC3-201ENST00000291592 ZFHX4Q86UP3 3567 aa8.65□□□□□ -1.02
LRRC3-201ENST00000291592 PDZD2O15018 2839 aa8.61□□□□□ -1.03
LRRC3-201ENST00000291592 CSMD1Q96PZ7 3565 aa8.6□□□□□ -1.03
LRRC3-201ENST00000291592 TENM3Q9P273 2699 aa8.59□□□□□ -1.03
LRRC3-201ENST00000291592 TENM2Q9NT68 2774 aa8.59□□□□□ -1.03
LRRC3-201ENST00000291592 DMDP11532 3685 aa8.59□□□□□ -1.03
LRRC3-201ENST00000291592 TENM1Q9UKZ4 2725 aa8.58□□□□□ -1.04
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LRRC3-201ENST00000291592 TPRXLQ17RH7 258 aa8.53□□□□□ -1.04
LRRC3-201ENST00000291592 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa8.49□□□□□ -1.05
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LRRC3-201ENST00000291592 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa8.42□□□□□ -1.06
LRRC3-201ENST00000291592 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
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LRRC3-201ENST00000291592 TGP01266 2768 aa8.36□□□□□ -1.07
LRRC3-201ENST00000291592 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
LRRC3-201ENST00000291592 KRTAP12-2P59991 146 aa8.3□□□□□ -1.08
LRRC3-201ENST00000291592 ZFHX3Q15911 3703 aa8.26□□□□□ -1.09
LRRC3-201ENST00000291592 VWFP04275 2813 aa8.24□□□□□ -1.09
LRRC3-201ENST00000291592 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
LRRC3-201ENST00000291592 SVEP1Q4LDE5 3571 aa8.23□□□□□ -1.09
LRRC3-201ENST00000291592 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa8.21□□□□□ -1.1
LRRC3-201ENST00000291592 CUBNO60494 3623 aa8.15□□□□□ -1.1
LRRC3-201ENST00000291592 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
LRRC3-201ENST00000291592 KRTAP12-1P59990 96 aa8.12□□□□□ -1.11
LRRC3-201ENST00000291592 CSMD2Q7Z408 3487 aa8.08□□□□□ -1.12
LRRC3-201ENST00000291592 BSNQ9UPA5 3926 aa8.06□□□□□ -1.12
LRRC3-201ENST00000291592 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa7.98□□□□□ -1.13
LRRC3-201ENST00000291592 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa7.97□□□□□ -1.13
LRRC3-201ENST00000291592 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa7.94□□□□□ -1.14
LRRC3-201ENST00000291592 FBN3Q75N90 2809 aa7.87□□□□□ -1.15
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LRRC3-201ENST00000291592 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
LRRC3-201ENST00000291592 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa7.76□□□□□ -1.17
LRRC3-201ENST00000291592 MT1HL1P0DM35 61 aa7.74□□□□□ -1.17
LRRC3-201ENST00000291592 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
LRRC3-201ENST00000291592 INE1O15225 51 aa7.73□□□□□ -1.17
LRRC3-201ENST00000291592 VPS13CQ709C8 3753 aa7.68□□□□□ -1.18
LRRC3-201ENST00000291592 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
LRRC3-201ENST00000291592 COL7A1Q02388 2944 aa7.58□□□□□ -1.2
LRRC3-201ENST00000291592 ALMS1Q8TCU4 4167 aa7.55□□□□□ -1.2
LRRC3-201ENST00000291592 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa7.54□□□□□ -1.2
LRRC3-201ENST00000291592 CRCT1Q9UGL9 99 aa7.5□□□□□ -1.21
LRRC3-201ENST00000291592 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa7.47□□□□□ -1.21
LRRC3-201ENST00000291592 KRTAP10-12P60413 245 aa7.46□□□□□ -1.21
LRRC3-201ENST00000291592 DNAH9Q9NYC9 4486 aa7.45□□□□□ -1.22
LRRC3-201ENST00000291592 AKAP9Q99996 3911 aa7.45□□□□□ -1.22
LRRC3-201ENST00000291592 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
LRRC3-201ENST00000291592 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa7.42□□□□□ -1.22
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