RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567780.1

HOXC-AS3-204, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

Gene HOXC-AS3, Length 2,816 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-204ENST00000567780 Q1RN00 199 aa8.95□□□□□ -0.98
HOXC-AS3-204ENST00000567780 BEAN1Q3B7T3 259 aa8.95□□□□□ -0.98
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NDUFA12Q9UI09 145 aa8.95□□□□□ -0.98
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TENM4Q6N022 2769 aa8.94□□□□□ -0.98
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa8.94□□□□□ -0.98
HOXC-AS3-204ENST00000567780 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
HOXC-AS3-204ENST00000567780 Q6ZTI0 123 aa8.94□□□□□ -0.98
HOXC-AS3-204ENST00000567780 WFDC10AQ9H1F0 79 aa8.94□□□□□ -0.98
HOXC-AS3-204ENST00000567780 YAE1D1Q9NRH1 226 aa8.94□□□□□ -0.98
HOXC-AS3-204ENST00000567780 DNAJC30Q96LL9 226 aa8.94□□□□□ -0.98
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ITPR2Q14571 2701 aa8.93□□□□□ -0.98
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa8.93□□□□□ -0.98
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SPATA25Q9BR10 227 aa8.93□□□□□ -0.98
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ERG28Q9UKR5 140 aa8.93□□□□□ -0.98
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TRAV25A0A0B4J276 109 aa8.93□□□□□ -0.98
HOXC-AS3-204ENST00000567780 FHL3Q13643 280 aa8.93□□□□□ -0.98
HOXC-AS3-204ENST00000567780 VSIG2Q96IQ7 327 aa8.93□□□□□ -0.98
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa8.92□□□□□ -0.98
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IGHV3-33P01772 117 aa8.92□□□□□ -0.98
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa8.92□□□□□ -0.98
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TEX29Q8N6K0 151 aa8.92□□□□□ -0.98
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LINC01006Q8NI28 216 aa8.91□□□□□ -0.98
HOXC-AS3-204ENST00000567780 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa8.91□□□□□ -0.98
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa8.91□□□□□ -0.98
HOXC-AS3-204ENST00000567780 GAGE12JA6NER3 117 aa8.91□□□□□ -0.98
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NDUFA7O95182 113 aa8.91□□□□□ -0.98
HOXC-AS3-204ENST00000567780 GAGE4Q13068 117 aa8.91□□□□□ -0.98
HOXC-AS3-204ENST00000567780 GAGE5Q13069 117 aa8.91□□□□□ -0.98
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LINC00694P0DN24 101 aa8.9□□□□□ -0.98
HOXC-AS3-204ENST00000567780 FOXI1Q12951 378 aa8.9□□□□□ -0.98
HOXC-AS3-204ENST00000567780 DAND5Q8N907 189 aa8.9□□□□□ -0.98
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LITAFQ99732 161 aa8.9□□□□□ -0.98
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa8.9□□□□□ -0.99
HOXC-AS3-204ENST00000567780 A0A0B4J2C4 111 aa8.9□□□□□ -0.99
HOXC-AS3-204ENST00000567780 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.99
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NOTCH2Q04721 2471 aa8.89□□□□□ -0.99
HOXC-AS3-204ENST00000567780 K7EQD1 137 aa8.89□□□□□ -0.99
HOXC-AS3-204ENST00000567780 COX6A2Q02221 97 aa8.89□□□□□ -0.99
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RNF183Q96D59 192 aa8.89□□□□□ -0.99
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TRGV2A0A075B6R0 118 aa8.88□□□□□ -0.99
HOXC-AS3-204ENST00000567780 A0A0U1RRA0 63 aa8.88□□□□□ -0.99
HOXC-AS3-204ENST00000567780 C9JAW5 83 aa8.88□□□□□ -0.99
HOXC-AS3-204ENST00000567780 GAGE7O76087 117 aa8.88□□□□□ -0.99
HOXC-AS3-204ENST00000567780 GAGE12FP0CL80 117 aa8.88□□□□□ -0.99
HOXC-AS3-204ENST00000567780 GAGE12GP0CL81 117 aa8.88□□□□□ -0.99
HOXC-AS3-204ENST00000567780 GAGE12IP0CL82 117 aa8.88□□□□□ -0.99
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CITED1Q99966 193 aa8.88□□□□□ -0.99
HOXC-AS3-204ENST00000567780 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TMEM101Q96IK0 257 aa8.88□□□□□ -0.99
HOXC-AS3-204ENST00000567780 FN1P02751 2386 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PLA2G2AP14555 144 aa8.87□□□□□ -0.99
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SMIM20Q8N5G0 67 aa8.87□□□□□ -0.99
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IL17DQ8TAD2 202 aa8.87□□□□□ -0.99
HOXC-AS3-204ENST00000567780 GAGE6Q13070 117 aa8.87□□□□□ -0.99
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ZFAND6Q6FIF0 208 aa8.87□□□□□ -0.99
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa8.87□□□□□ -0.99
HOXC-AS3-204ENST00000567780 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
HOXC-AS3-204ENST00000567780 KRTAP1-1Q07627 177 aa8.86□□□□□ -0.99
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MIAQ16674 131 aa8.86□□□□□ -0.99
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TEN1Q86WV5 123 aa8.86□□□□□ -0.99
HOXC-AS3-204ENST00000567780 HIVEP2P31629 2446 aa8.86□□□□□ -0.99
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TRAV4A0A0B4J268 109 aa8.86□□□□□ -0.99
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LINC00242Q5T6M2 205 aa8.86□□□□□ -0.99
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ANKRD29Q8N6D5 301 aa8.86□□□□□ -0.99
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa8.86□□□□□ -0.99
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SLC25A20O43772 301 aa8.86□□□□□ -0.99
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa8.86□□□□□ -0.99
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PDZD2O15018 2839 aa8.85□□□□□ -0.99
HOXC-AS3-204ENST00000567780 FASNP49327 2511 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TRIAP1O43715 76 aa8.85□□□□□ -0.99
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TIRAPP58753 221 aa8.85□□□□□ -0.99
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CARD19Q96LW7 228 aa8.85□□□□□ -0.99
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SPANXDQ9BXN6 97 aa8.85□□□□□ -0.99
HOXC-AS3-204ENST00000567780 Q9H8V8 135 aa8.85□□□□□ -0.99
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SPANXCQ9NY87 97 aa8.85□□□□□ -0.99
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa8.85□□□□□ -0.99
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
HOXC-AS3-204ENST00000567780 HERVK_113P63121 156 aa8.85□□□□□ -0.99
HOXC-AS3-204ENST00000567780 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
HOXC-AS3-204ENST00000567780 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PPDPFLQ8WWR9 84 aa8.85□□□□□ -0.99
HOXC-AS3-204ENST00000567780 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
HOXC-AS3-204ENST00000567780 B5MCH6 92 aa8.84□□□□□ -0.99
HOXC-AS3-204ENST00000567780 UBE2L6O14933 153 aa8.84□□□□□ -0.99
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa8.84□□□□□ -0.99
HOXC-AS3-204ENST00000567780 UNC79Q9P2D8 2635 aa8.83□□□□□ -1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa8.83□□□□□ -1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa8.83□□□□□ -1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NDUFA1O15239 70 aa8.83□□□□□ -1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IGLV1-51P01701 117 aa8.83□□□□□ -1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ATXN8Q156A1 80 aa8.83□□□□□ -1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 C16orf74Q96GX8 76 aa8.83□□□□□ -1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.6 ms