RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569223.1

EHD4-202, Transcript of EH domain containing 4, humanhuman

TSL 2

Gene EHD4, Length 2,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4-202ENST00000569223 DAND5Q8N907 189 aa16.32■□□□□ 0.2
EHD4-202ENST00000569223 SPATA3Q8NHX4 192 aa16.32■□□□□ 0.2
EHD4-202ENST00000569223 GAGE6Q13070 117 aa16.31■□□□□ 0.2
EHD4-202ENST00000569223 LINC00612Q8N6U2 182 aa16.31■□□□□ 0.2
EHD4-202ENST00000569223 DEFB130BP0DP73 79 aa16.31■□□□□ 0.2
EHD4-202ENST00000569223 DEFB130AP0DP74 79 aa16.31■□□□□ 0.2
EHD4-202ENST00000569223 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa16.3■□□□□ 0.2
EHD4-202ENST00000569223 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
EHD4-202ENST00000569223 C2CD3Q4AC94 2353 aa16.3■□□□□ 0.2
EHD4-202ENST00000569223 HECTD1Q9ULT8 2610 aa16.3■□□□□ 0.2
EHD4-202ENST00000569223 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa16.29■□□□□ 0.2
EHD4-202ENST00000569223 X6R8D5 127 aa16.29■□□□□ 0.2
EHD4-202ENST00000569223 C9orf66Q5T8R8 295 aa16.29■□□□□ 0.2
EHD4-202ENST00000569223 FOXI1Q12951 378 aa16.28■□□□□ 0.2
EHD4-202ENST00000569223 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
EHD4-202ENST00000569223 TRIAP1O43715 76 aa16.28■□□□□ 0.2
EHD4-202ENST00000569223 ICOSQ9Y6W8 199 aa16.26■□□□□ 0.19
EHD4-202ENST00000569223 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa16.26■□□□□ 0.19
EHD4-202ENST00000569223 LINC00308Q8TCZ7 52 aa16.26■□□□□ 0.19
EHD4-202ENST00000569223 CHCHD5Q9BSY4 110 aa16.26■□□□□ 0.19
EHD4-202ENST00000569223 SMIM9A6NGZ8 99 aa16.25■□□□□ 0.19
EHD4-202ENST00000569223 TEN1Q86WV5 123 aa16.25■□□□□ 0.19
EHD4-202ENST00000569223 PRIMA1Q86XR5 153 aa16.25■□□□□ 0.19
EHD4-202ENST00000569223 ATXN8Q156A1 80 aa16.24■□□□□ 0.19
EHD4-202ENST00000569223 GAGE12HA6NDE8 117 aa16.24■□□□□ 0.19
EHD4-202ENST00000569223 C9JAW5 83 aa16.24■□□□□ 0.19
EHD4-202ENST00000569223 OTOGQ6ZRI0 2925 aa16.23■□□□□ 0.19
EHD4-202ENST00000569223 A0A0U1RRA0 63 aa16.23■□□□□ 0.19
EHD4-202ENST00000569223 SLC25A20O43772 301 aa16.23■□□□□ 0.19
EHD4-202ENST00000569223 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa16.22■□□□□ 0.19
EHD4-202ENST00000569223 GYPEP15421 78 aa16.22■□□□□ 0.19
EHD4-202ENST00000569223 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
EHD4-202ENST00000569223 HERV-K104P63124 156 aa16.22■□□□□ 0.19
EHD4-202ENST00000569223 PPDPFLQ8WWR9 84 aa16.22■□□□□ 0.19
EHD4-202ENST00000569223 CARD19Q96LW7 228 aa16.22■□□□□ 0.19
EHD4-202ENST00000569223 SPATA25Q9BR10 227 aa16.22■□□□□ 0.19
EHD4-202ENST00000569223 FN1P02751 2386 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
EHD4-202ENST00000569223 MEIG1Q5JSS6 88 aa16.21■□□□□ 0.19
EHD4-202ENST00000569223 ANKRD29Q8N6D5 301 aa16.21■□□□□ 0.19
EHD4-202ENST00000569223 M0QXV9 152 aa16.21■□□□□ 0.18
EHD4-202ENST00000569223 LINC01620Q4KN68 170 aa16.2■□□□□ 0.18
EHD4-202ENST00000569223 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa16.2■□□□□ 0.18
EHD4-202ENST00000569223 COPS9Q8WXC6 57 aa16.19■□□□□ 0.18
EHD4-202ENST00000569223 FAM222AQ5U5X8 452 aa16.18■□□□□ 0.18
EHD4-202ENST00000569223 COX7B2Q8TF08 81 aa16.18■□□□□ 0.18
EHD4-202ENST00000569223 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
EHD4-202ENST00000569223 COX6CP09669 75 aa16.17■□□□□ 0.18
EHD4-202ENST00000569223 NOTCH2Q04721 2471 aa16.17■□□□□ 0.18
EHD4-202ENST00000569223 SIGMAR1Q99720 223 aa16.16■□□□□ 0.18
EHD4-202ENST00000569223 PRO0255Q9UI72 69 aa16.16■□□□□ 0.18
EHD4-202ENST00000569223 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa16.16■□□□□ 0.18
EHD4-202ENST00000569223 LYRM9A8MSI8 78 aa16.16■□□□□ 0.18
EHD4-202ENST00000569223 DEFB135Q30KP9 77 aa16.16■□□□□ 0.18
EHD4-202ENST00000569223 CITED1Q99966 193 aa16.16■□□□□ 0.18
EHD4-202ENST00000569223 VWFP04275 2813 aa16.14■□□□□ 0.17
EHD4-202ENST00000569223 APOC4P55056 127 aa16.13■□□□□ 0.17
EHD4-202ENST00000569223 LINC01600Q96MT4 127 aa16.13■□□□□ 0.17
EHD4-202ENST00000569223 CLEC2BQ92478 149 aa16.12■□□□□ 0.17
EHD4-202ENST00000569223 TOMM7Q9P0U1 55 aa16.12■□□□□ 0.17
EHD4-202ENST00000569223 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa16.12■□□□□ 0.17
EHD4-202ENST00000569223 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa16.12■□□□□ 0.17
EHD4-202ENST00000569223 PPDPFQ9H3Y8 114 aa16.12■□□□□ 0.17
EHD4-202ENST00000569223 A0A087WZ39 114 aa16.11■□□□□ 0.17
EHD4-202ENST00000569223 DEFB4AO15263 64 aa16.11■□□□□ 0.17
EHD4-202ENST00000569223 PAX4O43316 350 aa16.11■□□□□ 0.17
EHD4-202ENST00000569223 A0A096LPF7 62 aa16.1■□□□□ 0.17
EHD4-202ENST00000569223 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa16.1■□□□□ 0.17
EHD4-202ENST00000569223 A0A1B0GUV1 79 aa16.09■□□□□ 0.17
EHD4-202ENST00000569223 TMEM262E9PQX1 116 aa16.09■□□□□ 0.17
EHD4-202ENST00000569223 LST1O00453 97 aa16.09■□□□□ 0.17
EHD4-202ENST00000569223 C5orf38Q86SI9 138 aa16.09■□□□□ 0.17
EHD4-202ENST00000569223 CDIP1Q9H305 208 aa16.09■□□□□ 0.17
EHD4-202ENST00000569223 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
EHD4-202ENST00000569223 TENM1Q9UKZ4 2725 aa16.06■□□□□ 0.16
EHD4-202ENST00000569223 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa16.06■□□□□ 0.16
EHD4-202ENST00000569223 DAD1P61803 113 aa16.05■□□□□ 0.16
EHD4-202ENST00000569223 SHISA2Q6UWI4 295 aa16.05■□□□□ 0.16
EHD4-202ENST00000569223 SS18Q15532 418 aa16.04■□□□□ 0.16
EHD4-202ENST00000569223 C2orf82Q6UX34 121 aa16.04■□□□□ 0.16
EHD4-202ENST00000569223 Q8NAQ8 132 aa16.04■□□□□ 0.16
EHD4-202ENST00000569223 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa16.04■□□□□ 0.16
EHD4-202ENST00000569223 HIVEP1P15822 2718 aa16.03■□□□□ 0.16
EHD4-202ENST00000569223 WFDC9Q8NEX5 89 aa16.03■□□□□ 0.16
EHD4-202ENST00000569223 CELA1Q9UNI1 258 aa16.03■□□□□ 0.16
EHD4-202ENST00000569223 H3BT86 120 aa16.02■□□□□ 0.16
EHD4-202ENST00000569223 SCGB1A1P11684 91 aa16.02■□□□□ 0.16
EHD4-202ENST00000569223 XCL1P47992 114 aa16.02■□□□□ 0.16
EHD4-202ENST00000569223 COX7A2LO14548 114 aa16.02■□□□□ 0.15
EHD4-202ENST00000569223 MIFP14174 115 aa16.02■□□□□ 0.15
EHD4-202ENST00000569223 LINC00158P58513 81 aa16.02■□□□□ 0.15
EHD4-202ENST00000569223 CLPSL2Q6UWE3 100 aa16.02■□□□□ 0.15
EHD4-202ENST00000569223 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa16.01■□□□□ 0.15
EHD4-202ENST00000569223 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa15.99■□□□□ 0.15
EHD4-202ENST00000569223 WIPF1O43516 503 aa15.99■□□□□ 0.15
EHD4-202ENST00000569223 UBE2WQ96B02 151 aa15.99■□□□□ 0.15
EHD4-202ENST00000569223 ATP5G1P05496 136 aa15.99■□□□□ 0.15
EHD4-202ENST00000569223 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa15.98■□□□□ 0.15
EHD4-202ENST00000569223 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa15.97■□□□□ 0.15
EHD4-202ENST00000569223 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa15.97■□□□□ 0.15
EHD4-202ENST00000569223 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.5 ms