Protein–RNA interactions for Protein: P04942

Ig kappa chain V-VI region NQ5-61.1.2, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04942 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29,39■■■□□ 2,3
P04942 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
P04942 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
P04942 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,98■■□□□ 1,91
P04942 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
P04942 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
P04942 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26,2■■□□□ 1,78
P04942 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25,97■■□□□ 1,75
P04942 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
P04942 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25,72■■□□□ 1,71
P04942 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
P04942 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
P04942 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25,37■■□□□ 1,65
P04942 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25,25■■□□□ 1,63
P04942 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,63
P04942 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
P04942 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
P04942 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
P04942 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
P04942 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
P04942 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
P04942 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
P04942 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
P04942 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
P04942 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24,72■■□□□ 1,55
P04942 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
P04942 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24,63■■□□□ 1,53
P04942 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
P04942 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
P04942 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,48■■□□□ 1,51
P04942 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24,48■■□□□ 1,51
P04942 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,48■■□□□ 1,51
P04942 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,48■■□□□ 1,51
P04942 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24,47■■□□□ 1,51
P04942 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
P04942 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,26■■□□□ 1,47
P04942 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,13■■□□□ 1,45
P04942 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,12■■□□□ 1,45
P04942 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,11■■□□□ 1,45
P04942 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24,09■■□□□ 1,45
P04942 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24,05■■□□□ 1,44
P04942 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24,01■■□□□ 1,43
P04942 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,92■■□□□ 1,42
P04942 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23,9■■□□□ 1,42
P04942 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,84■■□□□ 1,41
P04942 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23,84■■□□□ 1,41
P04942 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23,77■■□□□ 1,4
P04942 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,73■■□□□ 1,39
P04942 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,38
P04942 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23,64■■□□□ 1,38
P04942 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,56■■□□□ 1,36
P04942 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,51■■□□□ 1,35
P04942 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,37■■□□□ 1,33
P04942 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,33
P04942 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,31■■□□□ 1,32
P04942 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23,3■■□□□ 1,32
P04942 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23,28■■□□□ 1,32
P04942 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,25■■□□□ 1,31
P04942 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
P04942 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
P04942 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23,19■■□□□ 1,3
P04942 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,19■■□□□ 1,3
P04942 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23,19■■□□□ 1,3
P04942 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
P04942 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,11■■□□□ 1,29
P04942 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23,09■■□□□ 1,29
P04942 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23,07■■□□□ 1,28
P04942 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23,07■■□□□ 1,28
P04942 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,03■■□□□ 1,28
P04942 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23,02■■□□□ 1,28
P04942 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,99■■□□□ 1,27
P04942 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22,96■■□□□ 1,27
P04942 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,93■■□□□ 1,26
P04942 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,91■■□□□ 1,26
P04942 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,9■■□□□ 1,26
P04942 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,86■■□□□ 1,25
P04942 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
P04942 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
P04942 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22,84■■□□□ 1,25
P04942 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,84■■□□□ 1,25
P04942 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,83■■□□□ 1,25
P04942 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,83■■□□□ 1,25
P04942 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,8■■□□□ 1,24
P04942 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,78■■□□□ 1,24
P04942 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,76■■□□□ 1,23
P04942 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,74■■□□□ 1,23
P04942 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,67■■□□□ 1,22
P04942 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22,67■■□□□ 1,22
P04942 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22,65■■□□□ 1,22
P04942 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,64■■□□□ 1,22
P04942 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,62■■□□□ 1,21
P04942 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,62■■□□□ 1,21
P04942 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,61■■□□□ 1,21
P04942 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22,6■■□□□ 1,21
P04942 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,58■■□□□ 1,2
P04942 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,56■■□□□ 1,2
P04942 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,53■■□□□ 1,2
P04942 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22,49■■□□□ 1,19
P04942 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22,48■■□□□ 1,19
P04942 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22,48■■□□□ 1,19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,7 ms