RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466636.1

SRPRB-202, Transcript of SRP receptor subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene SRPRB, Length 917 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRB-202ENST00000466636 MGAM2Q2M2H8 2515 aa6.55□□□□□ -1.36
SRPRB-202ENST00000466636 TMEM262E9PQX1 116 aa6.54□□□□□ -1.36
SRPRB-202ENST00000466636 LEPROTO15243 131 aa6.54□□□□□ -1.36
SRPRB-202ENST00000466636 SIVA1O15304 175 aa6.54□□□□□ -1.36
SRPRB-202ENST00000466636 HERVK_113P63121 156 aa6.54□□□□□ -1.36
SRPRB-202ENST00000466636 SEC11AP67812 179 aa6.54□□□□□ -1.36
SRPRB-202ENST00000466636 COX6A2Q02221 97 aa6.54□□□□□ -1.36
SRPRB-202ENST00000466636 LINC00469Q8N7U9 141 aa6.54□□□□□ -1.36
SRPRB-202ENST00000466636 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
SRPRB-202ENST00000466636 NOTCH1P46531 2555 aa6.54□□□□□ -1.36
SRPRB-202ENST00000466636 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa6.53□□□□□ -1.36
SRPRB-202ENST00000466636 PLEKHB2Q96CS7 222 aa6.53□□□□□ -1.36
SRPRB-202ENST00000466636 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa6.53□□□□□ -1.36
SRPRB-202ENST00000466636 SNHG12Q9BXW3 62 aa6.53□□□□□ -1.36
SRPRB-202ENST00000466636 HIGD1BQ9P298 99 aa6.53□□□□□ -1.36
SRPRB-202ENST00000466636 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa6.53□□□□□ -1.36
SRPRB-202ENST00000466636 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa6.52□□□□□ -1.37
SRPRB-202ENST00000466636 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa6.52□□□□□ -1.37
SRPRB-202ENST00000466636 J3QQQ9 107 aa6.52□□□□□ -1.37
SRPRB-202ENST00000466636 M0R143 59 aa6.52□□□□□ -1.37
SRPRB-202ENST00000466636 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SRPRB-202ENST00000466636 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa6.51□□□□□ -1.37
SRPRB-202ENST00000466636 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa6.51□□□□□ -1.37
SRPRB-202ENST00000466636 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa6.51□□□□□ -1.37
SRPRB-202ENST00000466636 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa6.51□□□□□ -1.37
SRPRB-202ENST00000466636 ZNF815PA8K554 130 aa6.51□□□□□ -1.37
SRPRB-202ENST00000466636 H3BRM9 83 aa6.51□□□□□ -1.37
SRPRB-202ENST00000466636 SPINK8P0C7L1 97 aa6.51□□□□□ -1.37
SRPRB-202ENST00000466636 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa6.51□□□□□ -1.37
SRPRB-202ENST00000466636 ESRGQ1W209 222 aa6.51□□□□□ -1.37
SRPRB-202ENST00000466636 C15orf53Q8NAA6 179 aa6.51□□□□□ -1.37
SRPRB-202ENST00000466636 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa6.51□□□□□ -1.37
SRPRB-202ENST00000466636 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.51□□□□□ -1.37
SRPRB-202ENST00000466636 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SRPRB-202ENST00000466636 SMIM1B2RUZ4 78 aa6.5□□□□□ -1.37
SRPRB-202ENST00000466636 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SRPRB-202ENST00000466636 WFDC10BQ8IUB3 73 aa6.5□□□□□ -1.37
SRPRB-202ENST00000466636 TENM3Q9P273 2699 aa6.5□□□□□ -1.37
SRPRB-202ENST00000466636 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa6.49□□□□□ -1.37
SRPRB-202ENST00000466636 CCL25O15444 150 aa6.49□□□□□ -1.37
SRPRB-202ENST00000466636 ANGP03950 147 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SRPRB-202ENST00000466636 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SRPRB-202ENST00000466636 REG3AQ06141 175 aa6.49□□□□□ -1.37
SRPRB-202ENST00000466636 HSD52Q0P140 79 aa6.49□□□□□ -1.37
SRPRB-202ENST00000466636 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa6.49□□□□□ -1.37
SRPRB-202ENST00000466636 CLPSL2Q6UWE3 100 aa6.49□□□□□ -1.37
SRPRB-202ENST00000466636 LINC00269Q8N2A0 174 aa6.49□□□□□ -1.37
SRPRB-202ENST00000466636 SS18Q15532 418 aa6.48□□□□□ -1.37
SRPRB-202ENST00000466636 BATFQ16520 125 aa6.48□□□□□ -1.37
SRPRB-202ENST00000466636 ZFAND6Q6FIF0 208 aa6.48□□□□□ -1.37
SRPRB-202ENST00000466636 PRR34Q9NV39 138 aa6.48□□□□□ -1.37
SRPRB-202ENST00000466636 A0A087WZ39 114 aa6.47□□□□□ -1.37
SRPRB-202ENST00000466636 IGHV3-30P01768 117 aa6.47□□□□□ -1.37
SRPRB-202ENST00000466636 IGHV3-33P01772 117 aa6.47□□□□□ -1.37
SRPRB-202ENST00000466636 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa6.47□□□□□ -1.37
SRPRB-202ENST00000466636 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
SRPRB-202ENST00000466636 C10orf126Q8N4M7 172 aa6.47□□□□□ -1.37
SRPRB-202ENST00000466636 KLK12Q9UKR0 248 aa6.47□□□□□ -1.37
SRPRB-202ENST00000466636 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.46□□□□□ -1.38
SRPRB-202ENST00000466636 IGLL5B9A064 214 aa6.46□□□□□ -1.38
SRPRB-202ENST00000466636 NDUFA1O15239 70 aa6.46□□□□□ -1.38
SRPRB-202ENST00000466636 XCL1P47992 114 aa6.46□□□□□ -1.38
SRPRB-202ENST00000466636 TAL2Q16559 108 aa6.46□□□□□ -1.38
SRPRB-202ENST00000466636 LINC01556Q5JQF7 62 aa6.46□□□□□ -1.38
SRPRB-202ENST00000466636 ENHOQ6UWT2 76 aa6.46□□□□□ -1.38
SRPRB-202ENST00000466636 LINC01561Q8N1V8 128 aa6.46□□□□□ -1.38
SRPRB-202ENST00000466636 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
SRPRB-202ENST00000466636 NDUFA12Q9UI09 145 aa6.46□□□□□ -1.38
SRPRB-202ENST00000466636 LINC00588Q9Y4M8 146 aa6.46□□□□□ -1.38
SRPRB-202ENST00000466636 DNAH9Q9NYC9 4486 aa6.46□□□□□ -1.38
SRPRB-202ENST00000466636 A0A0J9YXY3 114 aa6.45□□□□□ -1.38
SRPRB-202ENST00000466636 CD164L2Q6UWJ8 174 aa6.45□□□□□ -1.38
SRPRB-202ENST00000466636 SCGB1D4Q6XE38 83 aa6.45□□□□□ -1.38
SRPRB-202ENST00000466636 C5orf38Q86SI9 138 aa6.45□□□□□ -1.38
SRPRB-202ENST00000466636 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
SRPRB-202ENST00000466636 DNAH10OSP0CZ25 163 aa6.44□□□□□ -1.38
SRPRB-202ENST00000466636 FOXI1Q12951 378 aa6.44□□□□□ -1.38
SRPRB-202ENST00000466636 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa6.44□□□□□ -1.38
SRPRB-202ENST00000466636 CEND1Q8N111 149 aa6.44□□□□□ -1.38
SRPRB-202ENST00000466636 ORAOV1Q8WV07 137 aa6.44□□□□□ -1.38
SRPRB-202ENST00000466636 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
SRPRB-202ENST00000466636 TM2D2Q9BX73 214 aa6.44□□□□□ -1.38
SRPRB-202ENST00000466636 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa6.43□□□□□ -1.38
SRPRB-202ENST00000466636 GAGE12HA6NDE8 117 aa6.43□□□□□ -1.38
SRPRB-202ENST00000466636 GCSHP23434 173 aa6.43□□□□□ -1.38
SRPRB-202ENST00000466636 FXYD2P54710 66 aa6.43□□□□□ -1.38
SRPRB-202ENST00000466636 CCL18P55774 89 aa6.43□□□□□ -1.38
SRPRB-202ENST00000466636 COX7B2Q8TF08 81 aa6.43□□□□□ -1.38
SRPRB-202ENST00000466636 UBE2WQ96B02 151 aa6.43□□□□□ -1.38
SRPRB-202ENST00000466636 HIST1H4GQ99525 98 aa6.43□□□□□ -1.38
SRPRB-202ENST00000466636 LITAFQ99732 161 aa6.43□□□□□ -1.38
SRPRB-202ENST00000466636 UPK3BQ9BT76 320 aa6.43□□□□□ -1.38
SRPRB-202ENST00000466636 APLNQ9ULZ1 77 aa6.43□□□□□ -1.38
SRPRB-202ENST00000466636 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa6.42□□□□□ -1.38
SRPRB-202ENST00000466636 K7EP13 123 aa6.42□□□□□ -1.38
SRPRB-202ENST00000466636 COX7A2LO14548 114 aa6.42□□□□□ -1.38
SRPRB-202ENST00000466636 CRPP02741 224 aa6.42□□□□□ -1.38
SRPRB-202ENST00000466636 MIAQ16674 131 aa6.42□□□□□ -1.38
SRPRB-202ENST00000466636 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.42□□□□□ -1.38
SRPRB-202ENST00000466636 Q9H8V8 135 aa6.42□□□□□ -1.38
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