RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516042.1

RNU6-772P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 772, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-772P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-772P-201ENST00000516042 DYDC1Q8WWB3 177 aa-3.75□□□□□ -3.01
RNU6-772P-201ENST00000516042 SHANK2Q9UPX8 1470 aa-3.75□□□□□ -3.01
RNU6-772P-201ENST00000516042 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP-3.75□□□□□ -3.01
RNU6-772P-201ENST00000516042 S100A5P33763 92 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-772P-201ENST00000516042 CCL7P80098 99 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-772P-201ENST00000516042 MYO9AB2RTY4 2548 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-772P-201ENST00000516042 YPEL1O60688 119 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-772P-201ENST00000516042 UBE2G1P62253 170 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-772P-201ENST00000516042 SCIMPQ6UWF3 145 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-772P-201ENST00000516042 HRCT1Q6UXD1 115 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-772P-201ENST00000516042 BAGE2Q86Y30 109 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-772P-201ENST00000516042 FAM24BQ8N5W8 94 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-772P-201ENST00000516042 PTMSP20962 102 aa-3.78□□□□□ -3.01
RNU6-772P-201ENST00000516042 SPANXN1Q5VSR9 72 aa-3.78□□□□□ -3.01
RNU6-772P-201ENST00000516042 TMED4Q7Z7H5 227 aa-3.78□□□□□ -3.01
RNU6-772P-201ENST00000516042 OR13C6PQ8NH95 151 aa-3.78□□□□□ -3.01
RNU6-772P-201ENST00000516042 GINS3Q9BRX5 216 aa-3.78□□□□□ -3.01
RNU6-772P-201ENST00000516042 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa-3.78□□□□□ -3.01
RNU6-772P-201ENST00000516042 PATJQ8NI35 1801 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-772P-201ENST00000516042 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-772P-201ENST00000516042 UQCR11O14957 56 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-772P-201ENST00000516042 E2F6O75461 281 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-772P-201ENST00000516042 TPM3P06753 285 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-772P-201ENST00000516042 RPL7P18124 248 aaKnown RBP-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-772P-201ENST00000516042 DCUN1D2Q6PH85 259 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-772P-201ENST00000516042 V9GYH0 126 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-772P-201ENST00000516042 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP-3.8□□□□□ -3.02
RNU6-772P-201ENST00000516042 APOC3P02656 99 aa-3.8□□□□□ -3.02
RNU6-772P-201ENST00000516042 SPTSSBQ8NFR3 76 aa-3.8□□□□□ -3.02
RNU6-772P-201ENST00000516042 MED31Q9Y3C7 131 aa-3.8□□□□□ -3.02
RNU6-772P-201ENST00000516042 PXDNQ92626 1479 aa-3.8□□□□□ -3.02
RNU6-772P-201ENST00000516042 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-772P-201ENST00000516042 TPPP2P59282 170 aa-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-772P-201ENST00000516042 CRIPTQ9P021 101 aa-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-772P-201ENST00000516042 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-772P-201ENST00000516042 KNDC1Q76NI1 1749 aa-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-772P-201ENST00000516042 E7EQ34 232 aa-3.82□□□□□ -3.02
RNU6-772P-201ENST00000516042 CLLU1Q5K131 121 aa-3.82□□□□□ -3.02
RNU6-772P-201ENST00000516042 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP-3.82□□□□□ -3.02
RNU6-772P-201ENST00000516042 IFNA1P01562 189 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-772P-201ENST00000516042 HLA-DRB4P13762 266 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-772P-201ENST00000516042 CCL8P80075 99 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-772P-201ENST00000516042 DEFB110Q30KQ9 67 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-772P-201ENST00000516042 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-772P-201ENST00000516042 S4R3F8 94 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-772P-201ENST00000516042 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-772P-201ENST00000516042 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-772P-201ENST00000516042 BPTFQ12830 3046 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-772P-201ENST00000516042 I3L3M4 83 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-772P-201ENST00000516042 TPM4P67936 248 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-772P-201ENST00000516042 WFDC13Q8IUB5 93 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-772P-201ENST00000516042 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-772P-201ENST00000516042 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-772P-201ENST00000516042 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-772P-201ENST00000516042 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP-3.85□□□□□ -3.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 ADCY9O60503 1353 aa-3.85□□□□□ -3.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 SMIM24O75264 130 aa-3.85□□□□□ -3.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 AKAP14Q86UN6 197 aa-3.85□□□□□ -3.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 CCDC32Q9BV29 185 aa-3.85□□□□□ -3.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa-3.85□□□□□ -3.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 LENEPQ9Y5L5 61 aa-3.85□□□□□ -3.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP-3.86□□□□□ -3.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa-3.86□□□□□ -3.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 C10orf113Q5VZT2 155 aa-3.86□□□□□ -3.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 HEPN1Q6WQI6 88 aa-3.86□□□□□ -3.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 TLN2Q9Y4G6 2542 aa-3.86□□□□□ -3.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 NIPSNAP2O75323 286 aa-3.87□□□□□ -3.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 CBLN1P23435 193 aa-3.87□□□□□ -3.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 B2MP61769 119 aa-3.87□□□□□ -3.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 LELP1Q5T871 98 aa-3.87□□□□□ -3.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa-3.87□□□□□ -3.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa-3.87□□□□□ -3.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 ZFHX3Q15911 3703 aa-3.87□□□□□ -3.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa-3.88□□□□□ -3.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 FAM107AO95990 144 aa-3.88□□□□□ -3.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 GNG3P63215 75 aa-3.88□□□□□ -3.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 CALML5Q9NZT1 146 aa-3.88□□□□□ -3.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP-3.88□□□□□ -3.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP-3.88□□□□□ -3.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 ITPR2Q14571 2701 aa-3.88□□□□□ -3.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 KDM5CP41229 1560 aa-3.89□□□□□ -3.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 ERCC6Q03468 1493 aa-3.89□□□□□ -3.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa-3.89□□□□□ -3.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 SIX6O95475 246 aa-3.89□□□□□ -3.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP-3.89□□□□□ -3.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 BTG2P78543 158 aa-3.89□□□□□ -3.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 C10orf128Q5T292 105 aa-3.89□□□□□ -3.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa-3.89□□□□□ -3.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 SMIM20Q8N5G0 67 aa-3.89□□□□□ -3.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 DISP2A7MBM2 1401 aa-3.89□□□□□ -3.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 ARHGEF10O15013 1369 aa-3.89□□□□□ -3.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 MYH13Q9UKX3 1938 aa-3.89□□□□□ -3.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 TCTAP57738 103 aa-3.9□□□□□ -3.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 RPS28P62857 69 aaKnown RBP-3.9□□□□□ -3.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 FDCSPQ8NFU4 85 aa-3.9□□□□□ -3.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 IGLC7A0M8Q6 106 aa-3.91□□□□□ -3.04
RNU6-772P-201ENST00000516042 DAPK1P53355 1430 aa-3.91□□□□□ -3.04
RNU6-772P-201ENST00000516042 STX12Q86Y82 276 aa-3.91□□□□□ -3.04
RNU6-772P-201ENST00000516042 CCDC141Q6ZP82 1450 aa-3.92□□□□□ -3.04
RNU6-772P-201ENST00000516042 NWD2Q9ULI1 1742 aa-3.92□□□□□ -3.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.2 ms