RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000270722.9

PRDM16-201, Transcript of PR/SET domain 16, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRDM16, Length 8,690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM16-201ENST00000270722 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PRDM16-201ENST00000270722 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa7.24□□□□□ -1.25
PRDM16-201ENST00000270722 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa7.22□□□□□ -1.25
PRDM16-201ENST00000270722 H0YAA0 97 aa7.22□□□□□ -1.25
PRDM16-201ENST00000270722 TPRXLQ17RH7 258 aa7.21□□□□□ -1.25
PRDM16-201ENST00000270722 LRBAP50851 2863 aa7.21□□□□□ -1.25
PRDM16-201ENST00000270722 TRIOO75962 3097 aa7.19□□□□□ -1.26
PRDM16-201ENST00000270722 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
PRDM16-201ENST00000270722 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa7.15□□□□□ -1.26
PRDM16-201ENST00000270722 KRTAP23-1A1A580 65 aa7.15□□□□□ -1.26
PRDM16-201ENST00000270722 TACC2O95359 2948 aa7.15□□□□□ -1.26
PRDM16-201ENST00000270722 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa7.14□□□□□ -1.27
PRDM16-201ENST00000270722 DCHS2Q6V1P9 2916 aa7.14□□□□□ -1.27
PRDM16-201ENST00000270722 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PRDM16-201ENST00000270722 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa7.14□□□□□ -1.27
PRDM16-201ENST00000270722 FREM2Q5SZK8 3169 aa7.13□□□□□ -1.27
PRDM16-201ENST00000270722 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa7.12□□□□□ -1.27
PRDM16-201ENST00000270722 TGP01266 2768 aa7.11□□□□□ -1.27
PRDM16-201ENST00000270722 VPS13AQ96RL7 3174 aa7.09□□□□□ -1.27
PRDM16-201ENST00000270722 KRTAP10-10P60014 251 aa7.09□□□□□ -1.27
PRDM16-201ENST00000270722 XP32Q5T750 250 aa7.07□□□□□ -1.28
PRDM16-201ENST00000270722 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
PRDM16-201ENST00000270722 WDFY4Q6ZS81 3184 aa7.04□□□□□ -1.28
PRDM16-201ENST00000270722 VWFP04275 2813 aa7.03□□□□□ -1.28
PRDM16-201ENST00000270722 ZZEF1O43149 2961 aa7.02□□□□□ -1.29
PRDM16-201ENST00000270722 UNC80Q8N2C7 3258 aa7□□□□□ -1.29
PRDM16-201ENST00000270722 ZFHX3Q15911 3703 aa6.99□□□□□ -1.29
PRDM16-201ENST00000270722 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PRDM16-201ENST00000270722 LAMA3Q16787 3333 aa6.96□□□□□ -1.3
PRDM16-201ENST00000270722 LAMA1P25391 3075 aa6.94□□□□□ -1.3
PRDM16-201ENST00000270722 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa6.93□□□□□ -1.3
PRDM16-201ENST00000270722 COL12A1Q99715 3063 aa6.93□□□□□ -1.3
PRDM16-201ENST00000270722 BRCA2P51587 3418 aa6.91□□□□□ -1.3
PRDM16-201ENST00000270722 NBEAQ8NFP9 2946 aa6.89□□□□□ -1.31
PRDM16-201ENST00000270722 MXRA5Q9NR99 2828 aa6.88□□□□□ -1.31
PRDM16-201ENST00000270722 ZANQ9Y493 2812 aa6.88□□□□□ -1.31
PRDM16-201ENST00000270722 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa6.85□□□□□ -1.31
PRDM16-201ENST00000270722 A0A1B0GVY2 172 aa6.84□□□□□ -1.31
PRDM16-201ENST00000270722 HTTP42858 3142 aa6.83□□□□□ -1.32
PRDM16-201ENST00000270722 DNAH14Q0VDD8 3507 aa6.83□□□□□ -1.32
PRDM16-201ENST00000270722 DMXL1Q9Y485 3027 aa6.82□□□□□ -1.32
PRDM16-201ENST00000270722 CDH23Q9H251 3354 aa6.82□□□□□ -1.32
PRDM16-201ENST00000270722 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.81□□□□□ -1.32
PRDM16-201ENST00000270722 ATMQ13315 3056 aa6.78□□□□□ -1.32
PRDM16-201ENST00000270722 FBN3Q75N90 2809 aa6.76□□□□□ -1.33
PRDM16-201ENST00000270722 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.74□□□□□ -1.33
PRDM16-201ENST00000270722 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa6.74□□□□□ -1.33
PRDM16-201ENST00000270722 SPEGQ15772 3267 aa6.72□□□□□ -1.33
PRDM16-201ENST00000270722 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa6.7□□□□□ -1.34
PRDM16-201ENST00000270722 COL6A3P12111 3177 aa6.69□□□□□ -1.34
PRDM16-201ENST00000270722 VCANP13611 3396 aa6.67□□□□□ -1.34
PRDM16-201ENST00000270722 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa6.66□□□□□ -1.34
PRDM16-201ENST00000270722 KRTAP12-2P59991 146 aa6.65□□□□□ -1.34
PRDM16-201ENST00000270722 FBN2P35556 2912 aa6.63□□□□□ -1.35
PRDM16-201ENST00000270722 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa6.63□□□□□ -1.35
PRDM16-201ENST00000270722 COL7A1Q02388 2944 aa6.62□□□□□ -1.35
PRDM16-201ENST00000270722 SZT2Q5T011 3432 aa6.52□□□□□ -1.36
PRDM16-201ENST00000270722 USP34Q70CQ2 3546 aa6.52□□□□□ -1.37
PRDM16-201ENST00000270722 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa6.52□□□□□ -1.37
PRDM16-201ENST00000270722 EYSQ5T1H1 3165 aa6.46□□□□□ -1.38
PRDM16-201ENST00000270722 KRTAP12-1P59990 96 aa6.41□□□□□ -1.38
PRDM16-201ENST00000270722 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa6.33□□□□□ -1.4
PRDM16-201ENST00000270722 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PRDM16-201ENST00000270722 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa6.31□□□□□ -1.4
PRDM16-201ENST00000270722 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PRDM16-201ENST00000270722 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
PRDM16-201ENST00000270722 ASPMQ8IZT6 3477 aa6.21□□□□□ -1.42
PRDM16-201ENST00000270722 MYO15AQ9UKN7 3530 aa6.2□□□□□ -1.42
PRDM16-201ENST00000270722 LOC400499M0QZD8 3231 aa6.19□□□□□ -1.42
PRDM16-201ENST00000270722 OTOGQ6ZRI0 2925 aa6.11□□□□□ -1.43
PRDM16-201ENST00000270722 KRTAP10-12P60413 245 aa6.11□□□□□ -1.43
PRDM16-201ENST00000270722 ZFHX4Q86UP3 3567 aa6.06□□□□□ -1.44
PRDM16-201ENST00000270722 LAMA5O15230 3695 aa6.04□□□□□ -1.44
PRDM16-201ENST00000270722 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa6.03□□□□□ -1.44
PRDM16-201ENST00000270722 ALMS1Q8TCU4 4167 aa6.03□□□□□ -1.44
PRDM16-201ENST00000270722 DCHS1Q96JQ0 3298 aa6.01□□□□□ -1.45
PRDM16-201ENST00000270722 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.47
PRDM16-201ENST00000270722 RELNP78509 3460 aa5.89□□□□□ -1.47
PRDM16-201ENST00000270722 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa5.88□□□□□ -1.47
PRDM16-201ENST00000270722 KRTAP12-3P60328 96 aa5.87□□□□□ -1.47
PRDM16-201ENST00000270722 CRCT1Q9UGL9 99 aa5.85□□□□□ -1.47
PRDM16-201ENST00000270722 CSMD1Q96PZ7 3565 aa5.82□□□□□ -1.48
PRDM16-201ENST00000270722 CUBNO60494 3623 aa5.75□□□□□ -1.49
PRDM16-201ENST00000270722 MT1HL1P0DM35 61 aa5.75□□□□□ -1.49
PRDM16-201ENST00000270722 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
PRDM16-201ENST00000270722 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa5.72□□□□□ -1.49
PRDM16-201ENST00000270722 MT3P25713 68 aa5.69□□□□□ -1.5
PRDM16-201ENST00000270722 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
PRDM16-201ENST00000270722 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.61□□□□□ -1.51
PRDM16-201ENST00000270722 AKAP9Q99996 3911 aa5.58□□□□□ -1.52
PRDM16-201ENST00000270722 DMDP11532 3685 aa5.56□□□□□ -1.52
PRDM16-201ENST00000270722 KRTAP10-5P60370 271 aa5.56□□□□□ -1.52
PRDM16-201ENST00000270722 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa5.55□□□□□ -1.52
PRDM16-201ENST00000270722 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa5.51□□□□□ -1.53
PRDM16-201ENST00000270722 SVEP1Q4LDE5 3571 aa5.5□□□□□ -1.53
PRDM16-201ENST00000270722 LCE3AQ5TA76 89 aa5.49□□□□□ -1.53
PRDM16-201ENST00000270722 MUC3AQ02505 3323 aa5.46□□□□□ -1.54
PRDM16-201ENST00000270722 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
PRDM16-201ENST00000270722 CMYA5Q8N3K9 4069 aa5.41□□□□□ -1.54
PRDM16-201ENST00000270722 LORP23490 312 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 92.6 ms