RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557657.5

TMEM260-216, Transcript of transmembrane protein 260, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TMEM260, Length 2,572 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260-216ENST00000557657 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa14.97□□□□□ -0.01
TMEM260-216ENST00000557657 SLC25A20O43772 301 aa14.96□□□□□ -0.01
TMEM260-216ENST00000557657 TEN1Q86WV5 123 aa14.96□□□□□ -0.01
TMEM260-216ENST00000557657 SIGMAR1Q99720 223 aa14.96□□□□□ -0.01
TMEM260-216ENST00000557657 UBE2L6O14933 153 aa14.96□□□□□ -0.01
TMEM260-216ENST00000557657 SPATA25Q9BR10 227 aa14.96□□□□□ -0.01
TMEM260-216ENST00000557657 TMEM243Q9BU79 118 aa14.96□□□□□ -0.01
TMEM260-216ENST00000557657 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
TMEM260-216ENST00000557657 F5H768 121 aa14.94□□□□□ -0.02
TMEM260-216ENST00000557657 FHL2Q14192 279 aa14.94□□□□□ -0.02
TMEM260-216ENST00000557657 CLEC2BQ92478 149 aa14.94□□□□□ -0.02
TMEM260-216ENST00000557657 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa14.94□□□□□ -0.02
TMEM260-216ENST00000557657 PF4P02776 101 aa14.94□□□□□ -0.02
TMEM260-216ENST00000557657 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa14.94□□□□□ -0.02
TMEM260-216ENST00000557657 ICOSQ9Y6W8 199 aa14.94□□□□□ -0.02
TMEM260-216ENST00000557657 ATRQ13535 2644 aa14.94□□□□□ -0.02
TMEM260-216ENST00000557657 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa14.93□□□□□ -0.02
TMEM260-216ENST00000557657 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
TMEM260-216ENST00000557657 CRLF1O75462 422 aa14.93□□□□□ -0.02
TMEM260-216ENST00000557657 OVOL2Q9BRP0 275 aa14.93□□□□□ -0.02
TMEM260-216ENST00000557657 CDIP1Q9H305 208 aa14.93□□□□□ -0.02
TMEM260-216ENST00000557657 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TMEM260-216ENST00000557657 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TMEM260-216ENST00000557657 LY6G6DO95868 133 aa14.92□□□□□ -0.02
TMEM260-216ENST00000557657 PRIMA1Q86XR5 153 aa14.91□□□□□ -0.02
TMEM260-216ENST00000557657 LINC00482Q8N8I6 264 aa14.91□□□□□ -0.02
TMEM260-216ENST00000557657 LINC00308Q8TCZ7 52 aa14.91□□□□□ -0.02
TMEM260-216ENST00000557657 PPDPFLQ8WWR9 84 aa14.91□□□□□ -0.02
TMEM260-216ENST00000557657 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa14.91□□□□□ -0.02
TMEM260-216ENST00000557657 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa14.91□□□□□ -0.02
TMEM260-216ENST00000557657 LINC01620Q4KN68 170 aa14.91□□□□□ -0.02
TMEM260-216ENST00000557657 FAM110AQ9BQ89 295 aa14.91□□□□□ -0.02
TMEM260-216ENST00000557657 MEIG1Q5JSS6 88 aa14.89□□□□□ -0.03
TMEM260-216ENST00000557657 ATXN8Q156A1 80 aa14.89□□□□□ -0.03
TMEM260-216ENST00000557657 A0A096LPF7 62 aa14.88□□□□□ -0.03
TMEM260-216ENST00000557657 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa14.88□□□□□ -0.03
TMEM260-216ENST00000557657 CHCHD5Q9BSY4 110 aa14.88□□□□□ -0.03
TMEM260-216ENST00000557657 DEFB4AO15263 64 aa14.88□□□□□ -0.03
TMEM260-216ENST00000557657 TIMM17BO60830 172 aa14.88□□□□□ -0.03
TMEM260-216ENST00000557657 HIVEP1P15822 2718 aa14.88□□□□□ -0.03
TMEM260-216ENST00000557657 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
TMEM260-216ENST00000557657 TOMM7Q9P0U1 55 aa14.87□□□□□ -0.03
TMEM260-216ENST00000557657 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
TMEM260-216ENST00000557657 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa14.86□□□□□ -0.03
TMEM260-216ENST00000557657 INAFM1C9JVW0 142 aa14.85□□□□□ -0.03
TMEM260-216ENST00000557657 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa14.85□□□□□ -0.03
TMEM260-216ENST00000557657 MT-ATP8P03928 68 aa14.84□□□□□ -0.03
TMEM260-216ENST00000557657 IFITM1P13164 125 aa14.84□□□□□ -0.03
TMEM260-216ENST00000557657 XGP55808 180 aa14.84□□□□□ -0.03
TMEM260-216ENST00000557657 X6R8D5 127 aa14.82□□□□□ -0.04
TMEM260-216ENST00000557657 H7C423 109 aa14.82□□□□□ -0.04
TMEM260-216ENST00000557657 GYPEP15421 78 aa14.82□□□□□ -0.04
TMEM260-216ENST00000557657 C5orf38Q86SI9 138 aa14.82□□□□□ -0.04
TMEM260-216ENST00000557657 CLPSL2Q6UWE3 100 aa14.81□□□□□ -0.04
TMEM260-216ENST00000557657 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
TMEM260-216ENST00000557657 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa14.8□□□□□ -0.04
TMEM260-216ENST00000557657 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
TMEM260-216ENST00000557657 COX6CP09669 75 aa14.79□□□□□ -0.04
TMEM260-216ENST00000557657 C2orf82Q6UX34 121 aa14.79□□□□□ -0.04
TMEM260-216ENST00000557657 RNF183Q96D59 192 aa14.79□□□□□ -0.04
TMEM260-216ENST00000557657 DEFB135Q30KP9 77 aa14.78□□□□□ -0.04
TMEM260-216ENST00000557657 COX7B2Q8TF08 81 aa14.78□□□□□ -0.04
TMEM260-216ENST00000557657 TMEM262E9PQX1 116 aa14.78□□□□□ -0.04
TMEM260-216ENST00000557657 LST1O00453 97 aa14.77□□□□□ -0.04
TMEM260-216ENST00000557657 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa14.77□□□□□ -0.05
TMEM260-216ENST00000557657 FAM222AQ5U5X8 452 aa14.77□□□□□ -0.05
TMEM260-216ENST00000557657 Q8N3U1 123 aa14.77□□□□□ -0.05
TMEM260-216ENST00000557657 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa14.76□□□□□ -0.05
TMEM260-216ENST00000557657 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa14.75□□□□□ -0.05
TMEM260-216ENST00000557657 XCL1P47992 114 aa14.74□□□□□ -0.05
TMEM260-216ENST00000557657 CIDEAO60543 219 aa14.74□□□□□ -0.05
TMEM260-216ENST00000557657 LINC00612Q8N6U2 182 aa14.73□□□□□ -0.05
TMEM260-216ENST00000557657 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa14.73□□□□□ -0.05
TMEM260-216ENST00000557657 PFN2P35080 140 aa14.73□□□□□ -0.05
TMEM260-216ENST00000557657 HERV-K104P63124 156 aa14.73□□□□□ -0.05
TMEM260-216ENST00000557657 M0QXV9 152 aa14.72□□□□□ -0.05
TMEM260-216ENST00000557657 LINC00158P58513 81 aa14.71□□□□□ -0.05
TMEM260-216ENST00000557657 UBE2WQ96B02 151 aa14.71□□□□□ -0.06
TMEM260-216ENST00000557657 SHISA2Q6UWI4 295 aa14.7□□□□□ -0.06
TMEM260-216ENST00000557657 LINC00337Q8N6G1 96 aa14.7□□□□□ -0.06
TMEM260-216ENST00000557657 FAM218AQ96MZ4 157 aa14.7□□□□□ -0.06
TMEM260-216ENST00000557657 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa14.69□□□□□ -0.06
TMEM260-216ENST00000557657 A0A087WZ39 114 aa14.69□□□□□ -0.06
TMEM260-216ENST00000557657 IGKV2D-28P01615 120 aa14.69□□□□□ -0.06
TMEM260-216ENST00000557657 SCGB1A1P11684 91 aa14.69□□□□□ -0.06
TMEM260-216ENST00000557657 PRO0255Q9UI72 69 aa14.68□□□□□ -0.06
TMEM260-216ENST00000557657 CELA1Q9UNI1 258 aa14.68□□□□□ -0.06
TMEM260-216ENST00000557657 PAX4O43316 350 aa14.67□□□□□ -0.06
TMEM260-216ENST00000557657 COX7A2LO14548 114 aa14.67□□□□□ -0.06
TMEM260-216ENST00000557657 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa14.66□□□□□ -0.06
TMEM260-216ENST00000557657 C9orf66Q5T8R8 295 aa14.66□□□□□ -0.06
TMEM260-216ENST00000557657 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa14.66□□□□□ -0.06
TMEM260-216ENST00000557657 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa14.66□□□□□ -0.06
TMEM260-216ENST00000557657 CCL18P55774 89 aa14.65□□□□□ -0.06
TMEM260-216ENST00000557657 H3BT86 120 aa14.65□□□□□ -0.06
TMEM260-216ENST00000557657 LINC01600Q96MT4 127 aa14.65□□□□□ -0.06
TMEM260-216ENST00000557657 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa14.64□□□□□ -0.07
TMEM260-216ENST00000557657 LINC00269Q8N2A0 174 aa14.63□□□□□ -0.07
TMEM260-216ENST00000557657 HTN3P15516 51 aa14.63□□□□□ -0.07
TMEM260-216ENST00000557657 C6orf226Q5I0X4 101 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms