RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542133.5

NPIPB4-215, Transcript of nuclear pore complex interacting protein family member B4, human

TSL 3

Gene NPIPB4, Length 910 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NPIPB4-215	ENST00000542133	SOCS3	O14543	225 aa		5.13	□□□□□ -1.59
NPIPB4-215	ENST00000542133	INS	P01308	110 aa		5.13	□□□□□ -1.59
NPIPB4-215	ENST00000542133	RNASE2	P10153	161 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
NPIPB4-215	ENST00000542133	GCHFR	P30047	84 aa		5.13	□□□□□ -1.59
NPIPB4-215	ENST00000542133	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		5.13	□□□□□ -1.59
NPIPB4-215	ENST00000542133		Q6ZSA8	131 aa		5.13	□□□□□ -1.59
NPIPB4-215	ENST00000542133	SLC25A2	Q9BXI2	301 aa		5.13	□□□□□ -1.59
NPIPB4-215	ENST00000542133	OSTC	Q9NRP0	149 aa		5.13	□□□□□ -1.59
NPIPB4-215	ENST00000542133	NPY	P01303	97 aa		5.12	□□□□□ -1.59
NPIPB4-215	ENST00000542133	PRSS1	P07477	247 aa		5.12	□□□□□ -1.59
NPIPB4-215	ENST00000542133	PRSS2	P07478	247 aa		5.12	□□□□□ -1.59
NPIPB4-215	ENST00000542133	ERH	P84090	104 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
NPIPB4-215	ENST00000542133	ZNF56	Q15929	161 aa		5.12	□□□□□ -1.59
NPIPB4-215	ENST00000542133	SPINK9	Q5DT21	86 aa		5.12	□□□□□ -1.59
NPIPB4-215	ENST00000542133	NRAC	Q8N912	160 aa		5.12	□□□□□ -1.59
NPIPB4-215	ENST00000542133	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		5.12	□□□□□ -1.59
NPIPB4-215	ENST00000542133	MRPL35	Q9NZE8	188 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
NPIPB4-215	ENST00000542133		A0A096LPF7	62 aa		5.11	□□□□□ -1.59
NPIPB4-215	ENST00000542133		K7EQD1	137 aa		5.11	□□□□□ -1.59
NPIPB4-215	ENST00000542133	IGLV2-8	P01709	118 aa		5.11	□□□□□ -1.59
NPIPB4-215	ENST00000542133	IL4	P05112	153 aa		5.11	□□□□□ -1.59
NPIPB4-215	ENST00000542133	MT1HL1	P0DM35	61 aa		5.11	□□□□□ -1.59
NPIPB4-215	ENST00000542133	UBE2D3	P61077	147 aa		5.11	□□□□□ -1.59
NPIPB4-215	ENST00000542133	UBE2D2	P62837	147 aa		5.11	□□□□□ -1.59
NPIPB4-215	ENST00000542133	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		5.11	□□□□□ -1.59
NPIPB4-215	ENST00000542133	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		5.11	□□□□□ -1.59
NPIPB4-215	ENST00000542133	PATE2	Q6UY27	113 aa		5.11	□□□□□ -1.59
NPIPB4-215	ENST00000542133	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		5.11	□□□□□ -1.59
NPIPB4-215	ENST00000542133	C16orf74	Q96GX8	76 aa		5.11	□□□□□ -1.59
NPIPB4-215	ENST00000542133	CYSTM1	Q9H1C7	97 aa		5.11	□□□□□ -1.59
NPIPB4-215	ENST00000542133	TIMM8B	Q9Y5J9	83 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
NPIPB4-215	ENST00000542133	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		5.1	□□□□□ -1.59
NPIPB4-215	ENST00000542133	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		5.1	□□□□□ -1.59
NPIPB4-215	ENST00000542133	PRB4	P10163	310 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
NPIPB4-215	ENST00000542133	NOP10	Q9NPE3	64 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
NPIPB4-215	ENST00000542133	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		5.1	□□□□□ -1.59
NPIPB4-215	ENST00000542133	TRAV13-2	A0A0B4J235	113 aa		5.09	□□□□□ -1.59
NPIPB4-215	ENST00000542133	MYMX	A0A1B0GTQ4	84 aa		5.09	□□□□□ -1.59
NPIPB4-215	ENST00000542133	CRYM-AS1	A6NIL9	109 aa		5.09	□□□□□ -1.59
NPIPB4-215	ENST00000542133	PEX7	O00628	323 aa		5.09	□□□□□ -1.59
NPIPB4-215	ENST00000542133	RHOH	Q15669	191 aa		5.09	□□□□□ -1.59
NPIPB4-215	ENST00000542133		Q8N814	137 aa		5.09	□□□□□ -1.59
NPIPB4-215	ENST00000542133	DAND5	Q8N907	189 aa		5.09	□□□□□ -1.59
NPIPB4-215	ENST00000542133	FAM104A	Q969W3	186 aa		5.09	□□□□□ -1.59
NPIPB4-215	ENST00000542133	IFI27L1	Q96BM0	104 aa		5.09	□□□□□ -1.59
NPIPB4-215	ENST00000542133	CHCHD1	Q96BP2	118 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
NPIPB4-215	ENST00000542133	LINC00467	Q9BRT7	94 aa		5.09	□□□□□ -1.59
NPIPB4-215	ENST00000542133		H7BZZ5	65 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NPIPB4-215	ENST00000542133	SLC25A20	O43772	301 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NPIPB4-215	ENST00000542133	IGKV1-39	P01597	117 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NPIPB4-215	ENST00000542133	IGKV1D-39	P04432	117 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NPIPB4-215	ENST00000542133	RBM3	P98179	157 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
NPIPB4-215	ENST00000542133	KLKP1	Q107X0	134 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NPIPB4-215	ENST00000542133	FHL2	Q14192	279 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NPIPB4-215	ENST00000542133	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
NPIPB4-215	ENST00000542133	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NPIPB4-215	ENST00000542133	HTN1	P15515	57 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NPIPB4-215	ENST00000542133	FXYD2	P54710	66 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NPIPB4-215	ENST00000542133	REG3A	Q06141	175 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NPIPB4-215	ENST00000542133	MIR17HG	Q75NE6	70 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NPIPB4-215	ENST00000542133	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NPIPB4-215	ENST00000542133	SMIM7	Q9BQ49	75 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NPIPB4-215	ENST00000542133	NHP2	Q9NX24	153 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
NPIPB4-215	ENST00000542133	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NPIPB4-215	ENST00000542133	TRAV1-2	A0A0B4J238	106 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NPIPB4-215	ENST00000542133	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NPIPB4-215	ENST00000542133	GAS8-AS1	O95177	125 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NPIPB4-215	ENST00000542133	XCL1	P47992	114 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NPIPB4-215	ENST00000542133	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
NPIPB4-215	ENST00000542133	MRPL51	Q4U2R6	128 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
NPIPB4-215	ENST00000542133	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NPIPB4-215	ENST00000542133	SOSTDC1	Q6X4U4	206 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NPIPB4-215	ENST00000542133	CLEC2B	Q92478	149 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NPIPB4-215	ENST00000542133	UBE2W	Q96B02	151 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NPIPB4-215	ENST00000542133	SND1-IT1	Q9HBX3	110 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NPIPB4-215	ENST00000542133	GNG13	Q9P2W3	67 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NPIPB4-215	ENST00000542133		A0A0B4J2C4	111 aa		5.05	□□□□□ -1.6
NPIPB4-215	ENST00000542133	C19orf71	A6NCJ1	209 aa		5.05	□□□□□ -1.6
NPIPB4-215	ENST00000542133	LEPROT	O15243	131 aa		5.05	□□□□□ -1.6
NPIPB4-215	ENST00000542133	PSCA	O43653	123 aa		5.05	□□□□□ -1.6
NPIPB4-215	ENST00000542133	TSHB	P01222	138 aa		5.05	□□□□□ -1.6
NPIPB4-215	ENST00000542133	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		5.05	□□□□□ -1.6
NPIPB4-215	ENST00000542133	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		5.05	□□□□□ -1.6
NPIPB4-215	ENST00000542133	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		5.05	□□□□□ -1.6
NPIPB4-215	ENST00000542133	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		5.05	□□□□□ -1.6
NPIPB4-215	ENST00000542133	MUC2	Q02817	5179 aa		5.04	□□□□□ -1.6
NPIPB4-215	ENST00000542133	KRTAP16-1	A8MUX0	517 aa		5.03	□□□□□ -1.6
NPIPB4-215	ENST00000542133	LEPROTL1	O95214	131 aa		5.03	□□□□□ -1.6
NPIPB4-215	ENST00000542133		Q6ZTI0	123 aa		5.03	□□□□□ -1.6
NPIPB4-215	ENST00000542133	C8orf49	Q96NF6	230 aa		5.03	□□□□□ -1.6
NPIPB4-215	ENST00000542133	LPA	P08519	4548 aa		5.02	□□□□□ -1.61
NPIPB4-215	ENST00000542133	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		5.02	□□□□□ -1.61
NPIPB4-215	ENST00000542133	GNRH2	O43555	120 aa		5.02	□□□□□ -1.61
NPIPB4-215	ENST00000542133	C2orf83	Q53S99	150 aa		5.02	□□□□□ -1.61
NPIPB4-215	ENST00000542133	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		5.02	□□□□□ -1.61
NPIPB4-215	ENST00000542133	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		5.02	□□□□□ -1.61
NPIPB4-215	ENST00000542133	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		5.02	□□□□□ -1.61
NPIPB4-215	ENST00000542133	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		5.02	□□□□□ -1.61
NPIPB4-215	ENST00000542133	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		5.01	□□□□□ -1.61
NPIPB4-215	ENST00000542133	CHTF8	P0CG12	524 aa		5.01	□□□□□ -1.61

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