RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472278.1

LRRTM3-202, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 3, humanhuman

TSL 2

Gene LRRTM3, Length 264 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM3-202ENST00000472278 SHPRHQ149N8 1683 aa-0.22□□□□□ -2.44
LRRTM3-202ENST00000472278 ACANP16112 2415 aa-0.22□□□□□ -2.44
LRRTM3-202ENST00000472278 KNDC1Q76NI1 1749 aa-0.22□□□□□ -2.44
LRRTM3-202ENST00000472278 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa-0.22□□□□□ -2.45
LRRTM3-202ENST00000472278 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP-0.22□□□□□ -2.45
LRRTM3-202ENST00000472278 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP-0.23□□□□□ -2.45
LRRTM3-202ENST00000472278 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP-0.23□□□□□ -2.45
LRRTM3-202ENST00000472278 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa-0.23□□□□□ -2.45
LRRTM3-202ENST00000472278 D6R8Y8 96 aa-0.23□□□□□ -2.45
LRRTM3-202ENST00000472278 CCL22O00626 93 aa-0.23□□□□□ -2.45
LRRTM3-202ENST00000472278 FAUP35544 74 aaKnown RBP-0.23□□□□□ -2.45
LRRTM3-202ENST00000472278 MUSTN1Q8IVN3 82 aa-0.23□□□□□ -2.45
LRRTM3-202ENST00000472278 NRXN1Q9ULB1 1477 aa-0.23□□□□□ -2.45
LRRTM3-202ENST00000472278 SLIT1O75093 1534 aa-0.23□□□□□ -2.45
LRRTM3-202ENST00000472278 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa-0.24□□□□□ -2.45
LRRTM3-202ENST00000472278 LEPROTL1O95214 131 aa-0.24□□□□□ -2.45
LRRTM3-202ENST00000472278 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa-0.24□□□□□ -2.45
LRRTM3-202ENST00000472278 NCMAPQ5T1S8 102 aa-0.24□□□□□ -2.45
LRRTM3-202ENST00000472278 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP-0.24□□□□□ -2.45
LRRTM3-202ENST00000472278 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP-0.24□□□□□ -2.45
LRRTM3-202ENST00000472278 SAMD9Q5K651 1589 aa-0.24□□□□□ -2.45
LRRTM3-202ENST00000472278 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa-0.24□□□□□ -2.45
LRRTM3-202ENST00000472278 ANKRD36A6QL64 1941 aa-0.25□□□□□ -2.45
LRRTM3-202ENST00000472278 F8WEM9 126 aa-0.25□□□□□ -2.45
LRRTM3-202ENST00000472278 PSENENQ9NZ42 101 aa-0.25□□□□□ -2.45
LRRTM3-202ENST00000472278 CLIP1P30622 1438 aa-0.25□□□□□ -2.45
LRRTM3-202ENST00000472278 VPS8Q8N3P4 1428 aa-0.25□□□□□ -2.45
LRRTM3-202ENST00000472278 CUX1P39880 1505 aa-0.25□□□□□ -2.45
LRRTM3-202ENST00000472278 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP-0.25□□□□□ -2.45
LRRTM3-202ENST00000472278 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP-0.26□□□□□ -2.45
LRRTM3-202ENST00000472278 S100A8P05109 93 aa-0.26□□□□□ -2.45
LRRTM3-202ENST00000472278 SMIM11AP58511 58 aa-0.26□□□□□ -2.45
LRRTM3-202ENST00000472278 PDZD2O15018 2839 aa-0.26□□□□□ -2.45
LRRTM3-202ENST00000472278 MON2Q7Z3U7 1717 aa-0.27□□□□□ -2.45
LRRTM3-202ENST00000472278 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP-0.27□□□□□ -2.45
LRRTM3-202ENST00000472278 C5P01031 1676 aa-0.27□□□□□ -2.45
LRRTM3-202ENST00000472278 FANCAO15360 1455 aa-0.27□□□□□ -2.45
LRRTM3-202ENST00000472278 GYPAP02724 150 aa-0.27□□□□□ -2.45
LRRTM3-202ENST00000472278 IGLC2P0DOY2 106 aa-0.27□□□□□ -2.45
LRRTM3-202ENST00000472278 IGLC3P0DOY3 106 aa-0.27□□□□□ -2.45
LRRTM3-202ENST00000472278 DEFB135Q30KP9 77 aa-0.27□□□□□ -2.45
LRRTM3-202ENST00000472278 C9orf62Q8N4C0 152 aa-0.27□□□□□ -2.45
LRRTM3-202ENST00000472278 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa-0.27□□□□□ -2.45
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LRRTM3-202ENST00000472278 ATP10BO94823 1461 aa-0.28□□□□□ -2.45
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LRRTM3-202ENST00000472278 HIGD1BQ9P298 99 aa-0.28□□□□□ -2.45
LRRTM3-202ENST00000472278 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa-0.28□□□□□ -2.45
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LRRTM3-202ENST00000472278 ABCC10Q5T3U5 1492 aa-0.29□□□□□ -2.46
LRRTM3-202ENST00000472278 REV3LO60673 3130 aa-0.29□□□□□ -2.46
LRRTM3-202ENST00000472278 DEFB112Q30KQ8 113 aa-0.29□□□□□ -2.46
LRRTM3-202ENST00000472278 NMSQ5H8A3 153 aa-0.29□□□□□ -2.46
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LRRTM3-202ENST00000472278 PEA15Q15121 130 aa-0.3□□□□□ -2.46
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LRRTM3-202ENST00000472278 PKHD1P08F94 4074 aa-0.3□□□□□ -2.46
LRRTM3-202ENST00000472278 MYH4Q9Y623 1939 aa-0.3□□□□□ -2.46
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LRRTM3-202ENST00000472278 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa-0.31□□□□□ -2.46
LRRTM3-202ENST00000472278 COX6B2Q6YFQ2 88 aa-0.31□□□□□ -2.46
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LRRTM3-202ENST00000472278 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP-0.32□□□□□ -2.46
LRRTM3-202ENST00000472278 UBR3Q6ZT12 1888 aa-0.32□□□□□ -2.46
LRRTM3-202ENST00000472278 MAGI2Q86UL8 1455 aa-0.32□□□□□ -2.46
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LRRTM3-202ENST00000472278 SVEP1Q4LDE5 3571 aa-0.33□□□□□ -2.46
LRRTM3-202ENST00000472278 CYB5AP00167 134 aa-0.33□□□□□ -2.46
LRRTM3-202ENST00000472278 PYY3Q5JQD4 70 aa-0.33□□□□□ -2.46
LRRTM3-202ENST00000472278 C20orf78Q9BR46 151 aa-0.33□□□□□ -2.46
LRRTM3-202ENST00000472278 PKD1L3Q7Z443 1732 aa-0.33□□□□□ -2.46
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LRRTM3-202ENST00000472278 CEP162Q5TB80 1403 aa-0.34□□□□□ -2.46
LRRTM3-202ENST00000472278 TRANK1O15050 2925 aa-0.34□□□□□ -2.46
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LRRTM3-202ENST00000472278 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa-0.35□□□□□ -2.46
LRRTM3-202ENST00000472278 QSER1Q2KHR3 1735 aa-0.35□□□□□ -2.47
LRRTM3-202ENST00000472278 IQCF6A8MYZ5 107 aa-0.35□□□□□ -2.47
LRRTM3-202ENST00000472278 H0YGG7 62 aa-0.35□□□□□ -2.47
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LRRTM3-202ENST00000472278 Q9H521 79 aa-0.35□□□□□ -2.47
LRRTM3-202ENST00000472278 AKAP12Q02952 1782 aa-0.35□□□□□ -2.47
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LRRTM3-202ENST00000472278 KNL1Q8NG31 2342 aa-0.36□□□□□ -2.47
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