RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477144.1

HOXB-AS3-209, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXB-AS3, Length 743 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SFTA2Q6UW10 78 aa9.53□□□□□ -0.88
HOXB-AS3-209ENST00000477144 C2orf91Q6ZV80 131 aa9.53□□□□□ -0.88
HOXB-AS3-209ENST00000477144 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa9.52□□□□□ -0.89
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MPV17L2Q567V2 206 aa9.52□□□□□ -0.89
HOXB-AS3-209ENST00000477144 LYPD5Q6UWN5 251 aa9.52□□□□□ -0.89
HOXB-AS3-209ENST00000477144 HIST1H4GQ99525 98 aa9.52□□□□□ -0.89
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa9.52□□□□□ -0.89
HOXB-AS3-209ENST00000477144 DNAH7Q8WXX0 4024 aa9.52□□□□□ -0.89
HOXB-AS3-209ENST00000477144 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa9.51□□□□□ -0.89
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa9.51□□□□□ -0.89
HOXB-AS3-209ENST00000477144 A6NJY4 79 aa9.51□□□□□ -0.89
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TMEM238C9JI98 176 aa9.51□□□□□ -0.89
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ANGP03950 147 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
HOXB-AS3-209ENST00000477144 GCSHP23434 173 aa9.51□□□□□ -0.89
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP9.51□□□□□ -0.89
HOXB-AS3-209ENST00000477144 LINC01561Q8N1V8 128 aa9.51□□□□□ -0.89
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MUC7Q8TAX7 377 aa9.51□□□□□ -0.89
HOXB-AS3-209ENST00000477144 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa9.5□□□□□ -0.89
HOXB-AS3-209ENST00000477144 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa9.5□□□□□ -0.89
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SPINK8P0C7L1 97 aa9.5□□□□□ -0.89
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PTTG1IPP53801 180 aa9.5□□□□□ -0.89
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
HOXB-AS3-209ENST00000477144 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa9.5□□□□□ -0.89
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CASC10Q5T4H9 136 aa9.5□□□□□ -0.89
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa9.5□□□□□ -0.89
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ORAOV1Q8WV07 137 aa9.5□□□□□ -0.89
HOXB-AS3-209ENST00000477144 COPS9Q8WXC6 57 aa9.5□□□□□ -0.89
HOXB-AS3-209ENST00000477144 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
HOXB-AS3-209ENST00000477144 EREGO14944 169 aa9.49□□□□□ -0.89
HOXB-AS3-209ENST00000477144 NDUFA12Q9UI09 145 aa9.49□□□□□ -0.89
HOXB-AS3-209ENST00000477144 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa9.48□□□□□ -0.89
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CRPP02741 224 aa9.48□□□□□ -0.89
HOXB-AS3-209ENST00000477144 HERV-K104P63124 156 aa9.48□□□□□ -0.89
HOXB-AS3-209ENST00000477144 REG3AQ06141 175 aa9.48□□□□□ -0.89
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ZFAND6Q6FIF0 208 aa9.48□□□□□ -0.89
HOXB-AS3-209ENST00000477144 Q6ZVH6 145 aa9.48□□□□□ -0.89
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TTTY13Q9BZ97 58 aa9.48□□□□□ -0.89
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
HOXB-AS3-209ENST00000477144 A0A087WZ39 114 aa9.47□□□□□ -0.89
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa9.47□□□□□ -0.89
HOXB-AS3-209ENST00000477144 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa9.47□□□□□ -0.89
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CCL18P55774 89 aa9.47□□□□□ -0.89
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CEND1Q8N111 149 aa9.47□□□□□ -0.89
HOXB-AS3-209ENST00000477144 LINC00269Q8N2A0 174 aa9.47□□□□□ -0.89
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SACSQ9NZJ4 4579 aa9.47□□□□□ -0.89
HOXB-AS3-209ENST00000477144 NDUFA1O15239 70 aa9.46□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-209ENST00000477144 COX6A2Q02221 97 aa9.46□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CD164L2Q6UWJ8 174 aa9.46□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TM2D2Q9BX73 214 aa9.46□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-209ENST00000477144 STAB2Q8WWQ8 2551 aa9.45□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa9.45□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-209ENST00000477144 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa9.45□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SMIM1B2RUZ4 78 aa9.45□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TIMM17BO60830 172 aa9.45□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-209ENST00000477144 APOMO95445 188 aa9.45□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PRSS2P07478 247 aa9.45□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TP73-AS1Q9UF72 201 aa9.45□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-209ENST00000477144 COX7A2LO14548 114 aa9.44□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MALP21145 153 aa9.44□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-209ENST00000477144 XCL1P47992 114 aa9.44□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TSPEAR-AS2P59090 65 aa9.44□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-209ENST00000477144 RYR2Q92736 4967 aa9.44□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-209ENST00000477144 A0A0J9YXY3 114 aa9.43□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SMIM13P0DJ93 91 aa9.43□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-209ENST00000477144 RPL24P83731 157 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MIAQ16674 131 aa9.43□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-209ENST00000477144 COX7B2Q8TF08 81 aa9.43□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ESRGQ1W209 222 aa9.42□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-209ENST00000477144 LINC01556Q5JQF7 62 aa9.42□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PRR34Q9NV39 138 aa9.42□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-209ENST00000477144 KLK12Q9UKR0 248 aa9.42□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-209ENST00000477144 IGLL5B9A064 214 aa9.41□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-209ENST00000477144 IFITM1P13164 125 aa9.41□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CXCL5P42830 114 aa9.41□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-209ENST00000477144 C6orf226Q5I0X4 101 aa9.41□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CFAP161Q6P656 301 aa9.41□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-209ENST00000477144 Q9H8V8 135 aa9.41□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-209ENST00000477144 K7EP13 123 aa9.4□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-209ENST00000477144 IGHV3-30P01768 117 aa9.4□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-209ENST00000477144 IGHV3-33P01772 117 aa9.4□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-209ENST00000477144 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa9.4□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CLPSL2Q6UWE3 100 aa9.4□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-209ENST00000477144 C5orf38Q86SI9 138 aa9.4□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-209ENST00000477144 Q8IZM0 81 aa9.4□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-209ENST00000477144 C10orf126Q8N4M7 172 aa9.4□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-209ENST00000477144 LYSTQ99698 3801 aa9.4□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TOMM7Q9P0U1 55 aa9.4□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-209ENST00000477144 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-209ENST00000477144 STARD9Q9P2P6 4700 aa9.4□□□□□ -0.91
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MEIG1Q5JSS6 88 aa9.39□□□□□ -0.91
HOXB-AS3-209ENST00000477144 UBE2WQ96B02 151 aa9.39□□□□□ -0.91
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SPANXDQ9BXN6 97 aa9.39□□□□□ -0.91
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SPANXCQ9NY87 97 aa9.39□□□□□ -0.91
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TENM2Q9NT68 2774 aa9.39□□□□□ -0.91
HOXB-AS3-209ENST00000477144 LCE6AA0A183 80 aa9.38□□□□□ -0.91
HOXB-AS3-209ENST00000477144 NUPR2A6NF83 97 aa9.38□□□□□ -0.91
HOXB-AS3-209ENST00000477144 DNAH10OSP0CZ25 163 aa9.38□□□□□ -0.91
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CKS1BP61024 79 aa9.38□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms