RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP12.16□□□□□ -0.46
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa12.15□□□□□ -0.46
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MGAM2Q2M2H8 2515 aa12.15□□□□□ -0.46
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa12.15□□□□□ -0.46
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PTPRBP23467 1997 aa12.15□□□□□ -0.46
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SMR3AQ99954 134 aa12.14□□□□□ -0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LYRM9A8MSI8 78 aa12.14□□□□□ -0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa12.14□□□□□ -0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa12.14□□□□□ -0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NDUFA7O95182 113 aa12.14□□□□□ -0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SMIM9A6NGZ8 99 aa12.13□□□□□ -0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LY6G6DO95868 133 aa12.13□□□□□ -0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 UFSP1Q6NVU6 142 aa12.13□□□□□ -0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 A0A096LNI7 61 aa12.12□□□□□ -0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 COX7BP24311 80 aa12.12□□□□□ -0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ODF3L2Q3SX64 289 aa12.12□□□□□ -0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HIGD2AQ9BW72 106 aa12.12□□□□□ -0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SPATA25Q9BR10 227 aa12.12□□□□□ -0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 UBE2AP49459 152 aa12.12□□□□□ -0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa12.12□□□□□ -0.47
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C6orf99Q4VX62 202 aa12.11□□□□□ -0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MAST4O15021 2626 aa12.11□□□□□ -0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa12.11□□□□□ -0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa12.11□□□□□ -0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 POM121L12Q8N7R1 296 aa12.11□□□□□ -0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGIPA6NJ69 53 aa12.1□□□□□ -0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PDE6GP18545 87 aa12.1□□□□□ -0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SDIM1Q6ZPB5 146 aa12.1□□□□□ -0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C20orf197Q8N268 126 aa12.1□□□□□ -0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 A0A096LNJ9 63 aa12.08□□□□□ -0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa12.08□□□□□ -0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SPTSSBQ8NFR3 76 aa12.08□□□□□ -0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa12.08□□□□□ -0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SCXQ7RTU7 201 aa12.07□□□□□ -0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MIFP14174 115 aa12.06□□□□□ -0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HILS1P60008 231 aa12.06□□□□□ -0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa12.05□□□□□ -0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OXLD1Q5BKU9 147 aa12.05□□□□□ -0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 H7C423 109 aa12.05□□□□□ -0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 UBE2D1P51668 147 aa12.05□□□□□ -0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF580Q9UK33 172 aa12.04□□□□□ -0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa12.04□□□□□ -0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 UPK3BQ9BT76 320 aa12.04□□□□□ -0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa12.04□□□□□ -0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM236CP0DP71 79 aa12.04□□□□□ -0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PLA2G2AP14555 144 aa12.03□□□□□ -0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LINC00242Q5T6M2 205 aa12.03□□□□□ -0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MPLKIPQ8TAP9 179 aa12.02□□□□□ -0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CLUHP3Q96NS8 147 aa12.02□□□□□ -0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa12.02□□□□□ -0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa12.02□□□□□ -0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 UBE2D3P61077 147 aa12.01□□□□□ -0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 UBE2D2P62837 147 aa12.01□□□□□ -0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa12.01□□□□□ -0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGKV2D-28P01615 120 aa12.01□□□□□ -0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP12.01□□□□□ -0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TSPEAR-AS2P59090 65 aa12.01□□□□□ -0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CD164L2Q6UWJ8 174 aa12.01□□□□□ -0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PKIGQ9Y2B9 76 aa12.01□□□□□ -0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BPY2O14599 106 aa12□□□□□ -0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LINC00694P0DN24 101 aa12□□□□□ -0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 Q6ZQY7 126 aa12□□□□□ -0.49
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C3orf22Q8N5N4 141 aa12□□□□□ -0.49
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SYCNQ0VAF6 134 aa11.99□□□□□ -0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa11.99□□□□□ -0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C1orf158Q8N1D5 194 aa11.99□□□□□ -0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LST1O00453 97 aa11.98□□□□□ -0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SMIM11BQ8TCY0 68 aa11.98□□□□□ -0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ENHOQ6UWT2 76 aa11.98□□□□□ -0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 H0Y9J4 135 aa11.97□□□□□ -0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TIMM17BO60830 172 aa11.97□□□□□ -0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 UNC80Q8N2C7 3258 aa11.97□□□□□ -0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 COX8CQ7Z4L0 72 aa11.97□□□□□ -0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 V9GYY9 64 aa11.97□□□□□ -0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa11.96□□□□□ -0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa11.96□□□□□ -0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SEC61GP60059 68 aa11.96□□□□□ -0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa11.96□□□□□ -0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 XGP55808 180 aa11.96□□□□□ -0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa11.96□□□□□ -0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa11.95□□□□□ -0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 Q6ZSN1 163 aa11.95□□□□□ -0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa11.95□□□□□ -0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 A0A087WZ39 114 aa11.95□□□□□ -0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 COX6A2Q02221 97 aa11.95□□□□□ -0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SHISA2Q6UWI4 295 aa11.94□□□□□ -0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 WDFY4Q6ZS81 3184 aa11.94□□□□□ -0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SMIM1B2RUZ4 78 aa11.94□□□□□ -0.5
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