RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM89A2RUT3 159 aa7.45□□□□□ -1.22
TRPS1-211ENST00000520276 CCL24O00175 119 aa7.45□□□□□ -1.22
TRPS1-211ENST00000520276 MUC4Q99102 2169 aa7.45□□□□□ -1.22
TRPS1-211ENST00000520276 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa7.45□□□□□ -1.22
TRPS1-211ENST00000520276 RPS28P62857 69 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
TRPS1-211ENST00000520276 NDPQ00604 133 aa7.45□□□□□ -1.22
TRPS1-211ENST00000520276 RHOHQ15669 191 aa7.45□□□□□ -1.22
TRPS1-211ENST00000520276 DPH3Q96FX2 82 aa7.45□□□□□ -1.22
TRPS1-211ENST00000520276 UBE2E2Q96LR5 201 aa7.45□□□□□ -1.22
TRPS1-211ENST00000520276 CRYGAP11844 174 aa7.45□□□□□ -1.22
TRPS1-211ENST00000520276 DEFB1P60022 68 aa7.45□□□□□ -1.22
TRPS1-211ENST00000520276 LITAFQ99732 161 aa7.45□□□□□ -1.22
TRPS1-211ENST00000520276 LEPROTO15243 131 aa7.44□□□□□ -1.22
TRPS1-211ENST00000520276 C16orf95Q9H693 158 aa7.44□□□□□ -1.22
TRPS1-211ENST00000520276 JPT2Q9H910 190 aa7.44□□□□□ -1.22
TRPS1-211ENST00000520276 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa7.44□□□□□ -1.22
TRPS1-211ENST00000520276 S100A4P26447 101 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
TRPS1-211ENST00000520276 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa7.44□□□□□ -1.22
TRPS1-211ENST00000520276 SYNJ2BPP57105 145 aa7.44□□□□□ -1.22
TRPS1-211ENST00000520276 DEFB136Q30KP8 78 aa7.43□□□□□ -1.22
TRPS1-211ENST00000520276 Q5XG85 94 aa7.43□□□□□ -1.22
TRPS1-211ENST00000520276 LINC00643Q86TS7 51 aa7.43□□□□□ -1.22
TRPS1-211ENST00000520276 NACAE9PAV3 2078 aa7.43□□□□□ -1.22
TRPS1-211ENST00000520276 RNF152Q8N8N0 203 aa7.43□□□□□ -1.22
TRPS1-211ENST00000520276 COX6CP09669 75 aa7.43□□□□□ -1.22
TRPS1-211ENST00000520276 A0A0J9YXV3 536 aa7.42□□□□□ -1.22
TRPS1-211ENST00000520276 GNRH2O43555 120 aa7.42□□□□□ -1.22
TRPS1-211ENST00000520276 BUB3O43684 328 aa7.42□□□□□ -1.22
TRPS1-211ENST00000520276 DCANP1Q8TF63 244 aa7.42□□□□□ -1.22
TRPS1-211ENST00000520276 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
TRPS1-211ENST00000520276 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa7.42□□□□□ -1.22
TRPS1-211ENST00000520276 C5orf38Q86SI9 138 aa7.42□□□□□ -1.22
TRPS1-211ENST00000520276 FAM19A4Q96LR4 140 aa7.42□□□□□ -1.22
TRPS1-211ENST00000520276 A8MZ25 164 aa7.42□□□□□ -1.22
TRPS1-211ENST00000520276 C10orf99Q6UWK7 81 aa7.42□□□□□ -1.22
TRPS1-211ENST00000520276 DAND5Q8N907 189 aa7.42□□□□□ -1.22
TRPS1-211ENST00000520276 TIMM17AQ99595 171 aa7.42□□□□□ -1.22
TRPS1-211ENST00000520276 TRACP01848 142 aa7.41□□□□□ -1.22
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM141Q96I45 108 aa7.41□□□□□ -1.22
TRPS1-211ENST00000520276 A0A087WWL8 130 aa7.41□□□□□ -1.22
TRPS1-211ENST00000520276 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
TRPS1-211ENST00000520276 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa7.41□□□□□ -1.22
TRPS1-211ENST00000520276 PROK1P58294 105 aa7.41□□□□□ -1.22
TRPS1-211ENST00000520276 LINC00315P59091 139 aa7.41□□□□□ -1.22
TRPS1-211ENST00000520276 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa7.4□□□□□ -1.22
TRPS1-211ENST00000520276 C4orf3Q8WVX3 66 aa7.4□□□□□ -1.22
TRPS1-211ENST00000520276 TIMM21Q9BVV7 248 aa7.4□□□□□ -1.22
TRPS1-211ENST00000520276 ZFAND3Q9H8U3 227 aa7.4□□□□□ -1.22
TRPS1-211ENST00000520276 BSNQ9UPA5 3926 aa7.4□□□□□ -1.22
TRPS1-211ENST00000520276 ACYP1P07311 99 aa7.4□□□□□ -1.22
TRPS1-211ENST00000520276 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
TRPS1-211ENST00000520276 SDHAF1A6NFY7 115 aa7.4□□□□□ -1.23
TRPS1-211ENST00000520276 SDIM1Q6ZPB5 146 aa7.4□□□□□ -1.23
TRPS1-211ENST00000520276 PRIMA1Q86XR5 153 aa7.4□□□□□ -1.23
TRPS1-211ENST00000520276 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
TRPS1-211ENST00000520276 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
TRPS1-211ENST00000520276 SUMO4Q6EEV6 95 aa7.39□□□□□ -1.23
TRPS1-211ENST00000520276 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM61Q8N0U2 210 aa7.39□□□□□ -1.23
TRPS1-211ENST00000520276 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
TRPS1-211ENST00000520276 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
TRPS1-211ENST00000520276 ATP5G1P05496 136 aa7.39□□□□□ -1.23
TRPS1-211ENST00000520276 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
TRPS1-211ENST00000520276 C20orf173Q96LM9 149 aa7.39□□□□□ -1.23
TRPS1-211ENST00000520276 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa7.39□□□□□ -1.23
TRPS1-211ENST00000520276 SLURP1P55000 103 aa7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-211ENST00000520276 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-211ENST00000520276 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-211ENST00000520276 A0A087WW49 117 aa7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-211ENST00000520276 F5H697 171 aa7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-211ENST00000520276 C9orf66Q5T8R8 295 aa7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-211ENST00000520276 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-211ENST00000520276 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-211ENST00000520276 PSMB8P28062 276 aa7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-211ENST00000520276 Q8N2B8 174 aa7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-211ENST00000520276 C22orf24Q9Y442 160 aa7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-211ENST00000520276 A0A087WVE0 104 aa7.37□□□□□ -1.23
TRPS1-211ENST00000520276 A0A0J9YX75 114 aa7.37□□□□□ -1.23
TRPS1-211ENST00000520276 VCYO14598 125 aa7.37□□□□□ -1.23
TRPS1-211ENST00000520276 LINC00477Q96M19 166 aa7.37□□□□□ -1.23
TRPS1-211ENST00000520276 FBN2P35556 2912 aa7.37□□□□□ -1.23
TRPS1-211ENST00000520276 TIRAPP58753 221 aa7.37□□□□□ -1.23
TRPS1-211ENST00000520276 NDUFA4O00483 81 aa7.37□□□□□ -1.23
TRPS1-211ENST00000520276 NXPH4O95158 308 aa7.37□□□□□ -1.23
TRPS1-211ENST00000520276 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
TRPS1-211ENST00000520276 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
TRPS1-211ENST00000520276 UPK3BQ9BT76 320 aa7.37□□□□□ -1.23
TRPS1-211ENST00000520276 ATOX1O00244 68 aa7.37□□□□□ -1.23
TRPS1-211ENST00000520276 CXCL5P42830 114 aa7.37□□□□□ -1.23
TRPS1-211ENST00000520276 MIAQ16674 131 aa7.37□□□□□ -1.23
TRPS1-211ENST00000520276 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa7.37□□□□□ -1.23
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM258P61165 79 aa7.36□□□□□ -1.23
TRPS1-211ENST00000520276 FAM74A4Q5TZK3 123 aa7.36□□□□□ -1.23
TRPS1-211ENST00000520276 C16orf92Q96LL3 132 aa7.36□□□□□ -1.23
TRPS1-211ENST00000520276 COL6A5A8TX70 2615 aa7.36□□□□□ -1.23
TRPS1-211ENST00000520276 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
TRPS1-211ENST00000520276 F6UB75 175 aa7.36□□□□□ -1.23
TRPS1-211ENST00000520276 PPP1R17O96001 155 aa7.36□□□□□ -1.23
TRPS1-211ENST00000520276 IGLV1-40P01703 118 aa7.36□□□□□ -1.23
TRPS1-211ENST00000520276 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa7.36□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms