RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481028.1

SGSM3-211, Transcript of small G protein signaling modulator 3, humanhuman

TSL 2

Gene SGSM3, Length 367 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM3-211ENST00000481028 CLEC2BQ92478 149 aa7.23□□□□□ -1.25
SGSM3-211ENST00000481028 PSMB2P49721 201 aa7.22□□□□□ -1.25
SGSM3-211ENST00000481028 LPAP08519 4548 aa7.22□□□□□ -1.25
SGSM3-211ENST00000481028 SPINK1P00995 79 aa7.21□□□□□ -1.26
SGSM3-211ENST00000481028 COX6CP09669 75 aa7.2□□□□□ -1.26
SGSM3-211ENST00000481028 RPS29P62273 56 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
SGSM3-211ENST00000481028 OCIAD2Q56VL3 154 aa7.2□□□□□ -1.26
SGSM3-211ENST00000481028 LRP2P98164 4655 aa7.2□□□□□ -1.26
SGSM3-211ENST00000481028 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa7.19□□□□□ -1.26
SGSM3-211ENST00000481028 SNCGO76070 127 aa7.19□□□□□ -1.26
SGSM3-211ENST00000481028 C4orf48Q5BLP8 95 aa7.19□□□□□ -1.26
SGSM3-211ENST00000481028 A0A0G2JQZ4 141 aa7.17□□□□□ -1.26
SGSM3-211ENST00000481028 LST1O00453 97 aa7.17□□□□□ -1.26
SGSM3-211ENST00000481028 CD164Q04900 197 aa7.17□□□□□ -1.26
SGSM3-211ENST00000481028 TRACP01848 142 aa7.16□□□□□ -1.26
SGSM3-211ENST00000481028 BATFQ16520 125 aa7.16□□□□□ -1.26
SGSM3-211ENST00000481028 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SGSM3-211ENST00000481028 SCGB1C2P0DMR2 95 aa7.15□□□□□ -1.26
SGSM3-211ENST00000481028 RETNLBQ9BQ08 111 aa7.15□□□□□ -1.26
SGSM3-211ENST00000481028 SNHG12Q9BXW3 62 aa7.15□□□□□ -1.26
SGSM3-211ENST00000481028 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SGSM3-211ENST00000481028 F8WEM9 126 aa7.13□□□□□ -1.27
SGSM3-211ENST00000481028 TAX1BP3O14907 124 aa7.13□□□□□ -1.27
SGSM3-211ENST00000481028 TCL1BO95988 128 aa7.13□□□□□ -1.27
SGSM3-211ENST00000481028 DNAL4O96015 105 aa7.13□□□□□ -1.27
SGSM3-211ENST00000481028 GHRHP01286 108 aa7.13□□□□□ -1.27
SGSM3-211ENST00000481028 Q6JHZ5 121 aa7.13□□□□□ -1.27
SGSM3-211ENST00000481028 IGFL1Q6UW32 110 aa7.13□□□□□ -1.27
SGSM3-211ENST00000481028 ORMDL1Q9P0S3 153 aa7.13□□□□□ -1.27
SGSM3-211ENST00000481028 PRR4Q16378 134 aa7.12□□□□□ -1.27
SGSM3-211ENST00000481028 HRCT1Q6UXD1 115 aa7.12□□□□□ -1.27
SGSM3-211ENST00000481028 C9orf118A6NHY6 69 aa7.11□□□□□ -1.27
SGSM3-211ENST00000481028 H3BQ85 93 aa7.11□□□□□ -1.27
SGSM3-211ENST00000481028 H3BUT2 72 aa7.11□□□□□ -1.27
SGSM3-211ENST00000481028 Q5XG85 94 aa7.11□□□□□ -1.27
SGSM3-211ENST00000481028 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa7.1□□□□□ -1.27
SGSM3-211ENST00000481028 FABP2P12104 132 aa7.1□□□□□ -1.27
SGSM3-211ENST00000481028 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
SGSM3-211ENST00000481028 H3BMG7 143 aa7.08□□□□□ -1.28
SGSM3-211ENST00000481028 UBE2V1Q13404 147 aa7.08□□□□□ -1.28
SGSM3-211ENST00000481028 ATXN8Q156A1 80 aa7.08□□□□□ -1.28
SGSM3-211ENST00000481028 LIMD2Q9BT23 127 aa7.08□□□□□ -1.28
SGSM3-211ENST00000481028 RNF213Q63HN8 5207 aa7.07□□□□□ -1.28
SGSM3-211ENST00000481028 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa7.07□□□□□ -1.28
SGSM3-211ENST00000481028 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa7.06□□□□□ -1.28
SGSM3-211ENST00000481028 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa7.06□□□□□ -1.28
SGSM3-211ENST00000481028 A0A1W2PPM0 123 aa7.06□□□□□ -1.28
SGSM3-211ENST00000481028 LYRM7Q5U5X0 104 aa7.06□□□□□ -1.28
SGSM3-211ENST00000481028 Q6Q795 121 aa7.06□□□□□ -1.28
SGSM3-211ENST00000481028 BAALC-AS2P0C853 105 aa7.05□□□□□ -1.28
SGSM3-211ENST00000481028 TPRXLQ17RH7 258 aa7.05□□□□□ -1.28
SGSM3-211ENST00000481028 PCP4L1A6NKN8 68 aa7.04□□□□□ -1.28
SGSM3-211ENST00000481028 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa7.04□□□□□ -1.28
SGSM3-211ENST00000481028 A0A0U1RQV1 116 aa7.03□□□□□ -1.28
SGSM3-211ENST00000481028 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa7.03□□□□□ -1.28
SGSM3-211ENST00000481028 A0A1W2PNM2 257 aa7.02□□□□□ -1.29
SGSM3-211ENST00000481028 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa7.02□□□□□ -1.29
SGSM3-211ENST00000481028 C1orf195Q5TG92 126 aa7.02□□□□□ -1.29
SGSM3-211ENST00000481028 TEN1Q86WV5 123 aa7.02□□□□□ -1.29
SGSM3-211ENST00000481028 ANKRD29Q8N6D5 301 aa7.02□□□□□ -1.29
SGSM3-211ENST00000481028 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa7.01□□□□□ -1.29
SGSM3-211ENST00000481028 MUC17Q685J3 4493 aa7.01□□□□□ -1.29
SGSM3-211ENST00000481028 A0A1B0GV72 72 aa7□□□□□ -1.29
SGSM3-211ENST00000481028 C9JAW5 83 aa6.99□□□□□ -1.29
SGSM3-211ENST00000481028 RBM3P98179 157 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SGSM3-211ENST00000481028 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa6.97□□□□□ -1.29
SGSM3-211ENST00000481028 SPCS1Q9Y6A9 102 aa6.97□□□□□ -1.29
SGSM3-211ENST00000481028 A0A087WSZ3 146 aa6.96□□□□□ -1.3
SGSM3-211ENST00000481028 H3BT86 120 aa6.95□□□□□ -1.3
SGSM3-211ENST00000481028 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa6.94□□□□□ -1.3
SGSM3-211ENST00000481028 CCKP06307 115 aa6.94□□□□□ -1.3
SGSM3-211ENST00000481028 MTURNQ8N3F0 131 aa6.94□□□□□ -1.3
SGSM3-211ENST00000481028 Q96NJ1 140 aa6.94□□□□□ -1.3
SGSM3-211ENST00000481028 DSCR8Q96T75 97 aa6.94□□□□□ -1.3
SGSM3-211ENST00000481028 CDIP1Q9H305 208 aa6.94□□□□□ -1.3
SGSM3-211ENST00000481028 SS18L2Q9UHA2 77 aa6.94□□□□□ -1.3
SGSM3-211ENST00000481028 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.93□□□□□ -1.3
SGSM3-211ENST00000481028 K7EP34 96 aa6.92□□□□□ -1.3
SGSM3-211ENST00000481028 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
SGSM3-211ENST00000481028 Q6ZQT0 140 aa6.92□□□□□ -1.3
SGSM3-211ENST00000481028 PRO0461Q9UI25 63 aa6.91□□□□□ -1.3
SGSM3-211ENST00000481028 XP32Q5T750 250 aa6.89□□□□□ -1.31
SGSM3-211ENST00000481028 C14orf132Q9NPU4 83 aa6.89□□□□□ -1.31
SGSM3-211ENST00000481028 PDE6GP18545 87 aa6.88□□□□□ -1.31
SGSM3-211ENST00000481028 LINC00472Q9H8W2 130 aa6.88□□□□□ -1.31
SGSM3-211ENST00000481028 C9orf92A6NGG3 77 aa6.87□□□□□ -1.31
SGSM3-211ENST00000481028 VPS25Q9BRG1 176 aa6.87□□□□□ -1.31
SGSM3-211ENST00000481028 MUC2Q02817 5179 aa6.86□□□□□ -1.31
SGSM3-211ENST00000481028 A0A1B0GW54 56 aa6.86□□□□□ -1.31
SGSM3-211ENST00000481028 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa6.84□□□□□ -1.31
SGSM3-211ENST00000481028 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa6.83□□□□□ -1.32
SGSM3-211ENST00000481028 IGKV4-1P06312 121 aa6.8□□□□□ -1.32
SGSM3-211ENST00000481028 DEFB116Q30KQ4 102 aa6.8□□□□□ -1.32
SGSM3-211ENST00000481028 F8W1H4 67 aa6.79□□□□□ -1.32
SGSM3-211ENST00000481028 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
SGSM3-211ENST00000481028 RPL37P61927 97 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
SGSM3-211ENST00000481028 SIGMAR1Q99720 223 aa6.77□□□□□ -1.33
SGSM3-211ENST00000481028 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.76□□□□□ -1.33
SGSM3-211ENST00000481028 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa6.76□□□□□ -1.33
SGSM3-211ENST00000481028 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa6.74□□□□□ -1.33
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