RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299162.9

FOXN4-201, Transcript of forkhead box N4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FOXN4, Length 3,350 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN4-201ENST00000299162 Q6ZTI0 123 aa7.32□□□□□ -1.24
FOXN4-201ENST00000299162 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
FOXN4-201ENST00000299162 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
FOXN4-201ENST00000299162 Q8N2B8 174 aa7.31□□□□□ -1.24
FOXN4-201ENST00000299162 COX6CP09669 75 aa7.31□□□□□ -1.24
FOXN4-201ENST00000299162 C3orf22Q8N5N4 141 aa7.31□□□□□ -1.24
FOXN4-201ENST00000299162 A0A1B0GX51 115 aa7.31□□□□□ -1.24
FOXN4-201ENST00000299162 Q5XG85 94 aa7.31□□□□□ -1.24
FOXN4-201ENST00000299162 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa7.31□□□□□ -1.24
FOXN4-201ENST00000299162 SEC61GP60059 68 aa7.3□□□□□ -1.24
FOXN4-201ENST00000299162 KRTAP1-1Q07627 177 aa7.3□□□□□ -1.24
FOXN4-201ENST00000299162 C20orf203Q8NBC4 194 aa7.3□□□□□ -1.24
FOXN4-201ENST00000299162 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
FOXN4-201ENST00000299162 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
FOXN4-201ENST00000299162 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa7.3□□□□□ -1.24
FOXN4-201ENST00000299162 TRGV2A0A075B6R0 118 aa7.29□□□□□ -1.24
FOXN4-201ENST00000299162 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa7.29□□□□□ -1.24
FOXN4-201ENST00000299162 C1orf158Q8N1D5 194 aa7.29□□□□□ -1.24
FOXN4-201ENST00000299162 POM121L12Q8N7R1 296 aa7.29□□□□□ -1.24
FOXN4-201ENST00000299162 DSCR8Q96T75 97 aa7.29□□□□□ -1.24
FOXN4-201ENST00000299162 LINC00467Q9BRT7 94 aa7.29□□□□□ -1.24
FOXN4-201ENST00000299162 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa7.28□□□□□ -1.24
FOXN4-201ENST00000299162 TIMM21Q9BVV7 248 aa7.28□□□□□ -1.24
FOXN4-201ENST00000299162 ICOSQ9Y6W8 199 aa7.28□□□□□ -1.24
FOXN4-201ENST00000299162 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa7.28□□□□□ -1.24
FOXN4-201ENST00000299162 H7C423 109 aa7.28□□□□□ -1.24
FOXN4-201ENST00000299162 INAFM1C9JVW0 142 aa7.28□□□□□ -1.24
FOXN4-201ENST00000299162 DEFB130BP0DP73 79 aa7.28□□□□□ -1.24
FOXN4-201ENST00000299162 DEFB130AP0DP74 79 aa7.28□□□□□ -1.24
FOXN4-201ENST00000299162 MRAPQ8TCY5 172 aa7.28□□□□□ -1.24
FOXN4-201ENST00000299162 TMEM141Q96I45 108 aa7.28□□□□□ -1.24
FOXN4-201ENST00000299162 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
FOXN4-201ENST00000299162 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.24
FOXN4-201ENST00000299162 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa7.27□□□□□ -1.25
FOXN4-201ENST00000299162 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa7.27□□□□□ -1.25
FOXN4-201ENST00000299162 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa7.27□□□□□ -1.25
FOXN4-201ENST00000299162 C11orf72Q8NBR9 251 aa7.27□□□□□ -1.25
FOXN4-201ENST00000299162 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
FOXN4-201ENST00000299162 A0A0J9YXY3 114 aa7.27□□□□□ -1.25
FOXN4-201ENST00000299162 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa7.27□□□□□ -1.25
FOXN4-201ENST00000299162 hADV29S1A0JD25 119 aa7.27□□□□□ -1.25
FOXN4-201ENST00000299162 DEFB4AO15263 64 aa7.27□□□□□ -1.25
FOXN4-201ENST00000299162 TIMM17AQ99595 171 aa7.27□□□□□ -1.25
FOXN4-201ENST00000299162 NDUFA12Q9UI09 145 aa7.27□□□□□ -1.25
FOXN4-201ENST00000299162 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa7.26□□□□□ -1.25
FOXN4-201ENST00000299162 GAGE2AQ6NT46 116 aa7.26□□□□□ -1.25
FOXN4-201ENST00000299162 LINC00526Q96FQ7 95 aa7.26□□□□□ -1.25
FOXN4-201ENST00000299162 SPATA3Q8NHX4 192 aa7.26□□□□□ -1.25
FOXN4-201ENST00000299162 A0A096LPF7 62 aa7.26□□□□□ -1.25
FOXN4-201ENST00000299162 MGAM2Q2M2H8 2515 aa7.25□□□□□ -1.25
FOXN4-201ENST00000299162 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa7.25□□□□□ -1.25
FOXN4-201ENST00000299162 UQCRQO14949 82 aa7.25□□□□□ -1.25
FOXN4-201ENST00000299162 LY6G6DO95868 133 aa7.25□□□□□ -1.25
FOXN4-201ENST00000299162 DPH3Q96FX2 82 aa7.25□□□□□ -1.25
FOXN4-201ENST00000299162 LEPROTO15243 131 aa7.25□□□□□ -1.25
FOXN4-201ENST00000299162 RPS28P62857 69 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
FOXN4-201ENST00000299162 RHOHQ15669 191 aa7.25□□□□□ -1.25
FOXN4-201ENST00000299162 TMEM86BQ8N661 226 aa7.25□□□□□ -1.25
FOXN4-201ENST00000299162 LINC00482Q8N8I6 264 aa7.25□□□□□ -1.25
FOXN4-201ENST00000299162 BAHCC1Q9P281 2608 aa7.25□□□□□ -1.25
FOXN4-201ENST00000299162 STAB1Q9NY15 2570 aa7.24□□□□□ -1.25
FOXN4-201ENST00000299162 LINC00336Q6ZUF6 198 aa7.24□□□□□ -1.25
FOXN4-201ENST00000299162 AMELXQ99217 191 aa7.24□□□□□ -1.25
FOXN4-201ENST00000299162 NOTCH1P46531 2555 aa7.24□□□□□ -1.25
FOXN4-201ENST00000299162 TMEM223A0PJW6 202 aa7.24□□□□□ -1.25
FOXN4-201ENST00000299162 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
FOXN4-201ENST00000299162 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa7.23□□□□□ -1.25
FOXN4-201ENST00000299162 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa7.23□□□□□ -1.25
FOXN4-201ENST00000299162 COL6A5A8TX70 2615 aa7.23□□□□□ -1.25
FOXN4-201ENST00000299162 CHCHD7Q9BUK0 85 aa7.23□□□□□ -1.25
FOXN4-201ENST00000299162 A0A0B4J2C4 111 aa7.22□□□□□ -1.25
FOXN4-201ENST00000299162 KRTAP10-3P60369 221 aa7.22□□□□□ -1.25
FOXN4-201ENST00000299162 Q9HAA7 133 aa7.22□□□□□ -1.25
FOXN4-201ENST00000299162 TOMM7Q9P0U1 55 aa7.22□□□□□ -1.25
FOXN4-201ENST00000299162 HILS1P60008 231 aa7.22□□□□□ -1.25
FOXN4-201ENST00000299162 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa7.22□□□□□ -1.25
FOXN4-201ENST00000299162 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa7.22□□□□□ -1.25
FOXN4-201ENST00000299162 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
FOXN4-201ENST00000299162 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
FOXN4-201ENST00000299162 C2orf48Q96LS8 159 aa7.21□□□□□ -1.25
FOXN4-201ENST00000299162 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa7.21□□□□□ -1.25
FOXN4-201ENST00000299162 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa7.21□□□□□ -1.26
FOXN4-201ENST00000299162 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
FOXN4-201ENST00000299162 A0A0U1RQV1 116 aa7.2□□□□□ -1.26
FOXN4-201ENST00000299162 COX6A2Q02221 97 aa7.2□□□□□ -1.26
FOXN4-201ENST00000299162 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa7.2□□□□□ -1.26
FOXN4-201ENST00000299162 UBE2L6O14933 153 aa7.2□□□□□ -1.26
FOXN4-201ENST00000299162 CLPSL2Q6UWE3 100 aa7.2□□□□□ -1.26
FOXN4-201ENST00000299162 SMCR5Q8TEV8 140 aa7.2□□□□□ -1.26
FOXN4-201ENST00000299162 FAM104AQ969W3 186 aa7.2□□□□□ -1.26
FOXN4-201ENST00000299162 K7EQD1 137 aa7.19□□□□□ -1.26
FOXN4-201ENST00000299162 IGLV1-51P01701 117 aa7.19□□□□□ -1.26
FOXN4-201ENST00000299162 COX7CP15954 63 aa7.19□□□□□ -1.26
FOXN4-201ENST00000299162 MALP21145 153 aa7.19□□□□□ -1.26
FOXN4-201ENST00000299162 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
FOXN4-201ENST00000299162 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
FOXN4-201ENST00000299162 SDIM1Q6ZPB5 146 aa7.19□□□□□ -1.26
FOXN4-201ENST00000299162 PRO0628Q9UI54 55 aa7.19□□□□□ -1.26
FOXN4-201ENST00000299162 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa7.19□□□□□ -1.26
FOXN4-201ENST00000299162 FAM236CP0DP71 79 aa7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms