RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515011.5

PDE4D-223, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,175 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-223ENST00000515011 Q6ZTC4 211 aa15.61■□□□□ 0.09
PDE4D-223ENST00000515011 DNAH3Q8TD57 4116 aa15.61■□□□□ 0.09
PDE4D-223ENST00000515011 COX7A2LO14548 114 aa15.6■□□□□ 0.09
PDE4D-223ENST00000515011 LINC00158P58513 81 aa15.59■□□□□ 0.09
PDE4D-223ENST00000515011 ATXN8Q156A1 80 aa15.59■□□□□ 0.09
PDE4D-223ENST00000515011 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
PDE4D-223ENST00000515011 CBY1Q9Y3M2 126 aa15.59■□□□□ 0.09
PDE4D-223ENST00000515011 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa15.58■□□□□ 0.08
PDE4D-223ENST00000515011 COX6CP09669 75 aa15.58■□□□□ 0.08
PDE4D-223ENST00000515011 A0A0J9YWU9 116 aa15.58■□□□□ 0.08
PDE4D-223ENST00000515011 PRR34Q9NV39 138 aa15.58■□□□□ 0.08
PDE4D-223ENST00000515011 VPS25Q9BRG1 176 aa15.57■□□□□ 0.08
PDE4D-223ENST00000515011 FOXI1Q12951 378 aa15.56■□□□□ 0.08
PDE4D-223ENST00000515011 KIAA0087Q14695 138 aa15.55■□□□□ 0.08
PDE4D-223ENST00000515011 LINC01620Q4KN68 170 aa15.55■□□□□ 0.08
PDE4D-223ENST00000515011 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa15.54■□□□□ 0.08
PDE4D-223ENST00000515011 C9JAW5 83 aa15.54■□□□□ 0.08
PDE4D-223ENST00000515011 M0QXV9 152 aa15.54■□□□□ 0.08
PDE4D-223ENST00000515011 PFN2P35080 140 aa15.54■□□□□ 0.08
PDE4D-223ENST00000515011 MDFIQ99750 246 aa15.54■□□□□ 0.08
PDE4D-223ENST00000515011 MALP21145 153 aa15.53■□□□□ 0.08
PDE4D-223ENST00000515011 CXCL5P42830 114 aa15.53■□□□□ 0.08
PDE4D-223ENST00000515011 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa15.53■□□□□ 0.08
PDE4D-223ENST00000515011 KLK12Q9UKR0 248 aa15.53■□□□□ 0.08
PDE4D-223ENST00000515011 SLC25A20O43772 301 aa15.53■□□□□ 0.08
PDE4D-223ENST00000515011 C2orf82Q6UX34 121 aa15.53■□□□□ 0.08
PDE4D-223ENST00000515011 CCL18P55774 89 aa15.52■□□□□ 0.08
PDE4D-223ENST00000515011 J3QR89 54 aa15.52■□□□□ 0.07
PDE4D-223ENST00000515011 CKS1BP61024 79 aa15.52■□□□□ 0.07
PDE4D-223ENST00000515011 C11orf45Q8TAV5 145 aa15.52■□□□□ 0.07
PDE4D-223ENST00000515011 ANK2Q01484 3957 aa15.51■□□□□ 0.07
PDE4D-223ENST00000515011 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
PDE4D-223ENST00000515011 CFAP161Q6P656 301 aa15.51■□□□□ 0.07
PDE4D-223ENST00000515011 ENHOQ6UWT2 76 aa15.51■□□□□ 0.07
PDE4D-223ENST00000515011 TEN1Q86WV5 123 aa15.51■□□□□ 0.07
PDE4D-223ENST00000515011 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa15.51■□□□□ 0.07
PDE4D-223ENST00000515011 GAGE12HA6NDE8 117 aa15.51■□□□□ 0.07
PDE4D-223ENST00000515011 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa15.49■□□□□ 0.07
PDE4D-223ENST00000515011 LST1O00453 97 aa15.49■□□□□ 0.07
PDE4D-223ENST00000515011 IGKV2D-28P01615 120 aa15.49■□□□□ 0.07
PDE4D-223ENST00000515011 CLEC2BQ92478 149 aa15.49■□□□□ 0.07
PDE4D-223ENST00000515011 LINC01600Q96MT4 127 aa15.49■□□□□ 0.07
PDE4D-223ENST00000515011 CRPP02741 224 aa15.49■□□□□ 0.07
PDE4D-223ENST00000515011 WFDC10BQ8IUB3 73 aa15.49■□□□□ 0.07
PDE4D-223ENST00000515011 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa15.48■□□□□ 0.07
PDE4D-223ENST00000515011 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
PDE4D-223ENST00000515011 LINC00337Q8N6G1 96 aa15.47■□□□□ 0.07
PDE4D-223ENST00000515011 SPATA25Q9BR10 227 aa15.47■□□□□ 0.07
PDE4D-223ENST00000515011 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa15.46■□□□□ 0.07
PDE4D-223ENST00000515011 ANKRD29Q8N6D5 301 aa15.46■□□□□ 0.07
PDE4D-223ENST00000515011 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
PDE4D-223ENST00000515011 COX17Q14061 63 aa15.45■□□□□ 0.06
PDE4D-223ENST00000515011 PPDPFLQ8WWR9 84 aa15.45■□□□□ 0.06
PDE4D-223ENST00000515011 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa15.45■□□□□ 0.06
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PDE4D-223ENST00000515011 UBE2WQ96B02 151 aa15.44■□□□□ 0.06
PDE4D-223ENST00000515011 K7EIL1 84 aa15.43■□□□□ 0.06
PDE4D-223ENST00000515011 SPAG11BQ08648 103 aa15.43■□□□□ 0.06
PDE4D-223ENST00000515011 CARD19Q96LW7 228 aa15.43■□□□□ 0.06
PDE4D-223ENST00000515011 TENM3Q9P273 2699 aa15.43■□□□□ 0.06
PDE4D-223ENST00000515011 RPL28P46779 137 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
PDE4D-223ENST00000515011 DNHD1Q96M86 4753 aa15.42■□□□□ 0.06
PDE4D-223ENST00000515011 H3BT86 120 aa15.4■□□□□ 0.06
PDE4D-223ENST00000515011 C6orf223Q8N319 242 aa15.38■□□□□ 0.05
PDE4D-223ENST00000515011 TRAV10A0A0B4J240 114 aa15.36■□□□□ 0.05
PDE4D-223ENST00000515011 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
PDE4D-223ENST00000515011 LINC01556Q5JQF7 62 aa15.36■□□□□ 0.05
PDE4D-223ENST00000515011 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa15.36■□□□□ 0.05
PDE4D-223ENST00000515011 C10orf25Q5T742 122 aa15.35■□□□□ 0.05
PDE4D-223ENST00000515011 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa15.35■□□□□ 0.05
PDE4D-223ENST00000515011 SMIM11BQ8TCY0 68 aa15.35■□□□□ 0.05
PDE4D-223ENST00000515011 NOTCH1P46531 2555 aa15.35■□□□□ 0.05
PDE4D-223ENST00000515011 DEFB121Q5J5C9 76 aa15.35■□□□□ 0.05
PDE4D-223ENST00000515011 MUC7Q8TAX7 377 aa15.35■□□□□ 0.05
PDE4D-223ENST00000515011 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
PDE4D-223ENST00000515011 NDUFC2O95298 119 aa15.34■□□□□ 0.05
PDE4D-223ENST00000515011 TRACP01848 142 aa15.34■□□□□ 0.05
PDE4D-223ENST00000515011 MRAPQ8TCY5 172 aa15.34■□□□□ 0.05
PDE4D-223ENST00000515011 LINC00526Q96FQ7 95 aa15.33■□□□□ 0.04
PDE4D-223ENST00000515011 C15orf53Q8NAA6 179 aa15.32■□□□□ 0.04
PDE4D-223ENST00000515011 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
PDE4D-223ENST00000515011 FAM218AQ96MZ4 157 aa15.32■□□□□ 0.04
PDE4D-223ENST00000515011 OR13C6PQ8NH95 151 aa15.31■□□□□ 0.04
PDE4D-223ENST00000515011 DNAH10OSP0CZ25 163 aa15.28■□□□□ 0.04
PDE4D-223ENST00000515011 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa15.27■□□□□ 0.04
PDE4D-223ENST00000515011 H0YGX0 51 aa15.26■□□□□ 0.03
PDE4D-223ENST00000515011 C1orf43Q9BWL3 253 aa15.26■□□□□ 0.03
PDE4D-223ENST00000515011 C6orf48Q9UBA6 75 aa15.26■□□□□ 0.03
PDE4D-223ENST00000515011 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
PDE4D-223ENST00000515011 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa15.25■□□□□ 0.03
PDE4D-223ENST00000515011 PRR3P79522 188 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
PDE4D-223ENST00000515011 C15orf56Q8N910 161 aa15.24■□□□□ 0.03
PDE4D-223ENST00000515011 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa15.24■□□□□ 0.03
PDE4D-223ENST00000515011 Q8NDZ9 215 aa15.24■□□□□ 0.03
PDE4D-223ENST00000515011 CDIP1Q9H305 208 aa15.23■□□□□ 0.03
PDE4D-223ENST00000515011 PCP4P48539 62 aa15.22■□□□□ 0.03
PDE4D-223ENST00000515011 HIGD2BQ4VC39 106 aa15.22■□□□□ 0.03
PDE4D-223ENST00000515011 TMEM126AQ9H061 195 aa15.22■□□□□ 0.03
PDE4D-223ENST00000515011 LINC00588Q9Y4M8 146 aa15.22■□□□□ 0.03
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