RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000239461.10

PRRX1-201, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRX1, Length 4,284 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-201ENST00000239461 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
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PRRX1-201ENST00000239461 C20orf197Q8N268 126 aa7.66□□□□□ -1.18
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PRRX1-201ENST00000239461 SERP1Q9Y6X1 66 aa7.52□□□□□ -1.2
PRRX1-201ENST00000239461 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
PRRX1-201ENST00000239461 Q9UF83 564 aa7.52□□□□□ -1.21
PRRX1-201ENST00000239461 CYSRT1A8MQ03 144 aa7.52□□□□□ -1.21
PRRX1-201ENST00000239461 HAMPP81172 84 aa7.52□□□□□ -1.21
PRRX1-201ENST00000239461 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa7.52□□□□□ -1.21
PRRX1-201ENST00000239461 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
PRRX1-201ENST00000239461 MIAQ16674 131 aa7.51□□□□□ -1.21
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