RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549547.1

PRPF40B-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog B, humanhuman

TSL 5

Gene PRPF40B, Length 697 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40B-210ENST00000549547 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa7.54□□□□□ -1.2
PRPF40B-210ENST00000549547 PRR4Q16378 134 aa7.54□□□□□ -1.2
PRPF40B-210ENST00000549547 LYRM7Q5U5X0 104 aa7.54□□□□□ -1.2
PRPF40B-210ENST00000549547 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa7.54□□□□□ -1.2
PRPF40B-210ENST00000549547 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa7.54□□□□□ -1.2
PRPF40B-210ENST00000549547 Q8NBF4 154 aa7.54□□□□□ -1.2
PRPF40B-210ENST00000549547 SMIM11BQ8TCY0 68 aa7.54□□□□□ -1.2
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PRPF40B-210ENST00000549547 UBR4Q5T4S7 5183 aa7.53□□□□□ -1.2
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PRPF40B-210ENST00000549547 C9orf153Q5TBE3 101 aa7.51□□□□□ -1.21
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PRPF40B-210ENST00000549547 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa7.49□□□□□ -1.21
PRPF40B-210ENST00000549547 TRIAP1O43715 76 aa7.49□□□□□ -1.21
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PRPF40B-210ENST00000549547 PSMB2P49721 201 aa7.46□□□□□ -1.22
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PRPF40B-210ENST00000549547 RETNLBQ9BQ08 111 aa7.45□□□□□ -1.22
PRPF40B-210ENST00000549547 hADV29S1A0JD25 119 aa7.44□□□□□ -1.22
PRPF40B-210ENST00000549547 ANAPC13Q9BS18 74 aa7.44□□□□□ -1.22
PRPF40B-210ENST00000549547 SNCGO76070 127 aa7.43□□□□□ -1.22
PRPF40B-210ENST00000549547 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
PRPF40B-210ENST00000549547 PPDPFLQ8WWR9 84 aa7.43□□□□□ -1.22
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PRPF40B-210ENST00000549547 SCGB1C2P0DMR2 95 aa7.42□□□□□ -1.22
PRPF40B-210ENST00000549547 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
PRPF40B-210ENST00000549547 Q6Q795 121 aa7.42□□□□□ -1.22
PRPF40B-210ENST00000549547 CLEC2BQ92478 149 aa7.42□□□□□ -1.22
PRPF40B-210ENST00000549547 FAM218AQ96MZ4 157 aa7.42□□□□□ -1.22
PRPF40B-210ENST00000549547 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa7.41□□□□□ -1.22
PRPF40B-210ENST00000549547 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa7.4□□□□□ -1.22
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PRPF40B-210ENST00000549547 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
PRPF40B-210ENST00000549547 Q6ZQY7 126 aa7.4□□□□□ -1.22
PRPF40B-210ENST00000549547 SMIM29Q86T20 159 aa7.4□□□□□ -1.22
PRPF40B-210ENST00000549547 Q8N377 158 aa7.4□□□□□ -1.22
PRPF40B-210ENST00000549547 LIMD2Q9BT23 127 aa7.4□□□□□ -1.22
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PRPF40B-210ENST00000549547 CD164Q04900 197 aa7.39□□□□□ -1.23
PRPF40B-210ENST00000549547 TPRXLQ17RH7 258 aa7.39□□□□□ -1.23
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PRPF40B-210ENST00000549547 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa7.31□□□□□ -1.24
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PRPF40B-210ENST00000549547 MT-ATP8P03928 68 aa7.3□□□□□ -1.24
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PRPF40B-210ENST00000549547 C5orf47Q569G3 176 aa7.28□□□□□ -1.24
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PRPF40B-210ENST00000549547 BAALC-AS2P0C853 105 aa7.26□□□□□ -1.25
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PRPF40B-210ENST00000549547 SMIM20Q8N5G0 67 aa7.26□□□□□ -1.25
PRPF40B-210ENST00000549547 ORMDL1Q9P0S3 153 aa7.26□□□□□ -1.25
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PRPF40B-210ENST00000549547 H3BT86 120 aa7.24□□□□□ -1.25
PRPF40B-210ENST00000549547 ANKRD29Q8N6D5 301 aa7.24□□□□□ -1.25
PRPF40B-210ENST00000549547 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa7.22□□□□□ -1.25
PRPF40B-210ENST00000549547 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa7.22□□□□□ -1.25
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PRPF40B-210ENST00000549547 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa7.21□□□□□ -1.26
PRPF40B-210ENST00000549547 C1orf195Q5TG92 126 aa7.21□□□□□ -1.26
PRPF40B-210ENST00000549547 RPS28P62857 69 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PRPF40B-210ENST00000549547 J3KT08 172 aa7.18□□□□□ -1.26
PRPF40B-210ENST00000549547 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PRPF40B-210ENST00000549547 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa7.18□□□□□ -1.26
PRPF40B-210ENST00000549547 A0A0U1RQV1 116 aa7.17□□□□□ -1.26
PRPF40B-210ENST00000549547 CCDC179H3BU77 68 aa7.16□□□□□ -1.26
PRPF40B-210ENST00000549547 XP32Q5T750 250 aa7.16□□□□□ -1.26
PRPF40B-210ENST00000549547 MUC2Q02817 5179 aa7.16□□□□□ -1.26
PRPF40B-210ENST00000549547 UQCRQO14949 82 aa7.15□□□□□ -1.26
PRPF40B-210ENST00000549547 C9orf92A6NGG3 77 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF40B-210ENST00000549547 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa7.12□□□□□ -1.27
PRPF40B-210ENST00000549547 RBM3P98179 157 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
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