RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504994.1

HERC3-209, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 341 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-209ENST00000504994 PLXNC1O60486 1568 aa0.43□□□□□ -2.34
HERC3-209ENST00000504994 C4AP0C0L4 1744 aa0.43□□□□□ -2.34
HERC3-209ENST00000504994 C4BP0C0L5 1744 aa0.43□□□□□ -2.34
HERC3-209ENST00000504994 CSPG4Q6UVK1 2322 aa0.43□□□□□ -2.34
HERC3-209ENST00000504994 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa0.43□□□□□ -2.34
HERC3-209ENST00000504994 GLI2P10070 1586 aa0.42□□□□□ -2.34
HERC3-209ENST00000504994 TIAM1Q13009 1591 aa0.42□□□□□ -2.34
HERC3-209ENST00000504994 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP0.42□□□□□ -2.34
HERC3-209ENST00000504994 CHD8Q9HCK8 2581 aa0.42□□□□□ -2.34
HERC3-209ENST00000504994 SPTA1P02549 2419 aa0.42□□□□□ -2.34
HERC3-209ENST00000504994 C6orf48Q9UBA6 75 aa0.42□□□□□ -2.34
HERC3-209ENST00000504994 PTPN13Q12923 2485 aa0.42□□□□□ -2.34
HERC3-209ENST00000504994 KNL1Q8NG31 2342 aa0.42□□□□□ -2.34
HERC3-209ENST00000504994 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP0.42□□□□□ -2.34
HERC3-209ENST00000504994 DSPP15924 2871 aaKnown RBP0.41□□□□□ -2.34
HERC3-209ENST00000504994 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP0.41□□□□□ -2.34
HERC3-209ENST00000504994 UGGT1Q9NYU2 1555 aa0.4□□□□□ -2.35
HERC3-209ENST00000504994 ABCA2Q9BZC7 2435 aa0.39□□□□□ -2.35
HERC3-209ENST00000504994 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa0.39□□□□□ -2.35
HERC3-209ENST00000504994 AKAP13Q12802 2813 aa0.39□□□□□ -2.35
HERC3-209ENST00000504994 H0YGX0 51 aa0.39□□□□□ -2.35
HERC3-209ENST00000504994 RPS27P42677 84 aaKnown RBP0.39□□□□□ -2.35
HERC3-209ENST00000504994 WT1-ASQ06250 92 aa0.39□□□□□ -2.35
HERC3-209ENST00000504994 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP0.39□□□□□ -2.35
HERC3-209ENST00000504994 ALS2Q96Q42 1657 aa0.39□□□□□ -2.35
HERC3-209ENST00000504994 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa0.38□□□□□ -2.35
HERC3-209ENST00000504994 FAT2Q9NYQ8 4349 aa0.38□□□□□ -2.35
HERC3-209ENST00000504994 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP0.38□□□□□ -2.35
HERC3-209ENST00000504994 TMEM167BQ9NRX6 74 aa0.38□□□□□ -2.35
HERC3-209ENST00000504994 NCOR2Q9Y618 2525 aa0.38□□□□□ -2.35
HERC3-209ENST00000504994 TNXBP22105 4242 aa0.37□□□□□ -2.35
HERC3-209ENST00000504994 BSNQ9UPA5 3926 aa0.37□□□□□ -2.35
HERC3-209ENST00000504994 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP0.37□□□□□ -2.35
HERC3-209ENST00000504994 PRLHP81277 87 aa0.37□□□□□ -2.35
HERC3-209ENST00000504994 LINC00308Q8TCZ7 52 aa0.37□□□□□ -2.35
HERC3-209ENST00000504994 S4R3F8 94 aa0.37□□□□□ -2.35
HERC3-209ENST00000504994 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP0.37□□□□□ -2.35
HERC3-209ENST00000504994 C3P01024 1663 aa0.37□□□□□ -2.35
HERC3-209ENST00000504994 PLNP26678 52 aa0.36□□□□□ -2.35
HERC3-209ENST00000504994 DEFB106AQ8N104 65 aa0.36□□□□□ -2.35
HERC3-209ENST00000504994 IGSF10Q6WRI0 2623 aa0.36□□□□□ -2.35
HERC3-209ENST00000504994 BPTFQ12830 3046 aa0.36□□□□□ -2.35
HERC3-209ENST00000504994 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
HERC3-209ENST00000504994 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP0.35□□□□□ -2.35
HERC3-209ENST00000504994 SPRR2DP22532 72 aa0.35□□□□□ -2.35
HERC3-209ENST00000504994 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa0.35□□□□□ -2.35
HERC3-209ENST00000504994 MAST4O15021 2626 aa0.34□□□□□ -2.35
HERC3-209ENST00000504994 HECTD1Q9ULT8 2610 aa0.34□□□□□ -2.35
HERC3-209ENST00000504994 MYCBP2O75592 4640 aa0.34□□□□□ -2.35
HERC3-209ENST00000504994 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP0.34□□□□□ -2.35
HERC3-209ENST00000504994 SNRPGP15A8MWD9 76 aa0.34□□□□□ -2.36
HERC3-209ENST00000504994 H3BUA1 57 aa0.34□□□□□ -2.36
HERC3-209ENST00000504994 PREX2Q70Z35 1606 aa0.34□□□□□ -2.36
HERC3-209ENST00000504994 CACNA1AO00555 2505 aa0.33□□□□□ -2.36
HERC3-209ENST00000504994 CMC2Q9NRP2 79 aa0.33□□□□□ -2.36
HERC3-209ENST00000504994 ALMS1Q8TCU4 4167 aa0.33□□□□□ -2.36
HERC3-209ENST00000504994 MAST1Q9Y2H9 1570 aa0.32□□□□□ -2.36
HERC3-209ENST00000504994 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP0.32□□□□□ -2.36
HERC3-209ENST00000504994 LY75O60449 1722 aa0.31□□□□□ -2.36
HERC3-209ENST00000504994 ABRACLQ9P1F3 81 aa0.31□□□□□ -2.36
HERC3-209ENST00000504994 CLASP1Q7Z460 1538 aa0.31□□□□□ -2.36
HERC3-209ENST00000504994 LPAP08519 4548 aa0.3□□□□□ -2.36
HERC3-209ENST00000504994 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP0.3□□□□□ -2.36
HERC3-209ENST00000504994 AGLP35573 1532 aa0.3□□□□□ -2.36
HERC3-209ENST00000504994 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP0.3□□□□□ -2.36
HERC3-209ENST00000504994 KMT2AQ03164 3969 aa0.3□□□□□ -2.36
HERC3-209ENST00000504994 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP0.29□□□□□ -2.36
HERC3-209ENST00000504994 FANCD2Q9BXW9 1451 aa0.29□□□□□ -2.36
HERC3-209ENST00000504994 FSIP2Q5CZC0 6907 aa0.29□□□□□ -2.36
HERC3-209ENST00000504994 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa0.29□□□□□ -2.36
HERC3-209ENST00000504994 KIF1AQ12756 1690 aa0.29□□□□□ -2.36
HERC3-209ENST00000504994 WNK1Q9H4A3 2382 aa0.28□□□□□ -2.36
HERC3-209ENST00000504994 DCHS2Q6V1P9 2916 aa0.28□□□□□ -2.36
HERC3-209ENST00000504994 ITSN2Q9NZM3 1697 aa0.28□□□□□ -2.36
HERC3-209ENST00000504994 H3BNG1 76 aa0.28□□□□□ -2.36
HERC3-209ENST00000504994 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP0.28□□□□□ -2.36
HERC3-209ENST00000504994 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP0.28□□□□□ -2.37
HERC3-209ENST00000504994 SYCP2Q9BX26 1530 aa0.28□□□□□ -2.37
HERC3-209ENST00000504994 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP0.27□□□□□ -2.37
HERC3-209ENST00000504994 SPRR2BP35325 72 aa0.27□□□□□ -2.37
HERC3-209ENST00000504994 KMT2DO14686 5537 aa0.27□□□□□ -2.37
HERC3-209ENST00000504994 ADCY10Q96PN6 1610 aa0.27□□□□□ -2.37
HERC3-209ENST00000504994 APC2O95996 2303 aa0.26□□□□□ -2.37
HERC3-209ENST00000504994 HMCN2Q8NDA2 5059 aa0.26□□□□□ -2.37
HERC3-209ENST00000504994 C9orf92A6NGG3 77 aa0.26□□□□□ -2.37
HERC3-209ENST00000504994 KAAG1Q9UBP8 84 aa0.26□□□□□ -2.37
HERC3-209ENST00000504994 EFCAB6Q5THR3 1501 aa0.26□□□□□ -2.37
HERC3-209ENST00000504994 CROCC2H7BZ55 1655 aa0.26□□□□□ -2.37
HERC3-209ENST00000504994 PCNX1Q96RV3 2341 aa0.26□□□□□ -2.37
HERC3-209ENST00000504994 ACANP16112 2415 aa0.26□□□□□ -2.37
HERC3-209ENST00000504994 COL7A1Q02388 2944 aa0.26□□□□□ -2.37
HERC3-209ENST00000504994 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP0.25□□□□□ -2.37
HERC3-209ENST00000504994 NF1P21359 2839 aa0.24□□□□□ -2.37
HERC3-209ENST00000504994 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP0.24□□□□□ -2.37
HERC3-209ENST00000504994 MDN1Q9NU22 5596 aa0.24□□□□□ -2.37
HERC3-209ENST00000504994 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa0.24□□□□□ -2.37
HERC3-209ENST00000504994 WFDC10BQ8IUB3 73 aa0.24□□□□□ -2.37
HERC3-209ENST00000504994 HSPG2P98160 4391 aa0.24□□□□□ -2.37
HERC3-209ENST00000504994 MROH2AA6NES4 1674 aa0.24□□□□□ -2.37
HERC3-209ENST00000504994 TFF3Q07654 80 aa0.23□□□□□ -2.37
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