RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000199420.4

Csde1-215, Transcript of Cold shock domain-containing protein E1, mouse

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene Csde1, Length 4,185 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Smr2	O09133	150 aa		4.63	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Mal	O09198	153 aa		4.63	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Ighv3-6	P18531	116 aa		4.63	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Mrpl16	Q99N93	251 aa		4.63	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Ss18l2	Q9D174	77 aa		4.63	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Cep290	Q6A078	2472 aa		4.63	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Ralgapa1	Q6GYP7	2035 aa		4.62	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Gm15821	A6X8J8	139 aa		4.62	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Thy1	P01831	162 aa		4.62	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Avp	P35455	168 aa		4.62	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Loxl2	P58022	776 aa		4.62	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Pax8	Q00288	457 aa		4.62	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Pou2af1	Q64693	256 aa		4.62	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Nhlrc1	Q8BR37	401 aa		4.62	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Prss58	Q8BW11	241 aa		4.62	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Gm9936	Q8C864	160 aa		4.62	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420		Q9CQM1	111 aa		4.62	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Hcfc2	Q9D968	241 aa		4.62	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Gm5093	E9PZB3	174 aa		4.62	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Ifitm10	Q8BR26	201 aa		4.62	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Wfdc21	Q8BTE6	63 aa		4.62	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Gapt	Q8CB93	157 aa		4.62	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Dusp14	Q9JLY7	198 aa		4.62	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Ighv1-23	A0A0A6YVW3	117 aa		4.62	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Igip	A0A1B0GR74	53 aa		4.62	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420		H3BKT1	185 aa		4.62	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420		P01659	112 aa		4.62	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Gfra1	P97785	468 aa		4.62	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Prrg4	Q8BGN6	226 aa		4.62	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Foxi1	Q922I5	372 aa		4.62	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Ccl24	Q9JKC0	119 aa		4.62	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Phlda3	Q9WV95	125 aa		4.62	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Ascc3	E9PZJ8	2198 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Lrrk1	Q3UHC2	2014 aa		4.62	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Olfr364-ps1	A0A140T8Q2	307 aa		4.61	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Gm6871	L7N248	545 aa		4.61	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420		P01741	114 aa		4.61	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420		P01790	122 aa		4.61	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Vkorc1l1	Q6TEK5	176 aa		4.61	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Rflna	Q7TS73	204 aa		4.61	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	F930015N05Rik	Q8C3A3	210 aa		4.61	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Cysltr1	Q99JA4	352 aa		4.61	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Cysrt1	Q9D1E4	142 aa		4.61	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Pla2g2f	Q9QZT4	168 aa		4.61	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Artn	Q9Z0L2	224 aa		4.61	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Lbhd2	G3UW55	114 aa		4.61	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Cd27	P41272	250 aa		4.61	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Retn	Q99P87	114 aa		4.61	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Klk1b27	Q9JM71	263 aa		4.61	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Gcn1	E9PVA8	2671 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Myof	Q69ZN7	2048 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Snrnp200	Q6P4T2	2136 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	9830107B12Rik	D3Z5D6	160 aa		4.61	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Snrnp40	Q6PE01	358 aa		4.61	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Ighv7-1	A0A075B5S2	121 aa		4.61	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Tarm1	B6A8R8	288 aa		4.61	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	1700003H04Rik	E9PXM2	192 aa		4.61	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Gm14137	Q8CE97	175 aa		4.61	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Rchy1	Q9CR50	261 aa		4.61	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Mrpl55	Q9CZ83	127 aa		4.61	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Mfap4	Q9D1H9	257 aa		4.61	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Crybg1	A0A0G2JG52	2065 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Ighv1-52	A0A0A6YXC3	117 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Trav19	A0A0B4J1K4	119 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Gm17660	B9UIU9	90 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	BC107364	E9Q5A2	140 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Vsig4	F6TUL9	280 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420		P04942	107 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	A830031A19Rik	Q8BNT5	113 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	A730015C16Rik	Q8C992	119 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Ighv1-37	A0A0A6YW32	117 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420		P01789	122 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420		P04940	107 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420		P04941	107 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Mrpl33	Q9CQP0	65 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Iah1	Q9DB29	249 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Timm23	Q9WTQ8	209 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Ccl8	Q9Z121	97 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Tcf20	Q9EPQ8	1987 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Igkv1-133	A0A0B4J1H8	120 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Defa2	P28309	93 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Cirbp	P60824	172 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Ang6	Q5GAN0	147 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Ankrd39	Q9D2X0	183 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Klf13	Q9JJZ6	289 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Helz	Q6DFV5	1964 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Trip12	G5E870	2025 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Bdp1	Q571C7	2467 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Ash1l	Q99MY8	2958 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Smim1	P0C8K7	78 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Cd5	P13379	494 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420		P18530	117 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Ccl7	Q03366	97 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Prss38	Q3UKY7	322 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Gm10277	Q6R5C6	214 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Lrrc25	Q8K1T1	297 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420		Q9CQ90	155 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Agrn	A2ASQ1	1950 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Trav7-5	A0A0G2JFX6	112 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Tnfsf12	O54907	249 aa		4.59	□□□□□ -1.67

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