RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526386.5

UBASH3B-203, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 4

Gene UBASH3B, Length 553 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-203ENST00000526386 UPK3BQ9BT76 320 aa4.77□□□□□ -1.65
UBASH3B-203ENST00000526386 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
UBASH3B-203ENST00000526386 LYSTQ99698 3801 aa4.77□□□□□ -1.65
UBASH3B-203ENST00000526386 CSMD3Q7Z407 3707 aa4.76□□□□□ -1.65
UBASH3B-203ENST00000526386 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa4.76□□□□□ -1.65
UBASH3B-203ENST00000526386 A4D1N5 150 aa4.76□□□□□ -1.65
UBASH3B-203ENST00000526386 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa4.76□□□□□ -1.65
UBASH3B-203ENST00000526386 IGLL5B9A064 214 aa4.76□□□□□ -1.65
UBASH3B-203ENST00000526386 K7ERJ3 54 aa4.76□□□□□ -1.65
UBASH3B-203ENST00000526386 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
UBASH3B-203ENST00000526386 UBE2WQ96B02 151 aa4.76□□□□□ -1.65
UBASH3B-203ENST00000526386 APLNQ9ULZ1 77 aa4.76□□□□□ -1.65
UBASH3B-203ENST00000526386 RYR2Q92736 4967 aa4.75□□□□□ -1.65
UBASH3B-203ENST00000526386 PRSS2P07478 247 aa4.75□□□□□ -1.65
UBASH3B-203ENST00000526386 CCL18P55774 89 aa4.75□□□□□ -1.65
UBASH3B-203ENST00000526386 RPL24P83731 157 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
UBASH3B-203ENST00000526386 C6orf226Q5I0X4 101 aa4.75□□□□□ -1.65
UBASH3B-203ENST00000526386 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa4.75□□□□□ -1.65
UBASH3B-203ENST00000526386 LINC00308Q8TCZ7 52 aa4.75□□□□□ -1.65
UBASH3B-203ENST00000526386 TOMM7Q9P0U1 55 aa4.75□□□□□ -1.65
UBASH3B-203ENST00000526386 A0A0B4J2C4 111 aa4.74□□□□□ -1.65
UBASH3B-203ENST00000526386 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa4.74□□□□□ -1.65
UBASH3B-203ENST00000526386 CXCL5P42830 114 aa4.74□□□□□ -1.65
UBASH3B-203ENST00000526386 ARL17AQ8IVW1 177 aa4.74□□□□□ -1.65
UBASH3B-203ENST00000526386 RAB37Q96AX2 223 aa4.74□□□□□ -1.65
UBASH3B-203ENST00000526386 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
UBASH3B-203ENST00000526386 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
UBASH3B-203ENST00000526386 A0A1W2PPM0 123 aa4.73□□□□□ -1.65
UBASH3B-203ENST00000526386 H3BUT2 72 aa4.73□□□□□ -1.65
UBASH3B-203ENST00000526386 APOMO95445 188 aa4.73□□□□□ -1.65
UBASH3B-203ENST00000526386 CRPP02741 224 aa4.73□□□□□ -1.65
UBASH3B-203ENST00000526386 MALP21145 153 aa4.73□□□□□ -1.65
UBASH3B-203ENST00000526386 UBE2V1Q13404 147 aa4.73□□□□□ -1.65
UBASH3B-203ENST00000526386 MEIG1Q5JSS6 88 aa4.73□□□□□ -1.65
UBASH3B-203ENST00000526386 DAND5Q8N907 189 aa4.73□□□□□ -1.65
UBASH3B-203ENST00000526386 COPS9Q8WXC6 57 aa4.73□□□□□ -1.65
UBASH3B-203ENST00000526386 PRO1854Q9UHT4 67 aa4.73□□□□□ -1.65
UBASH3B-203ENST00000526386 ERG28Q9UKR5 140 aa4.73□□□□□ -1.65
UBASH3B-203ENST00000526386 STARD9Q9P2P6 4700 aa4.72□□□□□ -1.65
UBASH3B-203ENST00000526386 TSPAN13O95857 204 aa4.72□□□□□ -1.65
UBASH3B-203ENST00000526386 SPAG11BQ08648 103 aa4.72□□□□□ -1.65
UBASH3B-203ENST00000526386 COX17Q14061 63 aa4.72□□□□□ -1.65
UBASH3B-203ENST00000526386 VAMP3Q15836 100 aa4.72□□□□□ -1.65
UBASH3B-203ENST00000526386 C2orf82Q6UX34 121 aa4.72□□□□□ -1.65
UBASH3B-203ENST00000526386 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa4.72□□□□□ -1.65
UBASH3B-203ENST00000526386 C15orf56Q8N910 161 aa4.72□□□□□ -1.65
UBASH3B-203ENST00000526386 MUC7Q8TAX7 377 aa4.72□□□□□ -1.65
UBASH3B-203ENST00000526386 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
UBASH3B-203ENST00000526386 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
UBASH3B-203ENST00000526386 A0A0U1RRA0 63 aa4.71□□□□□ -1.66
UBASH3B-203ENST00000526386 NUPR2A6NF83 97 aa4.71□□□□□ -1.66
UBASH3B-203ENST00000526386 F8WDY8 70 aa4.71□□□□□ -1.66
UBASH3B-203ENST00000526386 CKS1BP61024 79 aa4.71□□□□□ -1.66
UBASH3B-203ENST00000526386 C10orf25Q5T742 122 aa4.71□□□□□ -1.66
UBASH3B-203ENST00000526386 CFAP161Q6P656 301 aa4.71□□□□□ -1.66
UBASH3B-203ENST00000526386 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa4.71□□□□□ -1.66
UBASH3B-203ENST00000526386 C6orf223Q8N319 242 aa4.71□□□□□ -1.66
UBASH3B-203ENST00000526386 C2orf48Q96LS8 159 aa4.71□□□□□ -1.66
UBASH3B-203ENST00000526386 C1orf43Q9BWL3 253 aa4.71□□□□□ -1.66
UBASH3B-203ENST00000526386 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa4.71□□□□□ -1.66
UBASH3B-203ENST00000526386 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
UBASH3B-203ENST00000526386 ALMS1Q8TCU4 4167 aa4.71□□□□□ -1.66
UBASH3B-203ENST00000526386 K7EP34 96 aa4.7□□□□□ -1.66
UBASH3B-203ENST00000526386 FABP2P12104 132 aa4.7□□□□□ -1.66
UBASH3B-203ENST00000526386 LINC00158P58513 81 aa4.7□□□□□ -1.66
UBASH3B-203ENST00000526386 VPS13DQ5THJ4 4388 aa4.69□□□□□ -1.66
UBASH3B-203ENST00000526386 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa4.69□□□□□ -1.66
UBASH3B-203ENST00000526386 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa4.69□□□□□ -1.66
UBASH3B-203ENST00000526386 IGKV2D-28P01615 120 aa4.69□□□□□ -1.66
UBASH3B-203ENST00000526386 PFN2P35080 140 aa4.69□□□□□ -1.66
UBASH3B-203ENST00000526386 NPC2P61916 151 aa4.69□□□□□ -1.66
UBASH3B-203ENST00000526386 CASC10Q5T4H9 136 aa4.69□□□□□ -1.66
UBASH3B-203ENST00000526386 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa4.69□□□□□ -1.66
UBASH3B-203ENST00000526386 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
UBASH3B-203ENST00000526386 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa4.68□□□□□ -1.66
UBASH3B-203ENST00000526386 GAGE10A6NGK3 116 aa4.68□□□□□ -1.66
UBASH3B-203ENST00000526386 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
UBASH3B-203ENST00000526386 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa4.68□□□□□ -1.66
UBASH3B-203ENST00000526386 RMI2Q96E14 147 aa4.68□□□□□ -1.66
UBASH3B-203ENST00000526386 LINC00526Q96FQ7 95 aa4.68□□□□□ -1.66
UBASH3B-203ENST00000526386 Q9HAA7 133 aa4.68□□□□□ -1.66
UBASH3B-203ENST00000526386 C6orf48Q9UBA6 75 aa4.68□□□□□ -1.66
UBASH3B-203ENST00000526386 SPCS1Q9Y6A9 102 aa4.68□□□□□ -1.66
UBASH3B-203ENST00000526386 BIRC6Q9NR09 4857 aa4.68□□□□□ -1.66
UBASH3B-203ENST00000526386 LCE6AA0A183 80 aa4.67□□□□□ -1.66
UBASH3B-203ENST00000526386 NDUFC2O95298 119 aa4.67□□□□□ -1.66
UBASH3B-203ENST00000526386 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
UBASH3B-203ENST00000526386 RNF151Q2KHN1 245 aa4.67□□□□□ -1.66
UBASH3B-203ENST00000526386 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa4.67□□□□□ -1.66
UBASH3B-203ENST00000526386 DNAH6Q9C0G6 4158 aa4.67□□□□□ -1.66
UBASH3B-203ENST00000526386 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa4.66□□□□□ -1.66
UBASH3B-203ENST00000526386 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa4.66□□□□□ -1.66
UBASH3B-203ENST00000526386 TRIAP1O43715 76 aa4.66□□□□□ -1.66
UBASH3B-203ENST00000526386 HIGD2BQ4VC39 106 aa4.66□□□□□ -1.66
UBASH3B-203ENST00000526386 Q6ZRU5 148 aa4.66□□□□□ -1.66
UBASH3B-203ENST00000526386 LINC00337Q8N6G1 96 aa4.66□□□□□ -1.66
UBASH3B-203ENST00000526386 Q8NDZ9 215 aa4.66□□□□□ -1.66
UBASH3B-203ENST00000526386 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa4.65□□□□□ -1.67
UBASH3B-203ENST00000526386 USP17L23D6RBM5 183 aa4.65□□□□□ -1.67
UBASH3B-203ENST00000526386 SLPIP03973 132 aa4.65□□□□□ -1.67
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