RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409093.1

LRRTM4-202, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene LRRTM4, Length 2,247 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-202ENST00000409093 SMIM2Q9BVW6 85 aa7.31□□□□□ -1.24
LRRTM4-202ENST00000409093 F5H697 171 aa7.31□□□□□ -1.24
LRRTM4-202ENST00000409093 F8P00451 2351 aa7.31□□□□□ -1.24
LRRTM4-202ENST00000409093 FCER1GP30273 86 aa7.31□□□□□ -1.24
LRRTM4-202ENST00000409093 LINC00315P59091 139 aa7.31□□□□□ -1.24
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF876PQ49A33 203 aa7.31□□□□□ -1.24
LRRTM4-202ENST00000409093 GAGE2AQ6NT46 116 aa7.31□□□□□ -1.24
LRRTM4-202ENST00000409093 POM121L12Q8N7R1 296 aa7.31□□□□□ -1.24
LRRTM4-202ENST00000409093 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa7.31□□□□□ -1.24
LRRTM4-202ENST00000409093 PPP1R17O96001 155 aa7.3□□□□□ -1.24
LRRTM4-202ENST00000409093 LAGE3Q14657 143 aa7.3□□□□□ -1.24
LRRTM4-202ENST00000409093 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-202ENST00000409093 TMEM158Q8WZ71 300 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-202ENST00000409093 IFI27L1Q96BM0 104 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-202ENST00000409093 XCL2Q9UBD3 114 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-202ENST00000409093 A8MWV9 139 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-202ENST00000409093 PRM2P04554 102 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF56Q15929 161 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-202ENST00000409093 SUMO4Q6EEV6 95 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-202ENST00000409093 SBSPONQ8IVN8 264 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-202ENST00000409093 NOTCH3Q9UM47 2321 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-202ENST00000409093 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
LRRTM4-202ENST00000409093 LINC00482Q8N8I6 264 aa7.28□□□□□ -1.24
LRRTM4-202ENST00000409093 C2orf48Q96LS8 159 aa7.28□□□□□ -1.24
LRRTM4-202ENST00000409093 TTTY13Q9BZ97 58 aa7.28□□□□□ -1.24
LRRTM4-202ENST00000409093 WFDC10AQ9H1F0 79 aa7.28□□□□□ -1.24
LRRTM4-202ENST00000409093 TAL2Q16559 108 aa7.27□□□□□ -1.25
LRRTM4-202ENST00000409093 BEAN1Q3B7T3 259 aa7.27□□□□□ -1.25
LRRTM4-202ENST00000409093 ORMDL2Q53FV1 153 aa7.27□□□□□ -1.25
LRRTM4-202ENST00000409093 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
LRRTM4-202ENST00000409093 LINC00467Q9BRT7 94 aa7.27□□□□□ -1.25
LRRTM4-202ENST00000409093 RETNQ9HD89 108 aa7.27□□□□□ -1.25
LRRTM4-202ENST00000409093 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa7.27□□□□□ -1.25
LRRTM4-202ENST00000409093 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa7.27□□□□□ -1.25
LRRTM4-202ENST00000409093 ZFP2Q6ZN57 461 aa7.27□□□□□ -1.25
LRRTM4-202ENST00000409093 ATRQ13535 2644 aa7.26□□□□□ -1.25
LRRTM4-202ENST00000409093 TENM1Q9UKZ4 2725 aa7.26□□□□□ -1.25
LRRTM4-202ENST00000409093 J3QQQ9 107 aa7.26□□□□□ -1.25
LRRTM4-202ENST00000409093 PFN2P35080 140 aa7.26□□□□□ -1.25
LRRTM4-202ENST00000409093 LGALS9BQ3B8N2 356 aa7.26□□□□□ -1.25
LRRTM4-202ENST00000409093 LGALS9CQ6DKI2 356 aa7.26□□□□□ -1.25
LRRTM4-202ENST00000409093 DSCR8Q96T75 97 aa7.26□□□□□ -1.25
LRRTM4-202ENST00000409093 HHLA3Q9XRX5 114 aa7.26□□□□□ -1.25
LRRTM4-202ENST00000409093 SCGB1C2P0DMR2 95 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM4-202ENST00000409093 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
LRRTM4-202ENST00000409093 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM4-202ENST00000409093 C11orf72Q8NBR9 251 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM4-202ENST00000409093 C19orf73Q9NVV2 129 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM4-202ENST00000409093 NACAE9PAV3 2078 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM4-202ENST00000409093 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
LRRTM4-202ENST00000409093 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM4-202ENST00000409093 M0QY20 66 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM4-202ENST00000409093 PRSS1P07477 247 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM4-202ENST00000409093 CRYGAP11844 174 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM4-202ENST00000409093 C1orf158Q8N1D5 194 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM4-202ENST00000409093 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa7.24□□□□□ -1.25
LRRTM4-202ENST00000409093 SDHAF1A6NFY7 115 aa7.24□□□□□ -1.25
LRRTM4-202ENST00000409093 C4orf48Q5BLP8 95 aa7.24□□□□□ -1.25
LRRTM4-202ENST00000409093 SFTA2Q6UW10 78 aa7.24□□□□□ -1.25
LRRTM4-202ENST00000409093 ARL17AQ8IVW1 177 aa7.24□□□□□ -1.25
LRRTM4-202ENST00000409093 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa7.24□□□□□ -1.25
LRRTM4-202ENST00000409093 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa7.24□□□□□ -1.25
LRRTM4-202ENST00000409093 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa7.24□□□□□ -1.25
LRRTM4-202ENST00000409093 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa7.24□□□□□ -1.25
LRRTM4-202ENST00000409093 VCYO14598 125 aa7.24□□□□□ -1.25
LRRTM4-202ENST00000409093 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
LRRTM4-202ENST00000409093 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa7.24□□□□□ -1.25
LRRTM4-202ENST00000409093 VWFP04275 2813 aa7.23□□□□□ -1.25
LRRTM4-202ENST00000409093 A0A0U1RQV1 116 aa7.23□□□□□ -1.25
LRRTM4-202ENST00000409093 TRACP01848 142 aa7.23□□□□□ -1.25
LRRTM4-202ENST00000409093 PMVKQ15126 192 aa7.23□□□□□ -1.25
LRRTM4-202ENST00000409093 LYRM7Q5U5X0 104 aa7.23□□□□□ -1.25
LRRTM4-202ENST00000409093 CYSTM1Q9H1C7 97 aa7.23□□□□□ -1.25
LRRTM4-202ENST00000409093 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa7.23□□□□□ -1.25
LRRTM4-202ENST00000409093 H7C1H1 209 aa7.23□□□□□ -1.25
LRRTM4-202ENST00000409093 TMEM258P61165 79 aa7.23□□□□□ -1.25
LRRTM4-202ENST00000409093 C2orf66Q6UXQ4 117 aa7.23□□□□□ -1.25
LRRTM4-202ENST00000409093 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa7.23□□□□□ -1.25
LRRTM4-202ENST00000409093 TOMM6Q96B49 74 aa7.23□□□□□ -1.25
LRRTM4-202ENST00000409093 SCGB3A1Q96QR1 104 aa7.23□□□□□ -1.25
LRRTM4-202ENST00000409093 DKK2Q9UBU2 259 aa7.23□□□□□ -1.25
LRRTM4-202ENST00000409093 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa7.22□□□□□ -1.25
LRRTM4-202ENST00000409093 hADV29S1A0JD25 119 aa7.22□□□□□ -1.25
LRRTM4-202ENST00000409093 TCL1BO95988 128 aa7.22□□□□□ -1.25
LRRTM4-202ENST00000409093 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
LRRTM4-202ENST00000409093 COX7CP15954 63 aa7.22□□□□□ -1.25
LRRTM4-202ENST00000409093 C9orf66Q5T8R8 295 aa7.22□□□□□ -1.25
LRRTM4-202ENST00000409093 GTSCR1Q86UQ5 136 aa7.22□□□□□ -1.25
LRRTM4-202ENST00000409093 UBE2D3P61077 147 aa7.21□□□□□ -1.25
LRRTM4-202ENST00000409093 UBE2D2P62837 147 aa7.21□□□□□ -1.25
LRRTM4-202ENST00000409093 SPATA3Q8NHX4 192 aa7.21□□□□□ -1.25
LRRTM4-202ENST00000409093 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
LRRTM4-202ENST00000409093 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa7.21□□□□□ -1.26
LRRTM4-202ENST00000409093 HIST1H4GQ99525 98 aa7.21□□□□□ -1.26
LRRTM4-202ENST00000409093 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa7.2□□□□□ -1.26
LRRTM4-202ENST00000409093 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa7.2□□□□□ -1.26
LRRTM4-202ENST00000409093 LINC01561Q8N1V8 128 aa7.2□□□□□ -1.26
LRRTM4-202ENST00000409093 P0DMU3 169 aa7.2□□□□□ -1.26
LRRTM4-202ENST00000409093 FAM231AP0DMU4 169 aa7.2□□□□□ -1.26
LRRTM4-202ENST00000409093 FAM231CP0DMU5 169 aa7.2□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.1 ms