RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028157.8

Gtf3c5-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 5, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c5, Length 2,739 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm6871L7N248 545 aa10.57□□□□□ -0.72
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 CrygbP04344 175 aa10.57□□□□□ -0.72
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Pde6hP61249 83 aa10.57□□□□□ -0.72
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 RnasekQ8K3C0 98 aa10.57□□□□□ -0.72
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Q9DAZ5 108 aa10.57□□□□□ -0.72
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Vmn1r119E9Q4H3 307 aa10.56□□□□□ -0.72
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr235E9Q9Z6 312 aa10.56□□□□□ -0.72
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Aqp7O54794 303 aa10.56□□□□□ -0.72
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 P01724 129 aa10.56□□□□□ -0.72
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Fbln7Q501P1 440 aa10.56□□□□□ -0.72
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 HeylQ9DBX7 326 aa10.56□□□□□ -0.72
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Igkv4-90A0A075B5L3 117 aa10.56□□□□□ -0.72
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Brs3O54798 399 aa10.56□□□□□ -0.72
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cela2aP05208 271 aa10.56□□□□□ -0.72
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Txn2P97493 166 aa10.56□□□□□ -0.72
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 SnrpcQ62241 159 aa10.56□□□□□ -0.72
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tmem140Q8BGY5 185 aa10.56□□□□□ -0.72
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 1700056E22RikF7CNM6 234 aa10.55□□□□□ -0.72
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ly6lH3BJG9 140 aa10.55□□□□□ -0.72
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Reg1P43137 165 aa10.55□□□□□ -0.72
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Slc31a2Q9CPU9 143 aa10.55□□□□□ -0.72
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Q9CR34 168 aa10.55□□□□□ -0.72
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tmem89Q9DA04 169 aa10.55□□□□□ -0.72
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Trav14-3A0A075B607 120 aa10.55□□□□□ -0.72
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Trav14d-1A0A075B6B1 121 aa10.55□□□□□ -0.72
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Pmp2P24526 132 aa10.55□□□□□ -0.72
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Arl11Q6P3A9 176 aa10.55□□□□□ -0.72
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 ChtopQ9CY57 249 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm15557A6PWY0 234 aa10.54□□□□□ -0.72
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 P01793 123 aa10.54□□□□□ -0.72
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm17334Q8C6U3 126 aa10.54□□□□□ -0.72
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr1195Q8VG21 308 aa10.54□□□□□ -0.72
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Nat6Q9R123 314 aa10.54□□□□□ -0.72
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ccl17F6R5P4 103 aa10.54□□□□□ -0.72
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rpl13a-ps1A0A140T8K2 203 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 1700067P10RikG3X8U2 183 aa10.53□□□□□ -0.72
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Mbd3l2Q3UXB0 228 aa10.53□□□□□ -0.72
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Obox7Q4KL20 218 aa10.53□□□□□ -0.72
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rasl10aQ8K5A4 203 aa10.53□□□□□ -0.72
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ramp1Q9WTJ5 148 aa10.53□□□□□ -0.72
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rhox7bA6PW38 321 aa10.53□□□□□ -0.72
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 KprpB2RUR4 657 aa10.53□□□□□ -0.72
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Znf239P24399 201 aa10.53□□□□□ -0.72
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tnfsf15Q5UBV8 252 aa10.53□□□□□ -0.72
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tnfsf18Q7TS55 173 aa10.53□□□□□ -0.72
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tmem11Q8BK08 190 aa10.53□□□□□ -0.72
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Muc15Q8C6Z1 331 aa10.53□□□□□ -0.72
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Zfp92Q62396 488 aa10.52□□□□□ -0.72
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 5930422O12RikQ8C4Y4 123 aa10.52□□□□□ -0.72
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Stxbp6Q8R3T5 210 aa10.52□□□□□ -0.72
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr873Q8VFJ0 319 aa10.52□□□□□ -0.72
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Spink12Q9D256 87 aa10.52□□□□□ -0.72
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm11565A2A4M7 156 aa10.52□□□□□ -0.73
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm10036E9PYL9 178 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm9964E9Q9S5 144 aa10.52□□□□□ -0.73
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 DdtO35215 118 aa10.52□□□□□ -0.73
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tdgf1P51865 171 aa10.52□□□□□ -0.73
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr553Q7TRS6 326 aa10.52□□□□□ -0.73
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Lypd1Q8BLC3 141 aa10.52□□□□□ -0.73
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Hif1anQ8BLR9 349 aa10.52□□□□□ -0.73
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Bub3Q9WVA3 326 aa10.52□□□□□ -0.73
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ighv1-4A0A075B5T4 117 aa10.51□□□□□ -0.73
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rplp1P47955 114 aa10.51□□□□□ -0.73
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 F2rl1P55086 399 aa10.51□□□□□ -0.73
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Siah2Q06986 325 aa10.51□□□□□ -0.73
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ang2Q64438 145 aa10.51□□□□□ -0.73
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Hoxc12Q8K5B8 280 aa10.51□□□□□ -0.73
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Edn2P22389 175 aa10.51□□□□□ -0.73
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm5148Q8BGG2 154 aa10.51□□□□□ -0.73
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Prr9Q8BV84 116 aa10.51□□□□□ -0.73
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tmem52Q9D702 196 aa10.51□□□□□ -0.73
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Wfdc15bQ9JHY4 80 aa10.51□□□□□ -0.73
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Plekhb2Q9QZC7 221 aa10.51□□□□□ -0.73
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 LystP97412 3788 aa10.5□□□□□ -0.73
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Plcxd2B2RXA1 340 aa10.5□□□□□ -0.73
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Zfp493E9Q1L8 384 aa10.5□□□□□ -0.73
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gp9O88186 177 aa10.5□□□□□ -0.73
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Psg25Q497W1 475 aa10.5□□□□□ -0.73
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Vwc2lQ505H4 222 aa10.5□□□□□ -0.73
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Trpt1Q8K3A2 249 aa10.5□□□□□ -0.73
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Npc2Q9Z0J0 149 aa10.5□□□□□ -0.73
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ighv1-74A0A0G2JGK2 117 aa10.5□□□□□ -0.73
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm13030A2APQ6 143 aa10.5□□□□□ -0.73
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Armcx4E9PWM3 2356 aa10.5□□□□□ -0.73
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Igll1P20764 209 aa10.5□□□□□ -0.73
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Mob4Q6PEB6 225 aa10.5□□□□□ -0.73
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Nanos1Q80WY3 267 aa10.5□□□□□ -0.73
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Dido1Q8C9B9 2256 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Prelid1Q8R107 217 aa10.5□□□□□ -0.73
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr981Q8VEU2 310 aa10.5□□□□□ -0.73
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Leprotl1Q9CQ74 131 aa10.5□□□□□ -0.73
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Trav12-3A0A075B648 115 aa10.49□□□□□ -0.73
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Trav21-dv12A0A075B6C4 109 aa10.49□□□□□ -0.73
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Igkv4-59A0A0B4J1I8 117 aa10.49□□□□□ -0.73
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 H2-DMb2Q31099 261 aa10.49□□□□□ -0.73
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr1262Q8VGN2 304 aa10.49□□□□□ -0.73
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 UrahQ9CRB3 118 aa10.49□□□□□ -0.73
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Mrpl32Q9DCI9 187 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Fabp4P04117 132 aa10.49□□□□□ -0.73
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Uqcc3Q8K2T4 89 aa10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 106.8 ms