RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255198.2

ZBED3-201, Transcript of zinc finger BED-type containing 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED3, Length 6,172 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3-201ENST00000255198 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
ZBED3-201ENST00000255198 SZT2Q5T011 3432 aa10.57□□□□□ -0.72
ZBED3-201ENST00000255198 COL6A3P12111 3177 aa10.52□□□□□ -0.72
ZBED3-201ENST00000255198 VCANP13611 3396 aa10.49□□□□□ -0.73
ZBED3-201ENST00000255198 DSPP15924 2871 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
ZBED3-201ENST00000255198 IGSF10Q6WRI0 2623 aa10.48□□□□□ -0.73
ZBED3-201ENST00000255198 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
ZBED3-201ENST00000255198 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa10.45□□□□□ -0.74
ZBED3-201ENST00000255198 APCP25054 2843 aa10.44□□□□□ -0.74
ZBED3-201ENST00000255198 KALRNO60229 2985 aa10.43□□□□□ -0.74
ZBED3-201ENST00000255198 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa10.42□□□□□ -0.74
ZBED3-201ENST00000255198 LAMA1P25391 3075 aa10.4□□□□□ -0.74
ZBED3-201ENST00000255198 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.75
ZBED3-201ENST00000255198 HIVEP1P15822 2718 aa10.33□□□□□ -0.76
ZBED3-201ENST00000255198 LRBAP50851 2863 aa10.32□□□□□ -0.76
ZBED3-201ENST00000255198 ITPR1Q14643 2758 aa10.32□□□□□ -0.76
ZBED3-201ENST00000255198 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
ZBED3-201ENST00000255198 REV3LO60673 3130 aa10.28□□□□□ -0.76
ZBED3-201ENST00000255198 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa10.26□□□□□ -0.77
ZBED3-201ENST00000255198 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa10.25□□□□□ -0.77
ZBED3-201ENST00000255198 TACC2O95359 2948 aa10.25□□□□□ -0.77
ZBED3-201ENST00000255198 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
ZBED3-201ENST00000255198 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
ZBED3-201ENST00000255198 KRTAP12-2P59991 146 aa10.2□□□□□ -0.78
ZBED3-201ENST00000255198 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa10.2□□□□□ -0.78
ZBED3-201ENST00000255198 ATMQ13315 3056 aa10.16□□□□□ -0.78
ZBED3-201ENST00000255198 FRYLO94915 3013 aa10.09□□□□□ -0.79
ZBED3-201ENST00000255198 SPEGQ15772 3267 aa10.07□□□□□ -0.8
ZBED3-201ENST00000255198 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa10.06□□□□□ -0.8
ZBED3-201ENST00000255198 TENM4Q6N022 2769 aa10.06□□□□□ -0.8
ZBED3-201ENST00000255198 NBEAQ8NFP9 2946 aa10.05□□□□□ -0.8
ZBED3-201ENST00000255198 COL12A1Q99715 3063 aa10.04□□□□□ -0.8
ZBED3-201ENST00000255198 USP34Q70CQ2 3546 aa10.02□□□□□ -0.8
ZBED3-201ENST00000255198 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa9.98□□□□□ -0.81
ZBED3-201ENST00000255198 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa9.9□□□□□ -0.82
ZBED3-201ENST00000255198 EYSQ5T1H1 3165 aa9.88□□□□□ -0.83
ZBED3-201ENST00000255198 CELSR2Q9HCU4 2923 aa9.87□□□□□ -0.83
ZBED3-201ENST00000255198 KRTAP12-1P59990 96 aa9.87□□□□□ -0.83
ZBED3-201ENST00000255198 ZZEF1O43149 2961 aa9.86□□□□□ -0.83
ZBED3-201ENST00000255198 MYO15AQ9UKN7 3530 aa9.83□□□□□ -0.84
ZBED3-201ENST00000255198 TENM2Q9NT68 2774 aa9.75□□□□□ -0.85
ZBED3-201ENST00000255198 FLNCQ14315 2725 aa9.75□□□□□ -0.85
ZBED3-201ENST00000255198 DCHS2Q6V1P9 2916 aa9.75□□□□□ -0.85
ZBED3-201ENST00000255198 TENM1Q9UKZ4 2725 aa9.72□□□□□ -0.85
ZBED3-201ENST00000255198 TGP01266 2768 aa9.69□□□□□ -0.86
ZBED3-201ENST00000255198 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP9.68□□□□□ -0.86
ZBED3-201ENST00000255198 CRCT1Q9UGL9 99 aa9.68□□□□□ -0.86
ZBED3-201ENST00000255198 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
ZBED3-201ENST00000255198 DMXL1Q9Y485 3027 aa9.64□□□□□ -0.87
ZBED3-201ENST00000255198 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa9.62□□□□□ -0.87
ZBED3-201ENST00000255198 ASPMQ8IZT6 3477 aa9.62□□□□□ -0.87
ZBED3-201ENST00000255198 LOC400499M0QZD8 3231 aa9.59□□□□□ -0.87
ZBED3-201ENST00000255198 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa9.59□□□□□ -0.87
ZBED3-201ENST00000255198 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
ZBED3-201ENST00000255198 TENM3Q9P273 2699 aa9.53□□□□□ -0.88
ZBED3-201ENST00000255198 NF1P21359 2839 aa9.48□□□□□ -0.89
ZBED3-201ENST00000255198 DCHS1Q96JQ0 3298 aa9.47□□□□□ -0.89
ZBED3-201ENST00000255198 ZANQ9Y493 2812 aa9.46□□□□□ -0.9
ZBED3-201ENST00000255198 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa9.42□□□□□ -0.9
ZBED3-201ENST00000255198 FBN2P35556 2912 aa9.41□□□□□ -0.9
ZBED3-201ENST00000255198 ZFHX4Q86UP3 3567 aa9.41□□□□□ -0.9
ZBED3-201ENST00000255198 RELNP78509 3460 aa9.4□□□□□ -0.91
ZBED3-201ENST00000255198 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
ZBED3-201ENST00000255198 CSMD1Q96PZ7 3565 aa9.33□□□□□ -0.92
ZBED3-201ENST00000255198 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa9.3□□□□□ -0.92
ZBED3-201ENST00000255198 KRTAP10-12P60413 245 aa9.28□□□□□ -0.92
ZBED3-201ENST00000255198 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa9.24□□□□□ -0.93
ZBED3-201ENST00000255198 PDZD2O15018 2839 aa9.24□□□□□ -0.93
ZBED3-201ENST00000255198 VWFP04275 2813 aa9.21□□□□□ -0.93
ZBED3-201ENST00000255198 LAMA5O15230 3695 aa9.19□□□□□ -0.94
ZBED3-201ENST00000255198 INE1O15225 51 aa9.14□□□□□ -0.95
ZBED3-201ENST00000255198 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
ZBED3-201ENST00000255198 MT1HL1P0DM35 61 aa9.03□□□□□ -0.96
ZBED3-201ENST00000255198 DMDP11532 3685 aa9.01□□□□□ -0.97
ZBED3-201ENST00000255198 MXRA5Q9NR99 2828 aa9.01□□□□□ -0.97
ZBED3-201ENST00000255198 KRTAP12-3P60328 96 aa8.97□□□□□ -0.97
ZBED3-201ENST00000255198 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa8.95□□□□□ -0.98
ZBED3-201ENST00000255198 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa8.94□□□□□ -0.98
ZBED3-201ENST00000255198 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
ZBED3-201ENST00000255198 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa8.92□□□□□ -0.98
ZBED3-201ENST00000255198 LCE3AQ5TA76 89 aa8.92□□□□□ -0.98
ZBED3-201ENST00000255198 SVEP1Q4LDE5 3571 aa8.88□□□□□ -0.99
ZBED3-201ENST00000255198 KRTAP10-5P60370 271 aa8.8□□□□□ -1
ZBED3-201ENST00000255198 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
ZBED3-201ENST00000255198 ZFHX3Q15911 3703 aa8.7□□□□□ -1.02
ZBED3-201ENST00000255198 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa8.66□□□□□ -1.02
ZBED3-201ENST00000255198 LORP23490 312 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
ZBED3-201ENST00000255198 CSMD2Q7Z408 3487 aa8.65□□□□□ -1.03
ZBED3-201ENST00000255198 CUBNO60494 3623 aa8.63□□□□□ -1.03
ZBED3-201ENST00000255198 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa8.63□□□□□ -1.03
ZBED3-201ENST00000255198 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
ZBED3-201ENST00000255198 FBN3Q75N90 2809 aa8.6□□□□□ -1.03
ZBED3-201ENST00000255198 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
ZBED3-201ENST00000255198 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
ZBED3-201ENST00000255198 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa8.52□□□□□ -1.05
ZBED3-201ENST00000255198 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
ZBED3-201ENST00000255198 KRTAP23-1A1A580 65 aa8.48□□□□□ -1.05
ZBED3-201ENST00000255198 BSNQ9UPA5 3926 aa8.46□□□□□ -1.06
ZBED3-201ENST00000255198 OTOGQ6ZRI0 2925 aa8.45□□□□□ -1.06
ZBED3-201ENST00000255198 COL7A1Q02388 2944 aa8.42□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.4 ms