RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
SPCS1-201ENST00000233025 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa9.24□□□□□ -0.93
SPCS1-201ENST00000233025 COX6CP09669 75 aa9.24□□□□□ -0.93
SPCS1-201ENST00000233025 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa9.24□□□□□ -0.93
SPCS1-201ENST00000233025 USH2AO75445 5202 aa9.23□□□□□ -0.93
SPCS1-201ENST00000233025 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa9.21□□□□□ -0.94
SPCS1-201ENST00000233025 NKAPP1Q8N9T2 125 aa9.2□□□□□ -0.94
SPCS1-201ENST00000233025 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
SPCS1-201ENST00000233025 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa9.19□□□□□ -0.94
SPCS1-201ENST00000233025 IGKV2D-28P01615 120 aa9.19□□□□□ -0.94
SPCS1-201ENST00000233025 VPREB1P12018 145 aa9.19□□□□□ -0.94
SPCS1-201ENST00000233025 UBE2AP49459 152 aa9.19□□□□□ -0.94
SPCS1-201ENST00000233025 NDUFC2O95298 119 aa9.18□□□□□ -0.94
SPCS1-201ENST00000233025 Q8NDZ9 215 aa9.18□□□□□ -0.94
SPCS1-201ENST00000233025 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
SPCS1-201ENST00000233025 OR13C6PQ8NH95 151 aa9.17□□□□□ -0.94
SPCS1-201ENST00000233025 PRLHP81277 87 aa9.16□□□□□ -0.94
SPCS1-201ENST00000233025 LCE4AQ5TA78 99 aa9.16□□□□□ -0.94
SPCS1-201ENST00000233025 TRIAP1O43715 76 aa9.15□□□□□ -0.94
SPCS1-201ENST00000233025 ATXN8Q156A1 80 aa9.15□□□□□ -0.94
SPCS1-201ENST00000233025 H3BMG7 143 aa9.14□□□□□ -0.95
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM126AQ9H061 195 aa9.14□□□□□ -0.95
SPCS1-201ENST00000233025 F8W1H4 67 aa9.13□□□□□ -0.95
SPCS1-201ENST00000233025 M0R378 163 aa9.13□□□□□ -0.95
SPCS1-201ENST00000233025 TCL1BO95988 128 aa9.13□□□□□ -0.95
SPCS1-201ENST00000233025 C3orf22Q8N5N4 141 aa9.13□□□□□ -0.95
SPCS1-201ENST00000233025 SPAG11AQ6PDA7 123 aa9.12□□□□□ -0.95
SPCS1-201ENST00000233025 S100A7L2Q5SY68 101 aa9.11□□□□□ -0.95
SPCS1-201ENST00000233025 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa9.11□□□□□ -0.95
SPCS1-201ENST00000233025 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa9.11□□□□□ -0.95
SPCS1-201ENST00000233025 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa9.09□□□□□ -0.95
SPCS1-201ENST00000233025 NCR3O14931 201 aa9.09□□□□□ -0.95
SPCS1-201ENST00000233025 CBY1Q9Y3M2 126 aa9.09□□□□□ -0.95
SPCS1-201ENST00000233025 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
SPCS1-201ENST00000233025 H0YGX0 51 aa9.08□□□□□ -0.96
SPCS1-201ENST00000233025 M0R2T5 61 aa9.08□□□□□ -0.96
SPCS1-201ENST00000233025 SMIM11BQ8TCY0 68 aa9.08□□□□□ -0.96
SPCS1-201ENST00000233025 LST1O00453 97 aa9.06□□□□□ -0.96
SPCS1-201ENST00000233025 C9JAW5 83 aa9.05□□□□□ -0.96
SPCS1-201ENST00000233025 SNCGO76070 127 aa9.05□□□□□ -0.96
SPCS1-201ENST00000233025 CLEC2BQ92478 149 aa9.05□□□□□ -0.96
SPCS1-201ENST00000233025 SLC25A20O43772 301 aa9.03□□□□□ -0.96
SPCS1-201ENST00000233025 TRACP01848 142 aa9.03□□□□□ -0.96
SPCS1-201ENST00000233025 HIGD2AQ9BW72 106 aa9.03□□□□□ -0.96
SPCS1-201ENST00000233025 MTURNQ8N3F0 131 aa9.02□□□□□ -0.97
SPCS1-201ENST00000233025 SPRR4Q96PI1 79 aa9.02□□□□□ -0.97
SPCS1-201ENST00000233025 PRO0461Q9UI25 63 aa9.02□□□□□ -0.97
SPCS1-201ENST00000233025 DNAL4O96015 105 aa9.01□□□□□ -0.97
SPCS1-201ENST00000233025 H3BT86 120 aa9□□□□□ -0.97
SPCS1-201ENST00000233025 IGLV6-57P01721 117 aa9□□□□□ -0.97
SPCS1-201ENST00000233025 K7ERU9 68 aa8.99□□□□□ -0.97
SPCS1-201ENST00000233025 SPRR1AP35321 89 aa8.99□□□□□ -0.97
SPCS1-201ENST00000233025 ANKRD29Q8N6D5 301 aa8.99□□□□□ -0.97
SPCS1-201ENST00000233025 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa8.98□□□□□ -0.97
SPCS1-201ENST00000233025 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa8.98□□□□□ -0.97
SPCS1-201ENST00000233025 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa8.98□□□□□ -0.97
SPCS1-201ENST00000233025 A0A1B0GX51 115 aa8.98□□□□□ -0.97
SPCS1-201ENST00000233025 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
SPCS1-201ENST00000233025 J3QR89 54 aa8.98□□□□□ -0.97
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SPCS1-201ENST00000233025 ETDBQ3ZM63 59 aa8.97□□□□□ -0.97
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SPCS1-201ENST00000233025 PCOTHQ58A44 107 aa8.97□□□□□ -0.97
SPCS1-201ENST00000233025 OCIAD2Q56VL3 154 aa8.96□□□□□ -0.98
SPCS1-201ENST00000233025 TEN1Q86WV5 123 aa8.96□□□□□ -0.98
SPCS1-201ENST00000233025 Q8NBF4 154 aa8.96□□□□□ -0.98
SPCS1-201ENST00000233025 FAM218AQ96MZ4 157 aa8.95□□□□□ -0.98
SPCS1-201ENST00000233025 KCNQ1DNQ9H478 68 aa8.95□□□□□ -0.98
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
SPCS1-201ENST00000233025 SPINK1P00995 79 aa8.94□□□□□ -0.98
SPCS1-201ENST00000233025 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa8.93□□□□□ -0.98
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
SPCS1-201ENST00000233025 BAALC-AS2P0C853 105 aa8.93□□□□□ -0.98
SPCS1-201ENST00000233025 COX7BP24311 80 aa8.93□□□□□ -0.98
SPCS1-201ENST00000233025 SMCR5Q8TEV8 140 aa8.93□□□□□ -0.98
SPCS1-201ENST00000233025 PPDPFLQ8WWR9 84 aa8.93□□□□□ -0.98
SPCS1-201ENST00000233025 LINC00483Q53H64 154 aa8.92□□□□□ -0.98
SPCS1-201ENST00000233025 Q8N377 158 aa8.92□□□□□ -0.98
SPCS1-201ENST00000233025 ORMDL1Q9P0S3 153 aa8.91□□□□□ -0.98
SPCS1-201ENST00000233025 hADV29S1A0JD25 119 aa8.9□□□□□ -0.98
SPCS1-201ENST00000233025 LINC00575Q6W349 94 aa8.9□□□□□ -0.98
SPCS1-201ENST00000233025 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa8.89□□□□□ -0.99
SPCS1-201ENST00000233025 H3BQ85 93 aa8.89□□□□□ -0.99
SPCS1-201ENST00000233025 B5MCH6 92 aa8.87□□□□□ -0.99
SPCS1-201ENST00000233025 ERC2-IT1O76042 136 aa8.87□□□□□ -0.99
SPCS1-201ENST00000233025 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
SPCS1-201ENST00000233025 RPS29P62273 56 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
SPCS1-201ENST00000233025 COX6B2Q6YFQ2 88 aa8.86□□□□□ -0.99
SPCS1-201ENST00000233025 Q9BRP9 147 aa8.86□□□□□ -0.99
SPCS1-201ENST00000233025 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa8.86□□□□□ -0.99
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa8.85□□□□□ -0.99
SPCS1-201ENST00000233025 MOBPQ13875 183 aa8.84□□□□□ -0.99
SPCS1-201ENST00000233025 GAGE2AQ6NT46 116 aa8.84□□□□□ -0.99
SPCS1-201ENST00000233025 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
SPCS1-201ENST00000233025 Q6ZRX8 168 aa8.83□□□□□ -1
SPCS1-201ENST00000233025 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa8.82□□□□□ -1
SPCS1-201ENST00000233025 VPS25Q9BRG1 176 aa8.82□□□□□ -1
SPCS1-201ENST00000233025 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa8.82□□□□□ -1
SPCS1-201ENST00000233025 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa8.81□□□□□ -1
SPCS1-201ENST00000233025 Q6ZQY7 126 aa8.8□□□□□ -1
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